Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKI3

VPREB3, Pre-B lymphocyte protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB3Q9UKI3 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
VPREB3Q9UKI3 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
VPREB3Q9UKI3 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
VPREB3Q9UKI3 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
VPREB3Q9UKI3 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
VPREB3Q9UKI3 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
VPREB3Q9UKI3 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
VPREB3Q9UKI3 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
VPREB3Q9UKI3 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
VPREB3Q9UKI3 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
VPREB3Q9UKI3 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
VPREB3Q9UKI3 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
VPREB3Q9UKI3 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
VPREB3Q9UKI3 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
VPREB3Q9UKI3 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
VPREB3Q9UKI3 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
VPREB3Q9UKI3 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
VPREB3Q9UKI3 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
VPREB3Q9UKI3 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
VPREB3Q9UKI3 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
VPREB3Q9UKI3 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
VPREB3Q9UKI3 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
VPREB3Q9UKI3 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
VPREB3Q9UKI3 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
VPREB3Q9UKI3 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
VPREB3Q9UKI3 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
VPREB3Q9UKI3 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
VPREB3Q9UKI3 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
VPREB3Q9UKI3 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
VPREB3Q9UKI3 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
VPREB3Q9UKI3 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
VPREB3Q9UKI3 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
VPREB3Q9UKI3 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
VPREB3Q9UKI3 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
VPREB3Q9UKI3 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
VPREB3Q9UKI3 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
VPREB3Q9UKI3 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
VPREB3Q9UKI3 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
VPREB3Q9UKI3 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
VPREB3Q9UKI3 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
VPREB3Q9UKI3 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
VPREB3Q9UKI3 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
VPREB3Q9UKI3 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
VPREB3Q9UKI3 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
VPREB3Q9UKI3 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
VPREB3Q9UKI3 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
VPREB3Q9UKI3 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
VPREB3Q9UKI3 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
VPREB3Q9UKI3 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
VPREB3Q9UKI3 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
VPREB3Q9UKI3 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
VPREB3Q9UKI3 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
VPREB3Q9UKI3 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
VPREB3Q9UKI3 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
VPREB3Q9UKI3 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
VPREB3Q9UKI3 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
VPREB3Q9UKI3 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
VPREB3Q9UKI3 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
VPREB3Q9UKI3 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
VPREB3Q9UKI3 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
VPREB3Q9UKI3 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
VPREB3Q9UKI3 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
VPREB3Q9UKI3 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
VPREB3Q9UKI3 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
VPREB3Q9UKI3 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
VPREB3Q9UKI3 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
VPREB3Q9UKI3 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
VPREB3Q9UKI3 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
VPREB3Q9UKI3 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
VPREB3Q9UKI3 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
VPREB3Q9UKI3 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
VPREB3Q9UKI3 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.19
VPREB3Q9UKI3 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
VPREB3Q9UKI3 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
VPREB3Q9UKI3 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
VPREB3Q9UKI3 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
VPREB3Q9UKI3 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
VPREB3Q9UKI3 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
VPREB3Q9UKI3 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
VPREB3Q9UKI3 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
VPREB3Q9UKI3 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
VPREB3Q9UKI3 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
VPREB3Q9UKI3 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
VPREB3Q9UKI3 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
VPREB3Q9UKI3 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
VPREB3Q9UKI3 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
VPREB3Q9UKI3 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
VPREB3Q9UKI3 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
VPREB3Q9UKI3 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
VPREB3Q9UKI3 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
VPREB3Q9UKI3 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
VPREB3Q9UKI3 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
VPREB3Q9UKI3 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
VPREB3Q9UKI3 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
VPREB3Q9UKI3 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
VPREB3Q9UKI3 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
VPREB3Q9UKI3 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
VPREB3Q9UKI3 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
VPREB3Q9UKI3 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
VPREB3Q9UKI3 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.3 ms