Protein–RNA interactions for Protein: P16550

APA1, Protein APA1, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
APA1P16550 DDR48YMR173W 1293 nt2.75□□□□□ -1.97
APA1P16550 SWM2YNR004W 441 nt2.75□□□□□ -1.97
APA1P16550 INP51YIL002C 2841 nt2.75□□□□□ -1.97
APA1P16550 UBP14YBR058C 2346 nt2.75□□□□□ -1.97
APA1P16550 YCR064CYCR064C 411 nt2.74□□□□□ -1.97
APA1P16550 AAD16YFL057C 459 nt2.74□□□□□ -1.97
APA1P16550 PNC1YGL037C 651 nt2.74□□□□□ -1.97
APA1P16550 YGR050CYGR050C 357 nt2.74□□□□□ -1.97
APA1P16550 YHR086W-AYHR086W-A 162 nt2.74□□□□□ -1.97
APA1P16550 RPF1YHR088W 888 nt2.74□□□□□ -1.97
APA1P16550 MRPL33YMR286W 261 nt2.74□□□□□ -1.97
APA1P16550 RPL25YOL127W 429 nt2.74□□□□□ -1.97
APA1P16550 YPK1YKL126W 2043 nt2.74□□□□□ -1.97
APA1P16550 KAP123YER110C 3342 nt2.74□□□□□ -1.97
APA1P16550 YKR078WYKR078W 1758 nt2.74□□□□□ -1.97
APA1P16550 SGM1YJR134C 2124 nt2.74□□□□□ -1.97
APA1P16550 SKT5YBL061C 2091 nt2.73□□□□□ -1.97
APA1P16550 EDS1YBR033W 2760 nt2.73□□□□□ -1.97
APA1P16550 ASG1YIL130W 2895 nt2.73□□□□□ -1.97
APA1P16550 UBP11YKR098C 2154 nt2.73□□□□□ -1.97
APA1P16550 DNA2YHR164C 4569 nt2.73□□□□□ -1.97
APA1P16550 YGL014C-AYGL014C-A 162 nt2.73□□□□□ -1.97
APA1P16550 ACB1YGR037C 264 nt2.73□□□□□ -1.97
APA1P16550 YHR214W-AYHR214W-A 486 nt2.73□□□□□ -1.97
APA1P16550 YKL202WYKL202W 582 nt2.73□□□□□ -1.97
APA1P16550 YAR068WYAR068W 486 nt2.73□□□□□ -1.97
APA1P16550 YML037CYML037C 1023 nt2.73□□□□□ -1.97
APA1P16550 SEN15YMR059W 387 nt2.73□□□□□ -1.97
APA1P16550 ICY1YMR195W 384 nt2.73□□□□□ -1.97
APA1P16550 SPE1YKL184W 1401 nt2.73□□□□□ -1.97
APA1P16550 NCL1YBL024W 2055 nt2.73□□□□□ -1.97
APA1P16550 YJL016WYJL016W 1686 nt2.73□□□□□ -1.97
APA1P16550 HMLALPHA2YCL067C 633 nt2.72□□□□□ -1.97
APA1P16550 MATALPHA2YCR039C 633 nt2.72□□□□□ -1.97
APA1P16550 MZM1YDR493W 372 nt2.72□□□□□ -1.97
APA1P16550 YEL018C-AYEL018C-A 534 nt2.72□□□□□ -1.97
APA1P16550 YER006C-AYER006C-A 318 nt2.72□□□□□ -1.97
APA1P16550 YPR203WYPR203W 309 nt2.72□□□□□ -1.97
APA1P16550 SUL1YBR294W 2580 nt2.72□□□□□ -1.97
APA1P16550 VPS64YDR200C 1815 nt2.72□□□□□ -1.97
APA1P16550 YHR078WYHR078W 1659 nt2.72□□□□□ -1.97
APA1P16550 NUP100YKL068W 2880 nt2.71□□□□□ -1.97
APA1P16550 MSL5YLR116W 1431 nt2.71□□□□□ -1.98
APA1P16550 ATP17YDR377W 306 nt2.71□□□□□ -1.98
APA1P16550 YEL030C-AYEL030C-A 315 nt2.71□□□□□ -1.98
APA1P16550 YGR121W-AYGR121W-A 216 nt2.71□□□□□ -1.98
APA1P16550 YOR385WYOR385W 873 nt2.71□□□□□ -1.98
APA1P16550 ATG13YPR185W 2217 nt2.7□□□□□ -1.98
APA1P16550 YER084W-AYER084W-A 513 nt2.7□□□□□ -1.98
