Protein–RNA interactions for Protein: P22314

UBA1, Ubiquitin-like modifier-activating enzyme 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,058 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBA1P22314 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
UBA1P22314 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC29.8■■■□□ 2.36
UBA1P22314 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
UBA1P22314 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
UBA1P22314 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
UBA1P22314 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
UBA1P22314 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
UBA1P22314 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
UBA1P22314 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
UBA1P22314 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
UBA1P22314 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
UBA1P22314 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
UBA1P22314 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
UBA1P22314 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
UBA1P22314 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
UBA1P22314 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
UBA1P22314 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
UBA1P22314 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
UBA1P22314 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
UBA1P22314 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
UBA1P22314 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
UBA1P22314 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.34
UBA1P22314 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
UBA1P22314 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
UBA1P22314 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
UBA1P22314 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC29.67■■■□□ 2.34
UBA1P22314 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
UBA1P22314 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
UBA1P22314 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
UBA1P22314 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
UBA1P22314 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
UBA1P22314 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.65■■■□□ 2.34
UBA1P22314 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
UBA1P22314 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
UBA1P22314 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
UBA1P22314 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
UBA1P22314 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC29.63■■■□□ 2.33
UBA1P22314 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC29.61■■■□□ 2.33
UBA1P22314 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
UBA1P22314 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
UBA1P22314 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
UBA1P22314 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
UBA1P22314 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
UBA1P22314 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
UBA1P22314 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC29.59■■■□□ 2.33
UBA1P22314 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
UBA1P22314 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC29.59■■■□□ 2.33
UBA1P22314 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
UBA1P22314 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
UBA1P22314 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
UBA1P22314 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
UBA1P22314 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
UBA1P22314 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
UBA1P22314 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
UBA1P22314 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC29.55■■■□□ 2.32
UBA1P22314 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
UBA1P22314 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
UBA1P22314 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC29.54■■■□□ 2.32
UBA1P22314 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC29.54■■■□□ 2.32
UBA1P22314 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
UBA1P22314 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
UBA1P22314 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
UBA1P22314 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC29.53■■■□□ 2.32
UBA1P22314 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
UBA1P22314 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
UBA1P22314 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
UBA1P22314 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
UBA1P22314 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
UBA1P22314 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
UBA1P22314 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
UBA1P22314 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
UBA1P22314 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
UBA1P22314 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
UBA1P22314 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
UBA1P22314 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
UBA1P22314 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
UBA1P22314 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
UBA1P22314 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
UBA1P22314 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
UBA1P22314 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
UBA1P22314 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC29.46■■■□□ 2.31
UBA1P22314 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
UBA1P22314 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
UBA1P22314 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
UBA1P22314 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.45■■■□□ 2.31
UBA1P22314 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.31
UBA1P22314 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
UBA1P22314 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
UBA1P22314 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
UBA1P22314 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
UBA1P22314 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
UBA1P22314 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
UBA1P22314 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
UBA1P22314 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
UBA1P22314 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
UBA1P22314 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.3
UBA1P22314 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
UBA1P22314 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.3
UBA1P22314 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
UBA1P22314 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms