Protein–RNA interactions for Protein: Q05899

YLR297W, Uncharacterized vacuolar protein YLR297W, yeastyeast

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YLR297WQ05899 SPS100YHR139C 981 nt9.42□□□□□ -0.9
YLR297WQ05899 YJR114WYJR114W 393 nt9.42□□□□□ -0.9
YLR297WQ05899 ZAP1YJL056C 2643 nt9.41□□□□□ -0.9
YLR297WQ05899 YKL133CYKL133C 1392 nt9.41□□□□□ -0.9
YLR297WQ05899 YHR219WYHR219W 1875 nt9.4□□□□□ -0.9
YLR297WQ05899 ITR2YOL103W 1830 nt9.4□□□□□ -0.9
YLR297WQ05899 YMR262WYMR262W 942 nt9.39□□□□□ -0.91
YLR297WQ05899 POT1YIL160C 1254 nt9.38□□□□□ -0.91
YLR297WQ05899 OPI3YJR073C 621 nt9.38□□□□□ -0.91
YLR297WQ05899 HEL2YDR266C 1920 nt9.37□□□□□ -0.91
YLR297WQ05899 TVP23YDR084C 600 nt9.37□□□□□ -0.91
YLR297WQ05899 LSR1LSR1 1175 nt9.37□□□□□ -0.91
YLR297WQ05899 YGL114WYGL114W 2178 nt9.37□□□□□ -0.91
YLR297WQ05899 YNR064CYNR064C 873 nt9.35□□□□□ -0.91
YLR297WQ05899 ELO1YJL196C 933 nt9.34□□□□□ -0.91
YLR297WQ05899 PAU5YFL020C 369 nt9.32□□□□□ -0.92
YLR297WQ05899 ABZ2YMR289W 1125 nt9.32□□□□□ -0.92
YLR297WQ05899 TIP1YBR067C 633 nt9.32□□□□□ -0.92
YLR297WQ05899 tS(GCU)LtS(GCU)L 80 nt9.31□□□□□ -0.92
YLR297WQ05899 VMA11YPL234C 495 nt9.3□□□□□ -0.92
YLR297WQ05899 APS2YJR058C 444 nt9.29□□□□□ -0.92
YLR297WQ05899 GSF2YML048W 1212 nt9.29□□□□□ -0.92
YLR297WQ05899 RPD3YNL330C 1302 nt9.29□□□□□ -0.92
YLR297WQ05899 NIF3YGL221C 867 nt9.28□□□□□ -0.92
YLR297WQ05899 ESS1YJR017C 513 nt9.28□□□□□ -0.92
YLR297WQ05899 TUB4YLR212C 1422 nt9.28□□□□□ -0.92
YLR297WQ05899 SSL2YIL143C 2532 nt9.28□□□□□ -0.92
YLR297WQ05899 KEL3YPL263C 1956 nt9.27□□□□□ -0.93
YLR297WQ05899 ODC1YPL134C 933 nt9.27□□□□□ -0.93
YLR297WQ05899 PGC1YPL206C 966 nt9.27□□□□□ -0.93
YLR297WQ05899 ENO2YHR174W 1314 nt9.27□□□□□ -0.93
YLR297WQ05899 YMR209CYMR209C 1374 nt9.26□□□□□ -0.93
YLR297WQ05899 STP3YLR375W 1032 nt9.24□□□□□ -0.93
YLR297WQ05899 SNX3YOR357C 489 nt9.24□□□□□ -0.93
YLR297WQ05899 SUV3YPL029W 2214 nt9.24□□□□□ -0.93
YLR297WQ05899 YMR265CYMR265C 1386 nt9.24□□□□□ -0.93
YLR297WQ05899 AMF1YOR378W 1548 nt9.23□□□□□ -0.93
YLR297WQ05899 TIM44YIL022W 1296 nt9.23□□□□□ -0.93
YLR297WQ05899 SFL1YOR140W 2301 nt9.23□□□□□ -0.93
YLR297WQ05899 PCP1YGR101W 1041 nt9.22□□□□□ -0.93
YLR297WQ05899 CWP2YKL096W-A 279 nt9.22□□□□□ -0.93
YLR297WQ05899 HAP5YOR358W 729 nt9.22□□□□□ -0.93
YLR297WQ05899 TPC1YGR096W 945 nt9.21□□□□□ -0.94
YLR297WQ05899 SWT21YNL187W 1074 nt9.2□□□□□ -0.94
YLR297WQ05899 MET1YKR069W 1782 nt9.19□□□□□ -0.94
YLR297WQ05899 KRE1YNL322C 942 nt9.19□□□□□ -0.94
YLR297WQ05899 YBR232CYBR232C 360 nt9.19□□□□□ -0.94
YLR297WQ05899 RPN14YGL004C 1254 nt9.18□□□□□ -0.94
YLR297WQ05899 SPE2YOL052C 1191 nt9.17□□□□□ -0.94
