Protein–RNA interactions for Protein: Q01448

HPC2, Histone promoter control protein 2, yeastyeast

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Length 625 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
HPC2Q01448 tA(AGC)JtA(AGC)J 73 nt10.98□□□□□ -0.65
HPC2Q01448 tA(AGC)K1tA(AGC)K1 73 nt10.98□□□□□ -0.65
HPC2Q01448 tA(AGC)K2tA(AGC)K2 73 nt10.98□□□□□ -0.65
HPC2Q01448 tA(AGC)LtA(AGC)L 73 nt10.98□□□□□ -0.65
HPC2Q01448 tA(AGC)M1tA(AGC)M1 73 nt10.98□□□□□ -0.65
HPC2Q01448 tA(AGC)M2tA(AGC)M2 73 nt10.98□□□□□ -0.65
HPC2Q01448 tA(AGC)PtA(AGC)P 73 nt10.98□□□□□ -0.65
HPC2Q01448 RPL12BYDR418W 498 nt10.98□□□□□ -0.65
HPC2Q01448 TRT2tT(CGU)K 72 nt10.97□□□□□ -0.65
HPC2Q01448 ACO2YJL200C 2370 nt10.96□□□□□ -0.65
HPC2Q01448 ALG12YNR030W 1656 nt10.96□□□□□ -0.65
HPC2Q01448 OXA1YER154W 1209 nt10.96□□□□□ -0.65
HPC2Q01448 OYE2YHR179W 1203 nt10.96□□□□□ -0.65
HPC2Q01448 YOR343CYOR343C 327 nt10.95□□□□□ -0.66
HPC2Q01448 SEC61YLR378C 1443 nt10.94□□□□□ -0.66
HPC2Q01448 UME6YDR207C 2511 nt10.94□□□□□ -0.66
HPC2Q01448 YMR007WYMR007W 381 nt10.93□□□□□ -0.66
HPC2Q01448 GND2YGR256W 1479 nt10.93□□□□□ -0.66
HPC2Q01448 PRP4YPR178W 1398 nt10.92□□□□□ -0.66
HPC2Q01448 CDD1YLR245C 429 nt10.92□□□□□ -0.66
HPC2Q01448 LYS20YDL182W 1287 nt10.91□□□□□ -0.66
HPC2Q01448 SEM1YDR363W-A 270 nt10.91□□□□□ -0.66
HPC2Q01448 YDR306CYDR306C 1437 nt10.9□□□□□ -0.66
HPC2Q01448 RAS2YNL098C 969 nt10.89□□□□□ -0.67
HPC2Q01448 RCR1YBR005W 642 nt10.89□□□□□ -0.67
HPC2Q01448 EAF3YPR023C 1206 nt10.89□□□□□ -0.67
HPC2Q01448 UFO1YML088W 2007 nt10.88□□□□□ -0.67
HPC2Q01448 SWP1YMR149W 861 nt10.88□□□□□ -0.67
HPC2Q01448 YAL016C-AYAL016C-A 315 nt10.87□□□□□ -0.67
HPC2Q01448 YNL165WYNL165W 1221 nt10.87□□□□□ -0.67
HPC2Q01448 PUS7YOR243C 2031 nt10.87□□□□□ -0.67
HPC2Q01448 FUB1YCR076C 753 nt10.86□□□□□ -0.67
HPC2Q01448 YOR268CYOR268C 399 nt10.86□□□□□ -0.67
HPC2Q01448 DPS1YLL018C 1674 nt10.85□□□□□ -0.67
HPC2Q01448 YER188WYER188W 720 nt10.85□□□□□ -0.67
HPC2Q01448 RMA1YKL132C 1293 nt10.85□□□□□ -0.67
HPC2Q01448 SAM2YDR502C 1155 nt10.84□□□□□ -0.67
HPC2Q01448 FLX1YIL134W 936 nt10.84□□□□□ -0.67
HPC2Q01448 TMA23YMR269W 636 nt10.84□□□□□ -0.67
HPC2Q01448 MCH5YOR306C 1566 nt10.83□□□□□ -0.68
HPC2Q01448 MFG1YDL233W 1377 nt10.83□□□□□ -0.68
HPC2Q01448 NAS2YIL007C 663 nt10.83□□□□□ -0.68
HPC2Q01448 SPS100YHR139C 981 nt10.82□□□□□ -0.68
HPC2Q01448 SHY1YGR112W 1170 nt10.81□□□□□ -0.68
HPC2Q01448 MCM5YLR274W 2328 nt10.8□□□□□ -0.68
HPC2Q01448 HRA1HRA1 564 nt10.8□□□□□ -0.68
HPC2Q01448 OYE3YPL171C 1203 nt10.79□□□□□ -0.68
HPC2Q01448 TOS1YBR162C 1368 nt10.78□□□□□ -0.68
