Protein–RNA interactions for Protein: Q05900

YHC1, U1 small nuclear ribonucleoprotein C, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 231 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YHC1Q05900 ACO2YJL200C 2370 nt8.46□□□□□ -1.06
YHC1Q05900 VMA11YPL234C 495 nt8.44□□□□□ -1.06
YHC1Q05900 PSD1YNL169C 1503 nt8.44□□□□□ -1.06
YHC1Q05900 MDM35YKL053C-A 261 nt8.43□□□□□ -1.06
YHC1Q05900 YFR036W-AYFR036W-A 651 nt8.42□□□□□ -1.06
YHC1Q05900 YPR126CYPR126C 309 nt8.42□□□□□ -1.06
YHC1Q05900 CCT5YJR064W 1689 nt8.42□□□□□ -1.06
YHC1Q05900 ADE8YDR408C 645 nt8.41□□□□□ -1.06
YHC1Q05900 TIM44YIL022W 1296 nt8.41□□□□□ -1.06
YHC1Q05900 YJL195CYJL195C 702 nt8.41□□□□□ -1.06
YHC1Q05900 YHR218WYHR218W 1812 nt8.4□□□□□ -1.06
YHC1Q05900 YJR114WYJR114W 393 nt8.4□□□□□ -1.06
YHC1Q05900 TIP1YBR067C 633 nt8.4□□□□□ -1.06
YHC1Q05900 ELO1YJL196C 933 nt8.38□□□□□ -1.07
YHC1Q05900 OPI3YJR073C 621 nt8.38□□□□□ -1.07
YHC1Q05900 YNR064CYNR064C 873 nt8.38□□□□□ -1.07
YHC1Q05900 YMR262WYMR262W 942 nt8.37□□□□□ -1.07
YHC1Q05900 CYT1YOR065W 930 nt8.37□□□□□ -1.07
YHC1Q05900 SNX3YOR357C 489 nt8.37□□□□□ -1.07
YHC1Q05900 GID7YCL039W 2238 nt8.37□□□□□ -1.07
YHC1Q05900 TVP23YDR084C 600 nt8.35□□□□□ -1.07
YHC1Q05900 RPC31YNL151C 756 nt8.35□□□□□ -1.07
YHC1Q05900 SUV3YPL029W 2214 nt8.35□□□□□ -1.07
YHC1Q05900 HXT10YFL011W 1641 nt8.35□□□□□ -1.07
YHC1Q05900 DPL1YDR294C 1770 nt8.35□□□□□ -1.07
YHC1Q05900 YMR265CYMR265C 1386 nt8.35□□□□□ -1.07
YHC1Q05900 FUN14YAL008W 597 nt8.34□□□□□ -1.07
YHC1Q05900 RIM2YBR192W 1134 nt8.34□□□□□ -1.07
YHC1Q05900 CTI6YPL181W 1521 nt8.34□□□□□ -1.08
YHC1Q05900 SPS100YHR139C 981 nt8.33□□□□□ -1.08
YHC1Q05900 IML3YBR107C 738 nt8.33□□□□□ -1.08
YHC1Q05900 KEL3YPL263C 1956 nt8.32□□□□□ -1.08
YHC1Q05900 KRR1YCL059C 951 nt8.32□□□□□ -1.08
YHC1Q05900 HAP5YOR358W 729 nt8.32□□□□□ -1.08
YHC1Q05900 SFL1YOR140W 2301 nt8.32□□□□□ -1.08
YHC1Q05900 URA8YJR103W 1737 nt8.32□□□□□ -1.08
YHC1Q05900 YEL008WYEL008W 381 nt8.31□□□□□ -1.08
YHC1Q05900 THI72YOR192C 1800 nt8.31□□□□□ -1.08
YHC1Q05900 YHL008CYHL008C 1884 nt8.28□□□□□ -1.08
YHC1Q05900 RPN14YGL004C 1254 nt8.27□□□□□ -1.09
YHC1Q05900 SWT21YNL187W 1074 nt8.27□□□□□ -1.09
YHC1Q05900 MHF1YOL086W-A 273 nt8.27□□□□□ -1.09
YHC1Q05900 AGP3YFL055W 1677 nt8.27□□□□□ -1.09
YHC1Q05900 CRC1YOR100C 984 nt8.26□□□□□ -1.09
YHC1Q05900 LEU4YNL104C 1860 nt8.26□□□□□ -1.09
YHC1Q05900 YRF1-2YER190W 5046 nt8.25□□□□□ -1.09
YHC1Q05900 ABZ2YMR289W 1125 nt8.25□□□□□ -1.09
YHC1Q05900 MET1YKR069W 1782 nt8.25□□□□□ -1.09
YHC1Q05900 snR31snR31 225 nt8.22□□□□□ -1.09
YHC1Q05900 AMF1YOR378W 1548 nt8.21□□□□□ -1.1
YHC1Q05900 PCP1YGR101W 1041 nt8.21□□□□□ -1.1
YHC1Q05900 TAF13YML098W 504 nt8.21□□□□□ -1.1
YHC1Q05900 POT1YIL160C 1254 nt8.2□□□□□ -1.1
YHC1Q05900 INH1YDL181W 258 nt8.19□□□□□ -1.1
YHC1Q05900 YKL053WYKL053W 375 nt8.19□□□□□ -1.1
YHC1Q05900 STE4YOR212W 1272 nt8.18□□□□□ -1.1
YHC1Q05900 ENO2YHR174W 1314 nt8.18□□□□□ -1.1
YHC1Q05900 YLR349WYLR349W 507 nt8.17□□□□□ -1.1
YHC1Q05900 KGD2YDR148C 1392 nt8.17□□□□□ -1.1
YHC1Q05900 tE(CUC)DtE(CUC)D 72 nt8.16□□□□□ -1.1
YHC1Q05900 tE(CUC)ItE(CUC)I 72 nt8.16□□□□□ -1.1
YHC1Q05900 YDR467CYDR467C 327 nt8.16□□□□□ -1.1
YHC1Q05900 NPP2YEL016C 1482 nt8.14□□□□□ -1.11
YHC1Q05900 GTB1YDR221W 2109 nt8.14□□□□□ -1.11
YHC1Q05900 NIF3YGL221C 867 nt8.14□□□□□ -1.11
YHC1Q05900 TPC1YGR096W 945 nt8.14□□□□□ -1.11
YHC1Q05900 NBA1YOL070C 1506 nt8.13□□□□□ -1.11
YHC1Q05900 SAN1YDR143C 1833 nt8.13□□□□□ -1.11
YHC1Q05900 GPM1YKL152C 744 nt8.12□□□□□ -1.11
YHC1Q05900 CPD1YGR247W 720 nt8.11□□□□□ -1.11
YHC1Q05900 APS2YJR058C 444 nt8.11□□□□□ -1.11
YHC1Q05900 TUB4YLR212C 1422 nt8.11□□□□□ -1.11
YHC1Q05900 THI3YDL080C 1830 nt8.1□□□□□ -1.11
YHC1Q05900 LEU2YCL018W 1095 nt8.1□□□□□ -1.11
YHC1Q05900 FET5YFL041W 1869 nt8.09□□□□□ -1.11
YHC1Q05900 GSF2YML048W 1212 nt8.09□□□□□ -1.11
YHC1Q05900 NAM8YHR086W 1572 nt8.09□□□□□ -1.11
YHC1Q05900 YMR316C-BYMR316C-B 309 nt8.08□□□□□ -1.12
YHC1Q05900 RAD51YER095W 1203 nt8.07□□□□□ -1.12
YHC1Q05900 SBP1YHL034C 885 nt8.07□□□□□ -1.12
YHC1Q05900 YBL095WYBL095W 813 nt8.07□□□□□ -1.12
YHC1Q05900 GGA2YHR108W 1758 nt8.07□□□□□ -1.12
YHC1Q05900 ESBP6YNL125C 2022 nt8.06□□□□□ -1.12
YHC1Q05900 SRP54YPR088C 1626 nt8.06□□□□□ -1.12
YHC1Q05900 NAS2YIL007C 663 nt8.05□□□□□ -1.12
YHC1Q05900 HXK1YFR053C 1458 nt8.05□□□□□ -1.12
YHC1Q05900 CDD1YLR245C 429 nt8.04□□□□□ -1.12
YHC1Q05900 ILV2YMR108W 2064 nt8.04□□□□□ -1.12
YHC1Q05900 REX2YLR059C 810 nt8.03□□□□□ -1.12
YHC1Q05900 SPE2YOL052C 1191 nt8.03□□□□□ -1.12
YHC1Q05900 MTO1YGL236C 2010 nt8.03□□□□□ -1.12
YHC1Q05900 THP3YPR045C 1413 nt8.03□□□□□ -1.12
YHC1Q05900 ALD5YER073W 1563 nt8.02□□□□□ -1.13
YHC1Q05900 ADH7YCR105W 1086 nt8.01□□□□□ -1.13
YHC1Q05900 AAT1YKL106W 1356 nt8□□□□□ -1.13
YHC1Q05900 TRP2YER090W 1524 nt8□□□□□ -1.13
YHC1Q05900 GAS1YMR307W 1680 nt8□□□□□ -1.13
YHC1Q05900 KRE1YNL322C 942 nt8□□□□□ -1.13
YHC1Q05900 YMC2YBR104W 990 nt8□□□□□ -1.13
YHC1Q05900 FSH2YMR222C 672 nt7.99□□□□□ -1.13
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 26.3 ms