Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVX2

TMEM106C, Transmembrane protein 106C, humanhuman

Predictions only

Length 250 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM106CQ9BVX2 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TMEM106CQ9BVX2 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TMEM106CQ9BVX2 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TMEM106CQ9BVX2 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TMEM106CQ9BVX2 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TMEM106CQ9BVX2 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TMEM106CQ9BVX2 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
TMEM106CQ9BVX2 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TMEM106CQ9BVX2 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TMEM106CQ9BVX2 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TMEM106CQ9BVX2 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TMEM106CQ9BVX2 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TMEM106CQ9BVX2 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
TMEM106CQ9BVX2 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
TMEM106CQ9BVX2 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TMEM106CQ9BVX2 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TMEM106CQ9BVX2 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TMEM106CQ9BVX2 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TMEM106CQ9BVX2 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TMEM106CQ9BVX2 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TMEM106CQ9BVX2 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TMEM106CQ9BVX2 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TMEM106CQ9BVX2 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TMEM106CQ9BVX2 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TMEM106CQ9BVX2 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TMEM106CQ9BVX2 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TMEM106CQ9BVX2 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TMEM106CQ9BVX2 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
TMEM106CQ9BVX2 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TMEM106CQ9BVX2 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TMEM106CQ9BVX2 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TMEM106CQ9BVX2 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMEM106CQ9BVX2 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMEM106CQ9BVX2 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMEM106CQ9BVX2 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMEM106CQ9BVX2 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMEM106CQ9BVX2 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMEM106CQ9BVX2 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMEM106CQ9BVX2 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
TMEM106CQ9BVX2 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMEM106CQ9BVX2 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
TMEM106CQ9BVX2 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMEM106CQ9BVX2 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMEM106CQ9BVX2 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMEM106CQ9BVX2 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMEM106CQ9BVX2 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TMEM106CQ9BVX2 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TMEM106CQ9BVX2 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TMEM106CQ9BVX2 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TMEM106CQ9BVX2 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TMEM106CQ9BVX2 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TMEM106CQ9BVX2 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TMEM106CQ9BVX2 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TMEM106CQ9BVX2 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TMEM106CQ9BVX2 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TMEM106CQ9BVX2 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TMEM106CQ9BVX2 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TMEM106CQ9BVX2 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TMEM106CQ9BVX2 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TMEM106CQ9BVX2 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TMEM106CQ9BVX2 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TMEM106CQ9BVX2 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TMEM106CQ9BVX2 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TMEM106CQ9BVX2 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TMEM106CQ9BVX2 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TMEM106CQ9BVX2 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TMEM106CQ9BVX2 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TMEM106CQ9BVX2 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TMEM106CQ9BVX2 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TMEM106CQ9BVX2 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
TMEM106CQ9BVX2 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TMEM106CQ9BVX2 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
TMEM106CQ9BVX2 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TMEM106CQ9BVX2 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TMEM106CQ9BVX2 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TMEM106CQ9BVX2 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TMEM106CQ9BVX2 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TMEM106CQ9BVX2 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TMEM106CQ9BVX2 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TMEM106CQ9BVX2 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TMEM106CQ9BVX2 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
TMEM106CQ9BVX2 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TMEM106CQ9BVX2 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TMEM106CQ9BVX2 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TMEM106CQ9BVX2 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TMEM106CQ9BVX2 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TMEM106CQ9BVX2 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TMEM106CQ9BVX2 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TMEM106CQ9BVX2 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TMEM106CQ9BVX2 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TMEM106CQ9BVX2 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TMEM106CQ9BVX2 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TMEM106CQ9BVX2 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TMEM106CQ9BVX2 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TMEM106CQ9BVX2 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TMEM106CQ9BVX2 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TMEM106CQ9BVX2 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TMEM106CQ9BVX2 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
TMEM106CQ9BVX2 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TMEM106CQ9BVX2 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.3 ms