Protein–RNA interactions for Protein: Q02100

SKO1, CRE-binding bZIP protein SKO1, yeastyeast

Predictions only

Length 647 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SKO1Q02100 tS(GCU)LtS(GCU)L 80 nt7.74□□□□□ -1.17
SKO1Q02100 RIB7YBR153W 735 nt7.74□□□□□ -1.17
SKO1Q02100 YHR219WYHR219W 1875 nt7.74□□□□□ -1.17
SKO1Q02100 GID8YMR135C 1368 nt7.73□□□□□ -1.17
SKO1Q02100 DLD2YDL178W 1593 nt7.73□□□□□ -1.17
SKO1Q02100 MET8YBR213W 825 nt7.73□□□□□ -1.17
SKO1Q02100 FUB1YCR076C 753 nt7.7□□□□□ -1.18
SKO1Q02100 YDL086WYDL086W 822 nt7.7□□□□□ -1.18
SKO1Q02100 YER188WYER188W 720 nt7.7□□□□□ -1.18
SKO1Q02100 DIG1YPL049C 1359 nt7.7□□□□□ -1.18
SKO1Q02100 VPS62YGR141W 1404 nt7.69□□□□□ -1.18
SKO1Q02100 YKL133CYKL133C 1392 nt7.69□□□□□ -1.18
SKO1Q02100 PGC1YPL206C 966 nt7.68□□□□□ -1.18
SKO1Q02100 OYE2YHR179W 1203 nt7.67□□□□□ -1.18
SKO1Q02100 MDM35YKL053C-A 261 nt7.66□□□□□ -1.18
SKO1Q02100 CWP2YKL096W-A 279 nt7.66□□□□□ -1.18
SKO1Q02100 TAF13YML098W 504 nt7.66□□□□□ -1.18
SKO1Q02100 SNZ1YMR096W 894 nt7.66□□□□□ -1.18
SKO1Q02100 RAS2YNL098C 969 nt7.66□□□□□ -1.18
SKO1Q02100 CYT1YOR065W 930 nt7.66□□□□□ -1.18
SKO1Q02100 TPS1YBR126C 1488 nt7.66□□□□□ -1.18
SKO1Q02100 HXT10YFL011W 1641 nt7.65□□□□□ -1.18
SKO1Q02100 PAU5YFL020C 369 nt7.65□□□□□ -1.18
SKO1Q02100 EAF3YPR023C 1206 nt7.65□□□□□ -1.18
SKO1Q02100 YBR232CYBR232C 360 nt7.65□□□□□ -1.18
SKO1Q02100 STP3YLR375W 1032 nt7.64□□□□□ -1.19
SKO1Q02100 SEN2YLR105C 1134 nt7.63□□□□□ -1.19
SKO1Q02100 NSG2YNL156C 900 nt7.63□□□□□ -1.19
SKO1Q02100 YPR126CYPR126C 309 nt7.63□□□□□ -1.19
SKO1Q02100 DLD3YEL071W 1491 nt7.62□□□□□ -1.19
SKO1Q02100 DAK2YFL053W 1776 nt7.61□□□□□ -1.19
SKO1Q02100 TAT2YOL020W 1779 nt7.61□□□□□ -1.19
SKO1Q02100 NAP1YKR048C 1254 nt7.61□□□□□ -1.19
SKO1Q02100 MHF1YOL086W-A 273 nt7.61□□□□□ -1.19
SKO1Q02100 OSH7YHR001W 1314 nt7.6□□□□□ -1.19
SKO1Q02100 YMR262WYMR262W 942 nt7.58□□□□□ -1.2
SKO1Q02100 TMA23YMR269W 636 nt7.58□□□□□ -1.2
SKO1Q02100 CTI6YPL181W 1521 nt7.57□□□□□ -1.2
SKO1Q02100 YLR173WYLR173W 1827 nt7.57□□□□□ -1.2
SKO1Q02100 POT1YIL160C 1254 nt7.57□□□□□ -1.2
SKO1Q02100 LSR1LSR1 1175 nt7.57□□□□□ -1.2
SKO1Q02100 IML3YBR107C 738 nt7.57□□□□□ -1.2
SKO1Q02100 PAB1YER165W 1734 nt7.56□□□□□ -1.2
SKO1Q02100 ALD5YER073W 1563 nt7.56□□□□□ -1.2
SKO1Q02100 GSF2YML048W 1212 nt7.56□□□□□ -1.2
SKO1Q02100 AGP3YFL055W 1677 nt7.56□□□□□ -1.2
SKO1Q02100 SOL2YCR073W-A 948 nt7.55□□□□□ -1.2
SKO1Q02100 PUP1YOR157C 786 nt7.55□□□□□ -1.2
SKO1Q02100 HXK1YFR053C 1458 nt7.55□□□□□ -1.2