YLR297WQ05899 CRC1YOR100C 984 nt9.17□□□□□ -0.94
YLR297WQ05899 snR31snR31 225 nt9.17□□□□□ -0.94
YLR297WQ05899 BSP1YPR171W 1731 nt9.17□□□□□ -0.94
YLR297WQ05899 NAS2YIL007C 663 nt9.16□□□□□ -0.94
YLR297WQ05899 MDM35YKL053C-A 261 nt9.15□□□□□ -0.94
YLR297WQ05899 YKL053WYKL053W 375 nt9.15□□□□□ -0.94
YLR297WQ05899 RPC31YNL151C 756 nt9.15□□□□□ -0.94
YLR297WQ05899 DMA2YNL116W 1569 nt9.15□□□□□ -0.95
YLR297WQ05899 PAR32YDL173W 888 nt9.14□□□□□ -0.95
YLR297WQ05899 LEU2YCL018W 1095 nt9.14□□□□□ -0.95
YLR297WQ05899 CDD1YLR245C 429 nt9.12□□□□□ -0.95
YLR297WQ05899 RIM2YBR192W 1134 nt9.12□□□□□ -0.95
YLR297WQ05899 NAM8YHR086W 1572 nt9.12□□□□□ -0.95
YLR297WQ05899 KRR1YCL059C 951 nt9.11□□□□□ -0.95
YLR297WQ05899 IGD1YFR017C 588 nt9.11□□□□□ -0.95
YLR297WQ05899 THP3YPR045C 1413 nt9.11□□□□□ -0.95
YLR297WQ05899 DPL1YDR294C 1770 nt9.11□□□□□ -0.95
YLR297WQ05899 MAE1YKL029C 2010 nt9.09□□□□□ -0.95
YLR297WQ05899 SEN2YLR105C 1134 nt9.09□□□□□ -0.95
YLR297WQ05899 KGD2YDR148C 1392 nt9.08□□□□□ -0.96
YLR297WQ05899 PSD1YNL169C 1503 nt9.06□□□□□ -0.96
YLR297WQ05899 YKR012CYKR012C 378 nt9.05□□□□□ -0.96
YLR297WQ05899 FSH2YMR222C 672 nt9.05□□□□□ -0.96
YLR297WQ05899 SAN1YDR143C 1833 nt9.05□□□□□ -0.96
YLR297WQ05899 SRP54YPR088C 1626 nt9.05□□□□□ -0.96
YLR297WQ05899 YJL064WYJL064W 396 nt9.04□□□□□ -0.96
YLR297WQ05899 HXT10YFL011W 1641 nt9.04□□□□□ -0.96
YLR297WQ05899 REX2YLR059C 810 nt9.03□□□□□ -0.96
YLR297WQ05899 ADH3YMR083W 1128 nt9.03□□□□□ -0.96
YLR297WQ05899 CYT1YOR065W 930 nt9.03□□□□□ -0.96
YLR297WQ05899 LEU4YNL104C 1860 nt9.02□□□□□ -0.96
YLR297WQ05899 PHB2YGR231C 933 nt9.02□□□□□ -0.97
YLR297WQ05899 tA(AGC)DtA(AGC)D 73 nt9.01□□□□□ -0.97
YLR297WQ05899 tA(AGC)FtA(AGC)F 73 nt9.01□□□□□ -0.97
YLR297WQ05899 tA(AGC)GtA(AGC)G 73 nt9.01□□□□□ -0.97
YLR297WQ05899 tA(AGC)HtA(AGC)H 73 nt9.01□□□□□ -0.97
YLR297WQ05899 tA(AGC)JtA(AGC)J 73 nt9.01□□□□□ -0.97
YLR297WQ05899 tA(AGC)K1tA(AGC)K1 73 nt9.01□□□□□ -0.97
YLR297WQ05899 tA(AGC)K2tA(AGC)K2 73 nt9.01□□□□□ -0.97
YLR297WQ05899 tA(AGC)LtA(AGC)L 73 nt9.01□□□□□ -0.97
YLR297WQ05899 tA(AGC)M1tA(AGC)M1 73 nt9.01□□□□□ -0.97
YLR297WQ05899 tA(AGC)M2tA(AGC)M2 73 nt9.01□□□□□ -0.97
YLR297WQ05899 tA(AGC)PtA(AGC)P 73 nt9.01□□□□□ -0.97
YLR297WQ05899 YHR218WYHR218W 1812 nt9.01□□□□□ -0.97
YLR297WQ05899 SBP1YHL034C 885 nt8.99□□□□□ -0.97
YLR297WQ05899 YDR467CYDR467C 327 nt8.98□□□□□ -0.97
YLR297WQ05899 MOB1YIL106W 945 nt8.98□□□□□ -0.97
YLR297WQ05899 IPL1YPL209C 1104 nt8.98□□□□□ -0.97
YLR297WQ05899 SDS24YBR214W 1584 nt8.98□□□□□ -0.97
YLR297WQ05899 ACO2YJL200C 2370 nt8.97□□□□□ -0.97
YLR297WQ05899 NAP1YKR048C 1254 nt8.97□□□□□ -0.97
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 14.2 ms