HPC2Q01448 IMO32YGR031W 1029 nt10.78□□□□□ -0.68
HPC2Q01448 YJL211CYJL211C 444 nt10.78□□□□□ -0.68
HPC2Q01448 AST1YBL069W 1290 nt10.78□□□□□ -0.68
HPC2Q01448 EEB1YPL095C 1371 nt10.77□□□□□ -0.68
HPC2Q01448 URA6YKL024C 615 nt10.77□□□□□ -0.69
HPC2Q01448 SER2YGR208W 930 nt10.76□□□□□ -0.69
HPC2Q01448 THP3YPR045C 1413 nt10.75□□□□□ -0.69
HPC2Q01448 HOS2YGL194C 1359 nt10.74□□□□□ -0.69
HPC2Q01448 DDI1YER143W 1287 nt10.73□□□□□ -0.69
HPC2Q01448 SKG1YKR100C 1068 nt10.73□□□□□ -0.69
HPC2Q01448 YJL107CYJL107C 1164 nt10.72□□□□□ -0.69
HPC2Q01448 PET8YNL003C 855 nt10.71□□□□□ -0.69
HPC2Q01448 HTS1YPR033C 1641 nt10.7□□□□□ -0.7
HPC2Q01448 ATG22YCL038C 1587 nt10.7□□□□□ -0.7
HPC2Q01448 COX16YJL003W 357 nt10.7□□□□□ -0.7
HPC2Q01448 FSH2YMR222C 672 nt10.7□□□□□ -0.7
HPC2Q01448 IDP3YNL009W 1263 nt10.7□□□□□ -0.7
HPC2Q01448 RSC8YFR037C 1674 nt10.69□□□□□ -0.7
HPC2Q01448 NAR1YNL240C 1476 nt10.69□□□□□ -0.7
HPC2Q01448 GRH1YDR517W 1119 nt10.69□□□□□ -0.7
HPC2Q01448 YFR036W-AYFR036W-A 651 nt10.69□□□□□ -0.7
HPC2Q01448 DLD2YDL178W 1593 nt10.69□□□□□ -0.7
HPC2Q01448 PHB2YGR231C 933 nt10.68□□□□□ -0.7
HPC2Q01448 CYC3YAL039C 810 nt10.68□□□□□ -0.7
HPC2Q01448 HOG1YLR113W 1308 nt10.67□□□□□ -0.7
HPC2Q01448 OSH7YHR001W 1314 nt10.66□□□□□ -0.7
HPC2Q01448 EDC2YER035W 438 nt10.66□□□□□ -0.7
HPC2Q01448 ADH3YMR083W 1128 nt10.66□□□□□ -0.7
HPC2Q01448 RSM23YGL129C 1353 nt10.65□□□□□ -0.7
HPC2Q01448 SNF1YDR477W 1902 nt10.65□□□□□ -0.7
HPC2Q01448 LSM5YER146W 282 nt10.65□□□□□ -0.7
HPC2Q01448 RRT8YOL048C 1029 nt10.65□□□□□ -0.7
HPC2Q01448 BIO5YNR056C 1686 nt10.64□□□□□ -0.71
HPC2Q01448 PCP1YGR101W 1041 nt10.64□□□□□ -0.71
HPC2Q01448 YNR068CYNR068C 819 nt10.64□□□□□ -0.71
HPC2Q01448 FLR1YBR008C 1647 nt10.63□□□□□ -0.71
HPC2Q01448 BET2YPR176C 978 nt10.63□□□□□ -0.71
HPC2Q01448 APM1YPL259C 1428 nt10.62□□□□□ -0.71
HPC2Q01448 SOL2YCR073W-A 948 nt10.62□□□□□ -0.71
HPC2Q01448 YMR147WYMR147W 672 nt10.62□□□□□ -0.71
HPC2Q01448 SPE2YOL052C 1191 nt10.62□□□□□ -0.71
HPC2Q01448 SCO2YBR024W 906 nt10.62□□□□□ -0.71
HPC2Q01448 TVP23YDR084C 600 nt10.61□□□□□ -0.71
HPC2Q01448 MOB1YIL106W 945 nt10.6□□□□□ -0.71
HPC2Q01448 YMR206WYMR206W 942 nt10.6□□□□□ -0.71
HPC2Q01448 PZF1YPR186C 1290 nt10.59□□□□□ -0.71
HPC2Q01448 ADE8YDR408C 645 nt10.57□□□□□ -0.72
HPC2Q01448 PET20YPL159C 762 nt10.57□□□□□ -0.72
HPC2Q01448 YPS3YLR121C 1527 nt10.57□□□□□ -0.72
HPC2Q01448 snR78snR78 87 nt10.55□□□□□ -0.72
HPC2Q01448 MRP1YDR347W 966 nt10.55□□□□□ -0.72
HPC2Q01448 SRP102YKL154W 735 nt10.54□□□□□ -0.72
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