Protein–RNA interactions for Protein: P35269

GTF2F1, General transcription factor IIF subunit 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2F1P35269 TNK2-208ENST00000428187 4235 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.054e-7■■■■■ 62.5
GTF2F1P35269 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.361e-9■■■■■ 62.2
GTF2F1P35269 ATXN2L-210ENST00000562867 609 ntTSL 219.9■□□□□ 0.783e-7■■■■■ 62.1
GTF2F1P35269 ATXN2L-204ENST00000382686 3739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.353e-7■■■■■ 62.1
GTF2F1P35269 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.343e-7■■■■■ 62.1
GTF2F1P35269 ATXN2L-211ENST00000563314 4574 ntTSL 517.02■□□□□ 0.323e-7■■■■■ 62.1
GTF2F1P35269 ATXN2L-215ENST00000564304 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.183e-7■■■■■ 62.1
GTF2F1P35269 ATXN2L-225ENST00000570200 3635 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.073e-7■■■■■ 62.1
GTF2F1P35269 ATXN2L-205ENST00000395547 3981 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.073e-7■■■■■ 62.1
GTF2F1P35269 ATXN2L-201ENST00000325215 3788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.033e-7■■■■■ 62.1
GTF2F1P35269 ATXN2L-203ENST00000340394 3807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 03e-7■■■■■ 62.1
GTF2F1P35269 PRIMPOL-211ENST00000515774 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.022e-8■■■■■ 62
GTF2F1P35269 PRIMPOL-201ENST00000314970 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.052e-8■■■■■ 62
GTF2F1P35269 PRIMPOL-209ENST00000512834 2174 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.162e-8■■■■■ 62
GTF2F1P35269 PRIMPOL-205ENST00000509002 1631 ntTSL 1 (best)12.45□□□□□ -0.422e-8■■■■■ 62
GTF2F1P35269 PRIMPOL-202ENST00000503752 2168 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.422e-8■■■■■ 62
GTF2F1P35269 PRIMPOL-203ENST00000506278 1138 ntTSL 1 (best)8.91□□□□□ -0.982e-8■■■■■ 62
GTF2F1P35269 EHMT1-224ENST00000630754 709 ntTSL 321.78■■□□□ 1.086e-7■■■■■ 61.8
GTF2F1P35269 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.726e-7■■■■■ 61.8
GTF2F1P35269 EHMT1-220ENST00000626216 558 ntTSL 315.43■□□□□ 0.066e-7■■■■■ 61.8
GTF2F1P35269 EHMT1-221ENST00000629335 3600 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.396e-7■■■■■ 61.8
GTF2F1P35269 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.43e-15■■■■■ 61.7
GTF2F1P35269 ZNF200-210ENST00000577015 637 ntTSL 420.08■□□□□ 0.813e-15■■■■■ 61.7
GTF2F1P35269 PSTPIP2-203ENST00000588801 1023 ntTSL 518.7■□□□□ 0.583e-15■■■■■ 61.7
GTF2F1P35269 PNPLA7-203ENST00000434090 2419 ntTSL 518.01■□□□□ 0.473e-15■■■■■ 61.7
GTF2F1P35269 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.163e-15■■■■■ 61.7
GTF2F1P35269 PNPLA7-202ENST00000406427 4806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.063e-15■■■■■ 61.7
GTF2F1P35269 PNPLA7-201ENST00000277531 4581 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.183e-15■■■■■ 61.7
GTF2F1P35269 PSTPIP2-201ENST00000409746 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.273e-15■■■■■ 61.7
GTF2F1P35269 ADD1-206ENST00000398129 3787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.323e-15■■■■■ 61.7
GTF2F1P35269 ZNF200-207ENST00000575617 713 ntTSL 212.54□□□□□ -0.43e-15■■■■■ 61.7