SKO1Q02100 DDI1YER143W 1287 nt7.54□□□□□ -1.2
SKO1Q02100 AIM1YAL046C 357 nt7.54□□□□□ -1.2
SKO1Q02100 ITR2YOL103W 1830 nt7.54□□□□□ -1.2
SKO1Q02100 YRF1-2YER190W 5046 nt7.53□□□□□ -1.2
SKO1Q02100 IMO32YGR031W 1029 nt7.53□□□□□ -1.2
SKO1Q02100 YJL064WYJL064W 396 nt7.53□□□□□ -1.2
SKO1Q02100 TUB4YLR212C 1422 nt7.52□□□□□ -1.2
SKO1Q02100 PAR32YDL173W 888 nt7.52□□□□□ -1.21
SKO1Q02100 NBA1YOL070C 1506 nt7.52□□□□□ -1.21
SKO1Q02100 DPL1YDR294C 1770 nt7.51□□□□□ -1.21
SKO1Q02100 LSM5YER146W 282 nt7.51□□□□□ -1.21
SKO1Q02100 NAS6YGR232W 687 nt7.51□□□□□ -1.21
SKO1Q02100 RPD3YNL330C 1302 nt7.51□□□□□ -1.21
SKO1Q02100 PAU19YMR325W 375 nt7.5□□□□□ -1.21
SKO1Q02100 TOM71YHR117W 1920 nt7.49□□□□□ -1.21
SKO1Q02100 YDR455CYDR455C 309 nt7.49□□□□□ -1.21
SKO1Q02100 NIF3YGL221C 867 nt7.49□□□□□ -1.21
SKO1Q02100 RRT8YOL048C 1029 nt7.49□□□□□ -1.21
SKO1Q02100 RIM2YBR192W 1134 nt7.49□□□□□ -1.21
SKO1Q02100 PCP1YGR101W 1041 nt7.48□□□□□ -1.21
SKO1Q02100 APS2YJR058C 444 nt7.48□□□□□ -1.21
SKO1Q02100 YLR046CYLR046C 813 nt7.48□□□□□ -1.21
SKO1Q02100 FET5YFL041W 1869 nt7.47□□□□□ -1.21
SKO1Q02100 SPS100YHR139C 981 nt7.47□□□□□ -1.21
SKO1Q02100 ENT4YLL038C 744 nt7.47□□□□□ -1.21
SKO1Q02100 ASP3-1YLR155C 1089 nt7.47□□□□□ -1.21
SKO1Q02100 ASP3-2YLR157C 1089 nt7.47□□□□□ -1.21
SKO1Q02100 ASP3-3YLR158C 1089 nt7.47□□□□□ -1.21
SKO1Q02100 ASP3-4YLR160C 1089 nt7.47□□□□□ -1.21
SKO1Q02100 TIM44YIL022W 1296 nt7.46□□□□□ -1.22
SKO1Q02100 SAC7YDR389W 1965 nt7.46□□□□□ -1.22
SKO1Q02100 YFR036W-AYFR036W-A 651 nt7.45□□□□□ -1.22
SKO1Q02100 TPN1YGL186C 1740 nt7.44□□□□□ -1.22
SKO1Q02100 RPC31YNL151C 756 nt7.44□□□□□ -1.22
SKO1Q02100 VMA11YPL234C 495 nt7.43□□□□□ -1.22
SKO1Q02100 AAC3YBR085W 924 nt7.43□□□□□ -1.22
SKO1Q02100 ERG13YML126C 1476 nt7.43□□□□□ -1.22
SKO1Q02100 RTG2YGL252C 1767 nt7.42□□□□□ -1.22
SKO1Q02100 ADE8YDR408C 645 nt7.42□□□□□ -1.22
SKO1Q02100 SNU66YOR308C 1764 nt7.41□□□□□ -1.22
SKO1Q02100 TVP23YDR084C 600 nt7.41□□□□□ -1.22
SKO1Q02100 LEU4YNL104C 1860 nt7.41□□□□□ -1.22
SKO1Q02100 YOR072WYOR072W 315 nt7.4□□□□□ -1.22
SKO1Q02100 KRR1YCL059C 951 nt7.39□□□□□ -1.23
SKO1Q02100 IGD1YFR017C 588 nt7.39□□□□□ -1.23
SKO1Q02100 ADE2YOR128C 1716 nt7.38□□□□□ -1.23
SKO1Q02100 MDL2YPL270W 2322 nt7.38□□□□□ -1.23
SKO1Q02100 YRF1-3YGR296W 5580 nt7.38□□□□□ -1.23
SKO1Q02100 YRF1-6YNL339C 5580 nt7.38□□□□□ -1.23
SKO1Q02100 YRF1-7YPL283C 5580 nt7.38□□□□□ -1.23
SKO1Q02100 YJR114WYJR114W 393 nt7.38□□□□□ -1.23
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