Protein–RNA interactions for Protein: P32578

SIP1, SNF1 protein kinase subunit beta-1, yeast

Predictions only

Length 815 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SIP1	P32578	SEC61	YLR378C	1443 nt		7.61	□□□□□ -1.19
SIP1	P32578	HEM13	YDR044W	987 nt		7.6	□□□□□ -1.19
SIP1	P32578	TIM44	YIL022W	1296 nt		7.6	□□□□□ -1.19
SIP1	P32578	YMR262W	YMR262W	942 nt		7.6	□□□□□ -1.19
SIP1	P32578	DUS3	YLR401C	2007 nt		7.59	□□□□□ -1.19
SIP1	P32578	DUR3	YHL016C	2208 nt		7.59	□□□□□ -1.19
SIP1	P32578	MET30	YIL046W	1923 nt		7.59	□□□□□ -1.19
SIP1	P32578	FET5	YFL041W	1869 nt		7.59	□□□□□ -1.19
SIP1	P32578	RPS14B	YJL191W	417 nt		7.58	□□□□□ -1.2
SIP1	P32578	YNL190W	YNL190W	615 nt		7.58	□□□□□ -1.2
SIP1	P32578	AIM45	YPR004C	1035 nt		7.58	□□□□□ -1.2
SIP1	P32578	BNI5	YNL166C	1347 nt		7.57	□□□□□ -1.2
SIP1	P32578	POP2	YNR052C	1302 nt		7.57	□□□□□ -1.2
SIP1	P32578	AIM1	YAL046C	357 nt		7.57	□□□□□ -1.2
SIP1	P32578	SNU66	YOR308C	1764 nt		7.56	□□□□□ -1.2
SIP1	P32578	OXA1	YER154W	1209 nt		7.56	□□□□□ -1.2
SIP1	P32578	RPD3	YNL330C	1302 nt		7.55	□□□□□ -1.2
SIP1	P32578	LSM5	YER146W	282 nt		7.55	□□□□□ -1.2
SIP1	P32578	YER188W	YER188W	720 nt		7.55	□□□□□ -1.2
SIP1	P32578	OSH7	YHR001W	1314 nt		7.53	□□□□□ -1.2
SIP1	P32578	INH1	YDL181W	258 nt		7.53	□□□□□ -1.2
SIP1	P32578	YLR046C	YLR046C	813 nt		7.53	□□□□□ -1.2
SIP1	P32578	ORT1	YOR130C	879 nt		7.53	□□□□□ -1.2
SIP1	P32578	FUB1	YCR076C	753 nt		7.52	□□□□□ -1.21
SIP1	P32578	YPL041C	YPL041C	624 nt		7.52	□□□□□ -1.21
SIP1	P32578	LAS17	YOR181W	1902 nt		7.52	□□□□□ -1.21
SIP1	P32578	ADE16	YLR028C	1776 nt		7.51	□□□□□ -1.21
SIP1	P32578	RIM2	YBR192W	1134 nt		7.51	□□□□□ -1.21
SIP1	P32578	TAT2	YOL020W	1779 nt		7.51	□□□□□ -1.21
SIP1	P32578	DLD3	YEL071W	1491 nt		7.5	□□□□□ -1.21
SIP1	P32578	ADE2	YOR128C	1716 nt		7.49	□□□□□ -1.21
SIP1	P32578	RTG2	YGL252C	1767 nt		7.49	□□□□□ -1.21
SIP1	P32578	snR4	snR4	186 nt		7.49	□□□□□ -1.21
SIP1	P32578	MSC1	YML128C	1542 nt		7.48	□□□□□ -1.21
SIP1	P32578	SOL2	YCR073W-A	948 nt		7.47	□□□□□ -1.21
SIP1	P32578	YEL009C-A	YEL009C-A	408 nt		7.47	□□□□□ -1.21
SIP1	P32578	YLR279W	YLR279W	390 nt		7.47	□□□□□ -1.21
SIP1	P32578	YMR244W	YMR244W	1068 nt		7.47	□□□□□ -1.21
SIP1	P32578	RAS2	YNL098C	969 nt		7.47	□□□□□ -1.21
SIP1	P32578	YRF1-1	YDR545W	5391 nt		7.46	□□□□□ -1.21
SIP1	P32578	YRF1-5	YLR467W	5391 nt		7.46	□□□□□ -1.21
SIP1	P32578	YRF1-8	YOR396W	5391 nt		7.46	□□□□□ -1.21
SIP1	P32578	THI6	YPL214C	1623 nt		7.46	□□□□□ -1.21
SIP1	P32578	RPC31	YNL151C	756 nt		7.46	□□□□□ -1.22
SIP1	P32578	TIP1	YBR067C	633 nt		7.46	□□□□□ -1.22
SIP1	P32578	HXT12	YIL170W	1374 nt		7.46	□□□□□ -1.22
SIP1	P32578	ITR2	YOL103W	1830 nt		7.45	□□□□□ -1.22
SIP1	P32578	MSB4	YOL112W	1479 nt		7.45	□□□□□ -1.22
SIP1	P32578	ASP3-1	YLR155C	1089 nt		7.45	□□□□□ -1.22