APA1P16550 TIM8YJR135W-A 264 nt2.7□□□□□ -1.98
APA1P16550 TSC3YBR058C-A 243 nt2.7□□□□□ -1.98
APA1P16550 YSW1YBR148W 1830 nt2.7□□□□□ -1.98
APA1P16550 KRE33YNL132W 3171 nt2.69□□□□□ -1.98
APA1P16550 RRP6YOR001W 2202 nt2.69□□□□□ -1.98
APA1P16550 YKU80YMR106C 1890 nt2.69□□□□□ -1.98
APA1P16550 YGL165CYGL165C 579 nt2.69□□□□□ -1.98
APA1P16550 tT(UGU)Q1tT(UGU)Q1 76 nt2.69□□□□□ -1.98
APA1P16550 YJR079WYJR079W 330 nt2.69□□□□□ -1.98
APA1P16550 RPS7BYNL096C 573 nt2.69□□□□□ -1.98
APA1P16550 YOR248WYOR248W 303 nt2.69□□□□□ -1.98
APA1P16550 SOK2YMR016C 2358 nt2.69□□□□□ -1.98
APA1P16550 TOM1YDR457W 9807 nt2.69□□□□□ -1.98
APA1P16550 FLO11YIR019C 4104 nt2.68□□□□□ -1.98
APA1P16550 BCK1YJL095W 4437 nt2.68□□□□□ -1.98
APA1P16550 ESL1YIL151C 3357 nt2.68□□□□□ -1.98
APA1P16550 YFL019CYFL019C 354 nt2.68□□□□□ -1.98
APA1P16550 AYR1YIL124W 894 nt2.68□□□□□ -1.98
APA1P16550 RPL40AYIL148W 387 nt2.68□□□□□ -1.98
APA1P16550 YMR153C-AYMR153C-A 336 nt2.68□□□□□ -1.98
APA1P16550 PRM3YPL192C 402 nt2.68□□□□□ -1.98
APA1P16550 snR41snR41 95 nt2.68□□□□□ -1.98
APA1P16550 MUD2YKL074C 1584 nt2.68□□□□□ -1.98
APA1P16550 MOT1YPL082C 5604 nt2.68□□□□□ -1.98
APA1P16550 REV1YOR346W 2958 nt2.67□□□□□ -1.98
APA1P16550 RNH70YGR276C 1662 nt2.67□□□□□ -1.98
APA1P16550 YGR042WYGR042W 816 nt2.67□□□□□ -1.98
APA1P16550 TWF1YGR080W 999 nt2.67□□□□□ -1.98
APA1P16550 NBL1YHR199C-A 222 nt2.67□□□□□ -1.98
APA1P16550 YAL042C-AYAL042C-A 378 nt2.67□□□□□ -1.98
APA1P16550 AIM29YKR074W 468 nt2.67□□□□□ -1.98
APA1P16550 CCW14YLR390W-A 717 nt2.67□□□□□ -1.98
APA1P16550 YPL276WYPL276W 438 nt2.67□□□□□ -1.98
APA1P16550 SAP1YER047C 2694 nt2.67□□□□□ -1.98
APA1P16550 YPL150WYPL150W 2706 nt2.67□□□□□ -1.98
APA1P16550 ORC2YBR060C 1863 nt2.67□□□□□ -1.98
APA1P16550 YPP1YGR198W 2454 nt2.66□□□□□ -1.98
APA1P16550 YDL025W-AYDL025W-A 105 nt2.66□□□□□ -1.98
APA1P16550 YDR194W-AYDR194W-A 153 nt2.66□□□□□ -1.98
APA1P16550 YDR209CYDR209C 414 nt2.66□□□□□ -1.98
APA1P16550 YER188C-AYER188C-A 300 nt2.66□□□□□ -1.98
APA1P16550 RPC10YHR143W-A 213 nt2.66□□□□□ -1.98
APA1P16550 NUP82YJL061W 2142 nt2.66□□□□□ -1.98
APA1P16550 PRP8YHR165C 7242 nt2.66□□□□□ -1.98
APA1P16550 KEL2YGR238C 2649 nt2.66□□□□□ -1.98
APA1P16550 CBF2YGR140W 2871 nt2.66□□□□□ -1.98
APA1P16550 SLH1YGR271W 5904 nt2.66□□□□□ -1.98
APA1P16550 YDR098C-BYDR098C-B 5268 nt2.65□□□□□ -1.98
APA1P16550 YDR210C-DYDR210C-D 5268 nt2.65□□□□□ -1.98
APA1P16550 YDR316W-BYDR316W-B 5268 nt2.65□□□□□ -1.98
APA1P16550 YDR365W-BYDR365W-B 5268 nt2.65□□□□□ -1.98
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 17.6 ms