Protein–RNA interactions for Protein: Q02100

SKO1, CRE-binding bZIP protein SKO1, yeastyeast

Predictions only

Length 647 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SKO1Q02100 RTR2YDR066C 591 nt2.27□□□□□ -2.05
SKO1Q02100 RNR4YGR180C 1038 nt2.27□□□□□ -2.05
SKO1Q02100 RPL40AYIL148W 387 nt2.27□□□□□ -2.05
SKO1Q02100 EAF6YJR082C 342 nt2.27□□□□□ -2.05
SKO1Q02100 SHE2YKL130C 741 nt2.27□□□□□ -2.05
SKO1Q02100 PAU8YAL068C 363 nt2.27□□□□□ -2.05
SKO1Q02100 RPL37AYLR185W 267 nt2.27□□□□□ -2.05
SKO1Q02100 KTI11YBL071W-A 249 nt2.27□□□□□ -2.05
SKO1Q02100 RPB11YOL005C 363 nt2.27□□□□□ -2.05
SKO1Q02100 PAU20YOL161C 363 nt2.27□□□□□ -2.05
SKO1Q02100 UTP13YLR222C 2454 nt2.27□□□□□ -2.05
SKO1Q02100 TRS130YMR218C 3309 nt2.27□□□□□ -2.05
SKO1Q02100 OSW7YFR039C 1533 nt2.27□□□□□ -2.05
SKO1Q02100 EDS1YBR033W 2760 nt2.27□□□□□ -2.05
SKO1Q02100 MDM32YOR147W 1869 nt2.26□□□□□ -2.05
SKO1Q02100 BUB1YGR188C 3066 nt2.26□□□□□ -2.05
SKO1Q02100 DNA2YHR164C 4569 nt2.26□□□□□ -2.05
SKO1Q02100 UBP11YKR098C 2154 nt2.26□□□□□ -2.05
SKO1Q02100 PET191YJR034W 327 nt2.26□□□□□ -2.05
SKO1Q02100 CCW14YLR390W-A 717 nt2.26□□□□□ -2.05
SKO1Q02100 RPS7BYNL096C 573 nt2.26□□□□□ -2.05
SKO1Q02100 YOR105WYOR105W 327 nt2.26□□□□□ -2.05
SKO1Q02100 ATP15YPL271W 189 nt2.26□□□□□ -2.05
SKO1Q02100 NAB6YML117W 3405 nt2.26□□□□□ -2.05
SKO1Q02100 GIS1YDR096W 2685 nt2.26□□□□□ -2.05
SKO1Q02100 FKS3YMR306W 5358 nt2.26□□□□□ -2.05
SKO1Q02100 NUP100YKL068W 2880 nt2.25□□□□□ -2.05
SKO1Q02100 SRO77YBL106C 3033 nt2.25□□□□□ -2.05
SKO1Q02100 YFR056CYFR056C 369 nt2.25□□□□□ -2.05
SKO1Q02100 REV1YOR346W 2958 nt2.25□□□□□ -2.05
SKO1Q02100 TCB2YNL087W 3537 nt2.25□□□□□ -2.05
SKO1Q02100 PFF1YBR074W 2931 nt2.25□□□□□ -2.05
SKO1Q02100 SSY1YDR160W 2559 nt2.24□□□□□ -2.05
SKO1Q02100 MRP10YDL045W-A 288 nt2.24□□□□□ -2.05
SKO1Q02100 YRB1YDR002W 606 nt2.24□□□□□ -2.05
SKO1Q02100 FMP16YDR070C 282 nt2.24□□□□□ -2.05
SKO1Q02100 TIM9YEL020W-A 264 nt2.24□□□□□ -2.05
SKO1Q02100 YPL197CYPL197C 414 nt2.24□□□□□ -2.05
SKO1Q02100 YBR209WYBR209W 318 nt2.24□□□□□ -2.05
SKO1Q02100 PTC5YOR090C 1719 nt2.24□□□□□ -2.05
SKO1Q02100 RAV1YJR033C 4074 nt2.24□□□□□ -2.05
SKO1Q02100 DNF1YER166W 4716 nt2.23□□□□□ -2.05
SKO1Q02100 YKR078WYKR078W 1758 nt2.23□□□□□ -2.05
SKO1Q02100 YGL014C-AYGL014C-A 162 nt2.23□□□□□ -2.05
SKO1Q02100 RPL9AYGL147C 576 nt2.23□□□□□ -2.05
SKO1Q02100 YGR290WYGR290W 444 nt2.23□□□□□ -2.05
SKO1Q02100 TIM8YJR135W-A 264 nt2.23□□□□□ -2.05
SKO1Q02100 ICY1YMR195W 384 nt2.23□□□□□ -2.05
SKO1Q02100 LSM7YNL147W 348 nt2.23□□□□□ -2.05
SKO1Q02100 YOL013W-BYOL013W-B 291 nt2.23□□□□□ -2.05
SKO1Q02100 ATX2YOR079C 942 nt2.23□□□□□ -2.05
SKO1Q02100 ATP3YBR039W 936 nt2.23□□□□□ -2.05
SKO1Q02100 YEF3YLR249W 3135 nt2.23□□□□□ -2.05
SKO1Q02100 YJL070CYJL070C 2667 nt2.22□□□□□ -2.05
SKO1Q02100 NAN1YPL126W 2691 nt2.22□□□□□ -2.05
SKO1Q02100 YDL025W-AYDL025W-A 105 nt2.22□□□□□ -2.05
SKO1Q02100 MTC7YEL033W 420 nt2.22□□□□□ -2.05
SKO1Q02100 YJL127C-BYJL127C-B 159 nt2.22□□□□□ -2.05
SKO1Q02100 YLR031WYLR031W 561 nt2.22□□□□□ -2.05
SKO1Q02100 RPS17AYML024W 411 nt2.22□□□□□ -2.05
SKO1Q02100 MSL5YLR116W 1431 nt2.22□□□□□ -2.05
SKO1Q02100 NCL1YBL024W 2055 nt2.22□□□□□ -2.05
SKO1Q02100 HAA1YPR008W 2085 nt2.22□□□□□ -2.05
SKO1Q02100 RRP6YOR001W 2202 nt2.22□□□□□ -2.05
SKO1Q02100 MLH1YMR167W 2310 nt2.22□□□□□ -2.05
SKO1Q02100 NEW1YPL226W 3591 nt2.21□□□□□ -2.06
SKO1Q02100 YFH1YDL120W 525 nt2.21□□□□□ -2.06
SKO1Q02100 YPK1YKL126W 2043 nt2.21□□□□□ -2.06
SKO1Q02100 YLR154W-AYLR154W-A 186 nt2.21□□□□□ -2.06
SKO1Q02100 YLR379WYLR379W 375 nt2.21□□□□□ -2.06
SKO1Q02100 IRC16YPR038W 360 nt2.21□□□□□ -2.06
SKO1Q02100 snR43snR43 209 nt2.21□□□□□ -2.06
SKO1Q02100 YDR186CYDR186C 2634 nt2.2□□□□□ -2.06
SKO1Q02100 BNA7YDR428C 786 nt2.2□□□□□ -2.06
SKO1Q02100 YEL018C-AYEL018C-A 534 nt2.2□□□□□ -2.06
SKO1Q02100 YPS5YGL259W 498 nt2.2□□□□□ -2.06
SKO1Q02100 YHR032W-AYHR032W-A 180 nt2.2□□□□□ -2.06
SKO1Q02100 YKL066WYKL066W 444 nt2.2□□□□□ -2.06
SKO1Q02100 RPL36BYPL249C-A 303 nt2.2□□□□□ -2.06
SKO1Q02100 BCK1YJL095W 4437 nt2.2□□□□□ -2.06
SKO1Q02100 MPH1YIR002C 2982 nt2.19□□□□□ -2.06
SKO1Q02100 YJL181WYJL181W 1836 nt2.19□□□□□ -2.06
SKO1Q02100 PDR3YBL005W 2931 nt2.19□□□□□ -2.06
SKO1Q02100 TAE2YPL009C 3117 nt2.19□□□□□ -2.06
SKO1Q02100 YDR194W-AYDR194W-A 153 nt2.19□□□□□ -2.06
SKO1Q02100 YAP3YHL009C 993 nt2.19□□□□□ -2.06
SKO1Q02100 YJR140W-AYJR140W-A 150 nt2.19□□□□□ -2.06
SKO1Q02100 YKL068W-AYKL068W-A 237 nt2.19□□□□□ -2.06
SKO1Q02100 UTP30YKR060W 825 nt2.19□□□□□ -2.06
SKO1Q02100 AIM32YML050W 936 nt2.19□□□□□ -2.06
SKO1Q02100 YMR194C-AYMR194C-A 225 nt2.19□□□□□ -2.06
SKO1Q02100 VTI1YMR197C 654 nt2.19□□□□□ -2.06
SKO1Q02100 MRPL44YMR225C 297 nt2.19□□□□□ -2.06
SKO1Q02100 GPI15YNL038W 690 nt2.19□□□□□ -2.06
SKO1Q02100 YNL122CYNL122C 348 nt2.19□□□□□ -2.06
SKO1Q02100 GIP3YPL137C 3831 nt2.19□□□□□ -2.06
SKO1Q02100 RSA1YPL193W 1146 nt2.19□□□□□ -2.06
SKO1Q02100 SPE1YKL184W 1401 nt2.18□□□□□ -2.06
SKO1Q02100 SMB1YER029C 591 nt2.18□□□□□ -2.06
SKO1Q02100 CAJ1YER048C 1176 nt2.18□□□□□ -2.06
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