Protein–RNA interactions for Protein: Q12033

RIM20, pH-response regulator protein palA/RIM20, yeastyeast

Predictions only

Length 661 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RIM20Q12033 UBX4YMR067C 1251 nt2.53□□□□□ -2
RIM20Q12033 YBR197CYBR197C 654 nt2.53□□□□□ -2
RIM20Q12033 PRP6YBR055C 2700 nt2.53□□□□□ -2
RIM20Q12033 MET32YDR253C 576 nt2.52□□□□□ -2.01
RIM20Q12033 AYR1YIL124W 894 nt2.52□□□□□ -2.01
RIM20Q12033 APQ13YJL075C 417 nt2.52□□□□□ -2.01
RIM20Q12033 YJR023CYJR023C 402 nt2.52□□□□□ -2.01
RIM20Q12033 YPL080CYPL080C 327 nt2.52□□□□□ -2.01
RIM20Q12033 SSD1YDR293C 3753 nt2.52□□□□□ -2.01
RIM20Q12033 LEU3YLR451W 2661 nt2.51□□□□□ -2.01
RIM20Q12033 YPR089WYPR089W 2667 nt2.51□□□□□ -2.01
RIM20Q12033 ASG1YIL130W 2895 nt2.51□□□□□ -2.01
RIM20Q12033 FAR11YNL127W 2862 nt2.51□□□□□ -2.01
RIM20Q12033 AHC2YCR082W 387 nt2.51□□□□□ -2.01
RIM20Q12033 PRM8YGL053W 714 nt2.51□□□□□ -2.01
RIM20Q12033 RPS29AYLR388W 171 nt2.51□□□□□ -2.01
RIM20Q12033 PHO80YOL001W 882 nt2.51□□□□□ -2.01
RIM20Q12033 YPR145C-AYPR145C-A 237 nt2.51□□□□□ -2.01
RIM20Q12033 IRA2YOL081W 9240 nt2.51□□□□□ -2.01
RIM20Q12033 SKT5YBL061C 2091 nt2.51□□□□□ -2.01
RIM20Q12033 NDD1YOR372C 1665 nt2.5□□□□□ -2.01
RIM20Q12033 NUP170YBL079W 4509 nt2.5□□□□□ -2.01
RIM20Q12033 YDR209CYDR209C 414 nt2.5□□□□□ -2.01
RIM20Q12033 GPI8YDR331W 1236 nt2.5□□□□□ -2.01
RIM20Q12033 RPS22BYLR367W 393 nt2.5□□□□□ -2.01
RIM20Q12033 MF(ALPHA)1YPL187W 498 nt2.5□□□□□ -2.01
RIM20Q12033 INP53YOR109W 3324 nt2.5□□□□□ -2.01
RIM20Q12033 HNT1YDL125C 477 nt2.49□□□□□ -2.01
RIM20Q12033 BRP1YGL007W 378 nt2.49□□□□□ -2.01
RIM20Q12033 YGL165CYGL165C 579 nt2.49□□□□□ -2.01
RIM20Q12033 ACB1YGR037C 264 nt2.49□□□□□ -2.01
RIM20Q12033 TIM10YHR005C-A 282 nt2.49□□□□□ -2.01
RIM20Q12033 CIC1YHR052W 1131 nt2.49□□□□□ -2.01
RIM20Q12033 YIL058WYIL058W 285 nt2.49□□□□□ -2.01
RIM20Q12033 CMS1YLR003C 876 nt2.49□□□□□ -2.01
RIM20Q12033 DGR1YNL130C-A 147 nt2.49□□□□□ -2.01
RIM20Q12033 YNL146C-AYNL146C-A 195 nt2.49□□□□□ -2.01
RIM20Q12033 RPL25YOL127W 429 nt2.49□□□□□ -2.01
RIM20Q12033 HOS4YIL112W 3252 nt2.49□□□□□ -2.01
RIM20Q12033 PHR1YOR386W 1698 nt2.48□□□□□ -2.01
RIM20Q12033 TAE2YPL009C 3117 nt2.48□□□□□ -2.01
RIM20Q12033 IST3YIR005W 447 nt2.48□□□□□ -2.01
RIM20Q12033 HYR1YIR037W 492 nt2.48□□□□□ -2.01
RIM20Q12033 PEP8YJL053W 1140 nt2.48□□□□□ -2.01
RIM20Q12033 YKL044WYKL044W 321 nt2.48□□□□□ -2.01
RIM20Q12033 PEX17YNL214W 600 nt2.48□□□□□ -2.01
RIM20Q12033 KSP1YHR082C 3090 nt2.48□□□□□ -2.01
RIM20Q12033 HSC82YMR186W 2118 nt2.48□□□□□ -2.01
RIM20Q12033 DPB11YJL090C 2295 nt2.48□□□□□ -2.01
