Protein–RNA interactions for Protein: Q5XLA6

CARD17, Caspase recruitment domain-containing protein 17, humanhuman

Predictions only

Length 110 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARD17Q5XLA6 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CARD17Q5XLA6 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CARD17Q5XLA6 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CARD17Q5XLA6 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CARD17Q5XLA6 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CARD17Q5XLA6 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CARD17Q5XLA6 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CARD17Q5XLA6 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CARD17Q5XLA6 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CARD17Q5XLA6 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CARD17Q5XLA6 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CARD17Q5XLA6 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CARD17Q5XLA6 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CARD17Q5XLA6 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CARD17Q5XLA6 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CARD17Q5XLA6 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CARD17Q5XLA6 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CARD17Q5XLA6 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CARD17Q5XLA6 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CARD17Q5XLA6 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CARD17Q5XLA6 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CARD17Q5XLA6 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CARD17Q5XLA6 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CARD17Q5XLA6 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CARD17Q5XLA6 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CARD17Q5XLA6 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CARD17Q5XLA6 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CARD17Q5XLA6 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CARD17Q5XLA6 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CARD17Q5XLA6 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CARD17Q5XLA6 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CARD17Q5XLA6 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CARD17Q5XLA6 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CARD17Q5XLA6 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CARD17Q5XLA6 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CARD17Q5XLA6 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CARD17Q5XLA6 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CARD17Q5XLA6 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CARD17Q5XLA6 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CARD17Q5XLA6 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CARD17Q5XLA6 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CARD17Q5XLA6 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CARD17Q5XLA6 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CARD17Q5XLA6 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CARD17Q5XLA6 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CARD17Q5XLA6 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CARD17Q5XLA6 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CARD17Q5XLA6 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CARD17Q5XLA6 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CARD17Q5XLA6 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CARD17Q5XLA6 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CARD17Q5XLA6 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CARD17Q5XLA6 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CARD17Q5XLA6 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CARD17Q5XLA6 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CARD17Q5XLA6 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CARD17Q5XLA6 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CARD17Q5XLA6 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CARD17Q5XLA6 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CARD17Q5XLA6 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CARD17Q5XLA6 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CARD17Q5XLA6 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CARD17Q5XLA6 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CARD17Q5XLA6 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CARD17Q5XLA6 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CARD17Q5XLA6 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CARD17Q5XLA6 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CARD17Q5XLA6 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CARD17Q5XLA6 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CARD17Q5XLA6 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CARD17Q5XLA6 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CARD17Q5XLA6 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CARD17Q5XLA6 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CARD17Q5XLA6 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CARD17Q5XLA6 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CARD17Q5XLA6 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CARD17Q5XLA6 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CARD17Q5XLA6 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CARD17Q5XLA6 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CARD17Q5XLA6 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CARD17Q5XLA6 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CARD17Q5XLA6 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CARD17Q5XLA6 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CARD17Q5XLA6 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CARD17Q5XLA6 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CARD17Q5XLA6 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CARD17Q5XLA6 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CARD17Q5XLA6 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CARD17Q5XLA6 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CARD17Q5XLA6 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CARD17Q5XLA6 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CARD17Q5XLA6 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CARD17Q5XLA6 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CARD17Q5XLA6 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CARD17Q5XLA6 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CARD17Q5XLA6 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CARD17Q5XLA6 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CARD17Q5XLA6 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CARD17Q5XLA6 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CARD17Q5XLA6 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.5 ms