SIP1	P32578	ASP3-2	YLR157C	1089 nt		7.45	□□□□□ -1.22
SIP1	P32578	ASP3-3	YLR158C	1089 nt		7.45	□□□□□ -1.22
SIP1	P32578	ASP3-4	YLR160C	1089 nt		7.45	□□□□□ -1.22
SIP1	P32578	TSC10	YBR265W	963 nt		7.45	□□□□□ -1.22
SIP1	P32578	KRR1	YCL059C	951 nt		7.44	□□□□□ -1.22
SIP1	P32578	ENT4	YLL038C	744 nt		7.44	□□□□□ -1.22
SIP1	P32578	NUC1	YJL208C	990 nt		7.43	□□□□□ -1.22
SIP1	P32578	PFS2	YNL317W	1398 nt		7.43	□□□□□ -1.22
SIP1	P32578	LEU4	YNL104C	1860 nt		7.43	□□□□□ -1.22
SIP1	P32578	GCD11	YER025W	1584 nt		7.42	□□□□□ -1.22
SIP1	P32578	DPL1	YDR294C	1770 nt		7.42	□□□□□ -1.22
SIP1	P32578	COG1	YGL223C	1254 nt		7.42	□□□□□ -1.22
SIP1	P32578	SDH5	YOL071W	489 nt		7.42	□□□□□ -1.22
SIP1	P32578	AIM34	YMR003W	597 nt		7.41	□□□□□ -1.22
SIP1	P32578	GPN2	YOR262W	1044 nt		7.41	□□□□□ -1.22
SIP1	P32578	NPP2	YEL016C	1482 nt		7.41	□□□□□ -1.22
SIP1	P32578	HXT11	YOL156W	1704 nt		7.41	□□□□□ -1.22
SIP1	P32578	CSM1	YCR086W	573 nt		7.4	□□□□□ -1.22
SIP1	P32578	YDR455C	YDR455C	309 nt		7.4	□□□□□ -1.22
SIP1	P32578	PAU21	YOR394W	495 nt		7.4	□□□□□ -1.22
SIP1	P32578	PAU22	YPL282C	495 nt		7.4	□□□□□ -1.22
SIP1	P32578	FCY21	YER060W	1587 nt		7.39	□□□□□ -1.23
SIP1	P32578	HSV2	YGR223C	1347 nt		7.39	□□□□□ -1.23
SIP1	P32578	APT2	YDR441C	546 nt		7.39	□□□□□ -1.23
SIP1	P32578	YGR012W	YGR012W	1182 nt		7.39	□□□□□ -1.23
SIP1	P32578	VMA11	YPL234C	495 nt		7.39	□□□□□ -1.23
SIP1	P32578	TRP2	YER090W	1524 nt		7.38	□□□□□ -1.23
SIP1	P32578	MAM3	YOL060C	2121 nt		7.37	□□□□□ -1.23
SIP1	P32578	YIL177C	YIL177C	5277 nt		7.37	□□□□□ -1.23
SIP1	P32578	FRT1	YOR324C	1809 nt		7.37	□□□□□ -1.23
SIP1	P32578	FTH1	YBR207W	1398 nt		7.36	□□□□□ -1.23
SIP1	P32578	PRY1	YJL079C	900 nt		7.36	□□□□□ -1.23
SIP1	P32578	SNX3	YOR357C	489 nt		7.36	□□□□□ -1.23
SIP1	P32578	YEL023C	YEL023C	2049 nt		7.35	□□□□□ -1.23
SIP1	P32578	PMA2	YPL036W	2844 nt		7.35	□□□□□ -1.23
SIP1	P32578	GGC1	YDL198C	903 nt		7.35	□□□□□ -1.23
SIP1	P32578	tE(CUC)D	tE(CUC)D	72 nt		7.35	□□□□□ -1.23
SIP1	P32578	tE(CUC)I	tE(CUC)I	72 nt		7.35	□□□□□ -1.23
SIP1	P32578	DIA4	YHR011W	1341 nt		7.34	□□□□□ -1.23
SIP1	P32578	ARO7	YPR060C	771 nt		7.34	□□□□□ -1.23
SIP1	P32578	YTH1	YPR107C	627 nt		7.34	□□□□□ -1.23
SIP1	P32578	ITR1	YDR497C	1755 nt		7.33	□□□□□ -1.24
SIP1	P32578	ERG13	YML126C	1476 nt		7.33	□□□□□ -1.24
SIP1	P32578	GLR1	YPL091W	1452 nt		7.33	□□□□□ -1.24
SIP1	P32578	SLM3	YDL033C	1254 nt		7.33	□□□□□ -1.24
SIP1	P32578	EAF3	YPR023C	1206 nt		7.33	□□□□□ -1.24
SIP1	P32578	YRF1-3	YGR296W	5580 nt		7.33	□□□□□ -1.24
SIP1	P32578	YRF1-6	YNL339C	5580 nt		7.33	□□□□□ -1.24
SIP1	P32578	YRF1-7	YPL283C	5580 nt		7.33	□□□□□ -1.24
SIP1	P32578	DDI1	YER143W	1287 nt		7.32	□□□□□ -1.24
SIP1	P32578	OYE2	YHR179W	1203 nt		7.32	□□□□□ -1.24

Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 54.7 ms