RIM20Q12033 SMY2YBR172C 2223 nt2.48□□□□□ -2.01
RIM20Q12033 CBF2YGR140W 2871 nt2.47□□□□□ -2.01
RIM20Q12033 YNL018CYNL018C 1839 nt2.47□□□□□ -2.01
RIM20Q12033 YER119C-AYER119C-A 372 nt2.47□□□□□ -2.01
RIM20Q12033 TPM2YIL138C 486 nt2.47□□□□□ -2.01
RIM20Q12033 SPC1YJR010C-A 285 nt2.47□□□□□ -2.01
RIM20Q12033 TRS20YBR254C 528 nt2.47□□□□□ -2.01
RIM20Q12033 KRE33YNL132W 3171 nt2.46□□□□□ -2.02
RIM20Q12033 YKU80YMR106C 1890 nt2.46□□□□□ -2.02
RIM20Q12033 SDC1YDR469W 528 nt2.46□□□□□ -2.02
RIM20Q12033 MTC7YEL033W 420 nt2.46□□□□□ -2.02
RIM20Q12033 EAF6YJR082C 342 nt2.46□□□□□ -2.02
RIM20Q12033 RPB11YOL005C 363 nt2.46□□□□□ -2.02
RIM20Q12033 YOL013W-BYOL013W-B 291 nt2.46□□□□□ -2.02
RIM20Q12033 TOA1YOR194C 861 nt2.46□□□□□ -2.02
RIM20Q12033 SWA2YDR320C 2007 nt2.46□□□□□ -2.02
RIM20Q12033 PRK1YIL095W 2433 nt2.46□□□□□ -2.02
RIM20Q12033 PES4YFR023W 1836 nt2.45□□□□□ -2.02
RIM20Q12033 TRS130YMR218C 3309 nt2.45□□□□□ -2.02
RIM20Q12033 IRC4YDR540C 540 nt2.45□□□□□ -2.02
RIM20Q12033 YLR458WYLR458W 381 nt2.45□□□□□ -2.02
RIM20Q12033 SVS1YPL163C 783 nt2.45□□□□□ -2.02
RIM20Q12033 BRE1YDL074C 2103 nt2.45□□□□□ -2.02
RIM20Q12033 MDM32YOR147W 1869 nt2.45□□□□□ -2.02
RIM20Q12033 VPS16YPL045W 2397 nt2.45□□□□□ -2.02
RIM20Q12033 SNU56YDR240C 1479 nt2.45□□□□□ -2.02
RIM20Q12033 RNR4YGR180C 1038 nt2.44□□□□□ -2.02
RIM20Q12033 RAM2YKL019W 951 nt2.44□□□□□ -2.02
RIM20Q12033 MGR1YCL044C 1254 nt2.44□□□□□ -2.02
RIM20Q12033 YEL043WYEL043W 2871 nt2.43□□□□□ -2.02
RIM20Q12033 ORC2YBR060C 1863 nt2.43□□□□□ -2.02
RIM20Q12033 REV3YPL167C 4515 nt2.43□□□□□ -2.02
RIM20Q12033 RTR2YDR066C 591 nt2.43□□□□□ -2.02
RIM20Q12033 RPL40AYIL148W 387 nt2.43□□□□□ -2.02
RIM20Q12033 ICY1YMR195W 384 nt2.43□□□□□ -2.02
RIM20Q12033 URA10YMR271C 684 nt2.43□□□□□ -2.02
RIM20Q12033 IGO1YNL157W 507 nt2.43□□□□□ -2.02
RIM20Q12033 YPL039WYPL039W 951 nt2.43□□□□□ -2.02
RIM20Q12033 BRO1YPL084W 2535 nt2.43□□□□□ -2.02
RIM20Q12033 ROY1YMR258C 1662 nt2.43□□□□□ -2.02
RIM20Q12033 SAK1YER129W 3429 nt2.43□□□□□ -2.02
RIM20Q12033 SEC31YDL195W 3822 nt2.43□□□□□ -2.02
RIM20Q12033 RGL1YPL066W 1440 nt2.42□□□□□ -2.02
RIM20Q12033 UTP13YLR222C 2454 nt2.42□□□□□ -2.02
RIM20Q12033 YDR239CYDR239C 2364 nt2.42□□□□□ -2.02
RIM20Q12033 YDR220CYDR220C 294 nt2.42□□□□□ -2.02
RIM20Q12033 TWF1YGR080W 999 nt2.42□□□□□ -2.02
RIM20Q12033 YIL030W-AYIL030W-A 339 nt2.42□□□□□ -2.02
RIM20Q12033 SIP18YMR175W 240 nt2.42□□□□□ -2.02
RIM20Q12033 YOR105WYOR105W 327 nt2.42□□□□□ -2.02
RIM20Q12033 SNU114YKL173W 3027 nt2.42□□□□□ -2.02
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 39.8 ms