Protein–RNA interactions for Protein: Q05C16

LRRC63, Leucine-rich repeat-containing protein 63, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC63Q05C16 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LRRC63Q05C16 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LRRC63Q05C16 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LRRC63Q05C16 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LRRC63Q05C16 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LRRC63Q05C16 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LRRC63Q05C16 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LRRC63Q05C16 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LRRC63Q05C16 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LRRC63Q05C16 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LRRC63Q05C16 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LRRC63Q05C16 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LRRC63Q05C16 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LRRC63Q05C16 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LRRC63Q05C16 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LRRC63Q05C16 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LRRC63Q05C16 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LRRC63Q05C16 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LRRC63Q05C16 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LRRC63Q05C16 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LRRC63Q05C16 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LRRC63Q05C16 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LRRC63Q05C16 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LRRC63Q05C16 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LRRC63Q05C16 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LRRC63Q05C16 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LRRC63Q05C16 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LRRC63Q05C16 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LRRC63Q05C16 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LRRC63Q05C16 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LRRC63Q05C16 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LRRC63Q05C16 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LRRC63Q05C16 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
LRRC63Q05C16 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LRRC63Q05C16 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LRRC63Q05C16 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
LRRC63Q05C16 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LRRC63Q05C16 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LRRC63Q05C16 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LRRC63Q05C16 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LRRC63Q05C16 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LRRC63Q05C16 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LRRC63Q05C16 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LRRC63Q05C16 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LRRC63Q05C16 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LRRC63Q05C16 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LRRC63Q05C16 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LRRC63Q05C16 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
LRRC63Q05C16 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LRRC63Q05C16 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LRRC63Q05C16 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LRRC63Q05C16 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
LRRC63Q05C16 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LRRC63Q05C16 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LRRC63Q05C16 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LRRC63Q05C16 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LRRC63Q05C16 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LRRC63Q05C16 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRRC63Q05C16 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRRC63Q05C16 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRRC63Q05C16 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRRC63Q05C16 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRRC63Q05C16 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRRC63Q05C16 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRRC63Q05C16 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
LRRC63Q05C16 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRRC63Q05C16 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRRC63Q05C16 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRRC63Q05C16 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRRC63Q05C16 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRRC63Q05C16 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRRC63Q05C16 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRRC63Q05C16 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRRC63Q05C16 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRRC63Q05C16 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRRC63Q05C16 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRRC63Q05C16 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRRC63Q05C16 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRRC63Q05C16 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRRC63Q05C16 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRRC63Q05C16 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRRC63Q05C16 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRRC63Q05C16 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRRC63Q05C16 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRRC63Q05C16 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRRC63Q05C16 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRRC63Q05C16 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRRC63Q05C16 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRRC63Q05C16 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRRC63Q05C16 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LRRC63Q05C16 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LRRC63Q05C16 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LRRC63Q05C16 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LRRC63Q05C16 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LRRC63Q05C16 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LRRC63Q05C16 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LRRC63Q05C16 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LRRC63Q05C16 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LRRC63Q05C16 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
LRRC63Q05C16 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms