Protein–RNA interactions for Protein: Q8N205

SYNE4, Nesprin-4, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNE4Q8N205 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
SYNE4Q8N205 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SYNE4Q8N205 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SYNE4Q8N205 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SYNE4Q8N205 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SYNE4Q8N205 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SYNE4Q8N205 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SYNE4Q8N205 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
SYNE4Q8N205 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
SYNE4Q8N205 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SYNE4Q8N205 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SYNE4Q8N205 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SYNE4Q8N205 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SYNE4Q8N205 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SYNE4Q8N205 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SYNE4Q8N205 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SYNE4Q8N205 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SYNE4Q8N205 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
SYNE4Q8N205 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SYNE4Q8N205 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SYNE4Q8N205 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SYNE4Q8N205 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SYNE4Q8N205 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SYNE4Q8N205 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SYNE4Q8N205 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SYNE4Q8N205 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SYNE4Q8N205 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SYNE4Q8N205 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
SYNE4Q8N205 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
SYNE4Q8N205 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SYNE4Q8N205 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SYNE4Q8N205 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SYNE4Q8N205 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SYNE4Q8N205 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SYNE4Q8N205 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SYNE4Q8N205 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SYNE4Q8N205 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SYNE4Q8N205 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SYNE4Q8N205 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SYNE4Q8N205 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SYNE4Q8N205 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SYNE4Q8N205 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SYNE4Q8N205 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SYNE4Q8N205 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SYNE4Q8N205 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SYNE4Q8N205 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SYNE4Q8N205 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SYNE4Q8N205 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SYNE4Q8N205 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SYNE4Q8N205 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SYNE4Q8N205 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SYNE4Q8N205 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SYNE4Q8N205 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
SYNE4Q8N205 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SYNE4Q8N205 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SYNE4Q8N205 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SYNE4Q8N205 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SYNE4Q8N205 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SYNE4Q8N205 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SYNE4Q8N205 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SYNE4Q8N205 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SYNE4Q8N205 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SYNE4Q8N205 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SYNE4Q8N205 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SYNE4Q8N205 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SYNE4Q8N205 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SYNE4Q8N205 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
SYNE4Q8N205 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SYNE4Q8N205 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SYNE4Q8N205 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SYNE4Q8N205 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SYNE4Q8N205 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SYNE4Q8N205 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SYNE4Q8N205 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SYNE4Q8N205 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SYNE4Q8N205 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SYNE4Q8N205 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
SYNE4Q8N205 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
SYNE4Q8N205 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SYNE4Q8N205 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SYNE4Q8N205 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SYNE4Q8N205 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SYNE4Q8N205 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SYNE4Q8N205 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SYNE4Q8N205 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SYNE4Q8N205 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SYNE4Q8N205 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SYNE4Q8N205 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SYNE4Q8N205 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SYNE4Q8N205 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SYNE4Q8N205 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SYNE4Q8N205 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SYNE4Q8N205 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SYNE4Q8N205 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SYNE4Q8N205 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SYNE4Q8N205 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SYNE4Q8N205 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SYNE4Q8N205 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SYNE4Q8N205 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SYNE4Q8N205 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms