Protein–RNA interactions for Protein: Q01196

RUNX1, Runt-related transcription factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX1Q01196 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RUNX1Q01196 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RUNX1Q01196 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RUNX1Q01196 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RUNX1Q01196 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RUNX1Q01196 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RUNX1Q01196 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RUNX1Q01196 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RUNX1Q01196 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RUNX1Q01196 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RUNX1Q01196 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RUNX1Q01196 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RUNX1Q01196 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RUNX1Q01196 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RUNX1Q01196 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RUNX1Q01196 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RUNX1Q01196 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RUNX1Q01196 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RUNX1Q01196 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RUNX1Q01196 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RUNX1Q01196 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RUNX1Q01196 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RUNX1Q01196 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RUNX1Q01196 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RUNX1Q01196 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RUNX1Q01196 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RUNX1Q01196 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RUNX1Q01196 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RUNX1Q01196 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RUNX1Q01196 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RUNX1Q01196 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RUNX1Q01196 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RUNX1Q01196 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RUNX1Q01196 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RUNX1Q01196 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RUNX1Q01196 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RUNX1Q01196 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RUNX1Q01196 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RUNX1Q01196 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RUNX1Q01196 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RUNX1Q01196 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RUNX1Q01196 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RUNX1Q01196 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RUNX1Q01196 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RUNX1Q01196 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RUNX1Q01196 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RUNX1Q01196 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RUNX1Q01196 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RUNX1Q01196 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RUNX1Q01196 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RUNX1Q01196 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RUNX1Q01196 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
RUNX1Q01196 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
RUNX1Q01196 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RUNX1Q01196 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RUNX1Q01196 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RUNX1Q01196 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RUNX1Q01196 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RUNX1Q01196 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RUNX1Q01196 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RUNX1Q01196 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RUNX1Q01196 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RUNX1Q01196 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RUNX1Q01196 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RUNX1Q01196 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RUNX1Q01196 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RUNX1Q01196 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RUNX1Q01196 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RUNX1Q01196 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RUNX1Q01196 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RUNX1Q01196 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RUNX1Q01196 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RUNX1Q01196 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RUNX1Q01196 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RUNX1Q01196 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
RUNX1Q01196 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
RUNX1Q01196 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RUNX1Q01196 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
RUNX1Q01196 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RUNX1Q01196 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
RUNX1Q01196 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
RUNX1Q01196 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
RUNX1Q01196 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
RUNX1Q01196 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
RUNX1Q01196 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RUNX1Q01196 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RUNX1Q01196 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RUNX1Q01196 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RUNX1Q01196 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RUNX1Q01196 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
RUNX1Q01196 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RUNX1Q01196 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RUNX1Q01196 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RUNX1Q01196 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RUNX1Q01196 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RUNX1Q01196 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
RUNX1Q01196 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RUNX1Q01196 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RUNX1Q01196 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RUNX1Q01196 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.4 ms