GTF2F1P35269 GRAMD1A-206ENST00000598073 582 ntTSL 312.47□□□□□ -0.413e-15■■■■■ 61.7
GTF2F1P35269 PSTPIP2-204ENST00000589328 2900 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.433e-15■■■■■ 61.7
GTF2F1P35269 ADD1-211ENST00000506157 5179 ntTSL 511.99□□□□□ -0.493e-15■■■■■ 61.7
GTF2F1P35269 ADD1-209ENST00000503169 2394 ntTSL 29.92□□□□□ -0.823e-15■■■■■ 61.7
GTF2F1P35269 VCL-205ENST00000478896 727 ntTSL 515.07■□□□□ 08e-7■■■■■ 61.7
GTF2F1P35269 VCL-202ENST00000372755 6489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.38e-7■■■■■ 61.7
GTF2F1P35269 VCL-201ENST00000211998 5490 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.418e-7■■■■■ 61.7
GTF2F1P35269 VCL-206ENST00000623461 7995 ntTSL 1 (best)10.51□□□□□ -0.738e-7■■■■■ 61.7
GTF2F1P35269 VCL-207ENST00000624354 3307 ntTSL 210.39□□□□□ -0.758e-7■■■■■ 61.7
GTF2F1P35269 MST1-204ENST00000479115 2285 ntTSL 527.1■■□□□ 1.934e-33■■■■■ 61.6
GTF2F1P35269 MST1-220ENST00000497359 1917 ntTSL 525.22■■□□□ 1.634e-33■■■■■ 61.6
GTF2F1P35269 MST1-215ENST00000492329 2006 ntTSL 521.24■□□□□ 0.994e-33■■■■■ 61.6
GTF2F1P35269 MST1-210ENST00000484673 1307 ntTSL 220.9■□□□□ 0.944e-33■■■■■ 61.6
GTF2F1P35269 MST1-209ENST00000484269 1518 ntTSL 519.94■□□□□ 0.784e-33■■■■■ 61.6
GTF2F1P35269 MST1-205ENST00000480268 648 ntTSL 318.7■□□□□ 0.584e-33■■■■■ 61.6
GTF2F1P35269 MST1-216ENST00000492370 1374 ntTSL 1 (best)18.55■□□□□ 0.564e-33■■■■■ 61.6
GTF2F1P35269 MST1-218ENST00000494809 859 ntTSL 317.75■□□□□ 0.434e-33■■■■■ 61.6
GTF2F1P35269 MST1-212ENST00000489007 737 ntTSL 317■□□□□ 0.314e-33■■■■■ 61.6
GTF2F1P35269 MST1-202ENST00000449682 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.244e-33■■■■■ 61.6
GTF2F1P35269 MST1-211ENST00000488350 4152 ntTSL 516.47■□□□□ 0.234e-33■■■■■ 61.6
GTF2F1P35269 C1orf159-213ENST00000472741 661 ntTSL 420.8■□□□□ 0.923e-14■■■■■ 61.2
GTF2F1P35269 C1orf159-217ENST00000480643 579 ntTSL 416.96■□□□□ 0.313e-14■■■■■ 61.2
GTF2F1P35269 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.412e-11■■■■■ 60.6
GTF2F1P35269 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.242e-11■■■■■ 60.6
GTF2F1P35269 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.832e-11■■■■■ 60.6
GTF2F1P35269 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.832e-11■■■■■ 60.6
GTF2F1P35269 NUDT16L1-205ENST00000590460 709 ntTSL 320.13■□□□□ 0.812e-11■■■■■ 60.6
GTF2F1P35269 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.733e-9■■■■■ 60.4
GTF2F1P35269 SEMA7A-202ENST00000542748 3228 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.23e-9■■■■■ 60.4
GTF2F1P35269 IGF2BP2-202ENST00000382199 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.194e-29■■■■■ 60.4
GTF2F1P35269 IGF2BP2-204ENST00000457616 3426 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.044e-29■■■■■ 60.4
GTF2F1P35269 IGF2BP2-201ENST00000346192 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.164e-29■■■■■ 60.4
GTF2F1P35269 ZNF48-204ENST00000528032 555 ntTSL 427.17■■□□□ 1.948e-15■■■■■ 60.1
GTF2F1P35269 ZNF48-202ENST00000495929 430 ntTSL 426.15■■□□□ 1.788e-15■■■■■ 60.1
GTF2F1P35269 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.978e-15■■■■■ 60.1
GTF2F1P35269 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC20.03■□□□□ 0.88e-15■■■■■ 60.1
GTF2F1P35269 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.598e-15■■■■■ 60.1
GTF2F1P35269 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.538e-15■■■■■ 60.1
GTF2F1P35269 STX3-206ENST00000533637 1024 ntTSL 218.1■□□□□ 0.498e-15■■■■■ 60.1
GTF2F1P35269 STX3-205ENST00000530498 690 ntTSL 217.89■□□□□ 0.458e-15■■■■■ 60.1
GTF2F1P35269 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.348e-15■■■■■ 60.1
GTF2F1P35269 AGPAT1-207ENST00000476663 746 ntTSL 516.53■□□□□ 0.248e-15■■■■■ 60.1
GTF2F1P35269 AGPAT1-205ENST00000395497 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.188e-15■■■■■ 60.1
GTF2F1P35269 AGPAT1-203ENST00000375107 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.078e-15■■■■■ 60.1
GTF2F1P35269 STX3-207ENST00000633708 3111 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.038e-15■■■■■ 60.1
GTF2F1P35269 AGPAT1-206ENST00000395499 2496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.118e-15■■■■■ 60.1
GTF2F1P35269 AGPAT1-208ENST00000490711 2448 ntTSL 212.12□□□□□ -0.478e-15■■■■■ 60.1
GTF2F1P35269 STX3-208ENST00000641815 3236 ntBASIC6.32□□□□□ -1.48e-15■■■■■ 60.1
GTF2F1P35269 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.224e-10■■■■■ 59.9
GTF2F1P35269 NCAPG2-201ENST00000356309 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.241e-16■■■■■ 59.7
GTF2F1P35269 NCAPG2-205ENST00000441982 2926 ntTSL 210.81□□□□□ -0.681e-16■■■■■ 59.7
GTF2F1P35269 NCAPG2-204ENST00000432615 4134 ntTSL 510.5□□□□□ -0.731e-16■■■■■ 59.7
GTF2F1P35269 NCAPG2-203ENST00000409423 3957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.831e-16■■■■■ 59.7
GTF2F1P35269 NCAPG2-206ENST00000467785 3276 ntTSL 1 (best)9.23□□□□□ -0.931e-16■■■■■ 59.7
GTF2F1P35269 NCAPG2-202ENST00000409339 5253 ntTSL 1 (best) BASIC8.1□□□□□ -1.111e-16■■■■■ 59.7
GTF2F1P35269 PAQR8-201ENST00000360726 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.593e-7■■■■■ 59.4
GTF2F1P35269 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.431e-8■■■■■ 59.2
GTF2F1P35269 LARP4-201ENST00000293618 6296 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.141e-8■■■■■ 59.2
GTF2F1P35269 LARP4-206ENST00000518444 2853 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.261e-8■■■■■ 59.2
GTF2F1P35269 LARP4-204ENST00000429001 4000 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.581e-8■■■■■ 59.2
GTF2F1P35269 LARP4-203ENST00000398473 6427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.41e-8■■■■■ 59.2
GTF2F1P35269 LARP4-202ENST00000347328 3621 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.471e-8■■■■■ 59.2
GTF2F1P35269 ZC3H3-202ENST00000528401 546 ntTSL 319.97■□□□□ 0.795e-7■■■■■ 58.9
GTF2F1P35269 ZC3H3-201ENST00000262577 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.135e-7■■■■■ 58.9
GTF2F1P35269 BOP1-202ENST00000568812 878 ntTSL 522.3■■□□□ 1.165e-11■■■■■ 58.8
GTF2F1P35269 MIR7112-201ENST00000616126 65 ntBASIC3.87□□□□□ -1.795e-11■■■■■ 58.8
GTF2F1P35269 FOXRED1-203ENST00000525083 1228 ntTSL 219.14■□□□□ 0.652e-18■■■■■ 58.6
GTF2F1P35269 FOXRED1-207ENST00000527004 1760 ntTSL 517.69■□□□□ 0.422e-18■■■■■ 58.6
GTF2F1P35269 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.372e-18■■■■■ 58.6
Retrieved 100 of 18,214 protein–RNA pairs in 228.7 ms