Protein–RNA interactions for Protein: O43175

PHGDH, D-3-phosphoglycerate dehydrogenase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHGDHO43175 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PHGDHO43175 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PHGDHO43175 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PHGDHO43175 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PHGDHO43175 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
PHGDHO43175 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
PHGDHO43175 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PHGDHO43175 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PHGDHO43175 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PHGDHO43175 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PHGDHO43175 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PHGDHO43175 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PHGDHO43175 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PHGDHO43175 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PHGDHO43175 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PHGDHO43175 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PHGDHO43175 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PHGDHO43175 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PHGDHO43175 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PHGDHO43175 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PHGDHO43175 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PHGDHO43175 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PHGDHO43175 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PHGDHO43175 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PHGDHO43175 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PHGDHO43175 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PHGDHO43175 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PHGDHO43175 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PHGDHO43175 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PHGDHO43175 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PHGDHO43175 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PHGDHO43175 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC25.95■■□□□ 1.75
PHGDHO43175 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PHGDHO43175 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PHGDHO43175 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PHGDHO43175 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PHGDHO43175 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PHGDHO43175 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PHGDHO43175 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
PHGDHO43175 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PHGDHO43175 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
PHGDHO43175 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PHGDHO43175 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PHGDHO43175 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PHGDHO43175 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PHGDHO43175 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PHGDHO43175 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PHGDHO43175 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PHGDHO43175 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PHGDHO43175 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PHGDHO43175 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PHGDHO43175 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PHGDHO43175 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PHGDHO43175 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
PHGDHO43175 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
PHGDHO43175 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
PHGDHO43175 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PHGDHO43175 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PHGDHO43175 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PHGDHO43175 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PHGDHO43175 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
PHGDHO43175 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PHGDHO43175 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PHGDHO43175 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PHGDHO43175 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PHGDHO43175 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PHGDHO43175 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PHGDHO43175 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PHGDHO43175 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PHGDHO43175 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PHGDHO43175 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PHGDHO43175 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PHGDHO43175 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PHGDHO43175 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
PHGDHO43175 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PHGDHO43175 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PHGDHO43175 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
PHGDHO43175 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
PHGDHO43175 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PHGDHO43175 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PHGDHO43175 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PHGDHO43175 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PHGDHO43175 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PHGDHO43175 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PHGDHO43175 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PHGDHO43175 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PHGDHO43175 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PHGDHO43175 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PHGDHO43175 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PHGDHO43175 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PHGDHO43175 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PHGDHO43175 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PHGDHO43175 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PHGDHO43175 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PHGDHO43175 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PHGDHO43175 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PHGDHO43175 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PHGDHO43175 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PHGDHO43175 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PHGDHO43175 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 380 ms