Protein–RNA interactions for Protein: Q15797

SMAD1, Mothers against decapentaplegic homolog 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 465 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD1Q15797 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SMAD1Q15797 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SMAD1Q15797 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SMAD1Q15797 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SMAD1Q15797 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SMAD1Q15797 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SMAD1Q15797 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SMAD1Q15797 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SMAD1Q15797 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SMAD1Q15797 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SMAD1Q15797 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SMAD1Q15797 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SMAD1Q15797 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
SMAD1Q15797 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SMAD1Q15797 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SMAD1Q15797 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SMAD1Q15797 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SMAD1Q15797 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SMAD1Q15797 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SMAD1Q15797 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SMAD1Q15797 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SMAD1Q15797 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SMAD1Q15797 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SMAD1Q15797 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SMAD1Q15797 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SMAD1Q15797 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SMAD1Q15797 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SMAD1Q15797 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SMAD1Q15797 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SMAD1Q15797 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SMAD1Q15797 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SMAD1Q15797 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SMAD1Q15797 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SMAD1Q15797 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SMAD1Q15797 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SMAD1Q15797 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SMAD1Q15797 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SMAD1Q15797 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SMAD1Q15797 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SMAD1Q15797 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
SMAD1Q15797 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
SMAD1Q15797 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
SMAD1Q15797 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
SMAD1Q15797 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SMAD1Q15797 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SMAD1Q15797 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SMAD1Q15797 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SMAD1Q15797 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SMAD1Q15797 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SMAD1Q15797 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SMAD1Q15797 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SMAD1Q15797 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SMAD1Q15797 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SMAD1Q15797 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SMAD1Q15797 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SMAD1Q15797 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SMAD1Q15797 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SMAD1Q15797 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SMAD1Q15797 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SMAD1Q15797 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SMAD1Q15797 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SMAD1Q15797 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SMAD1Q15797 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
SMAD1Q15797 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SMAD1Q15797 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SMAD1Q15797 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SMAD1Q15797 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
SMAD1Q15797 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
SMAD1Q15797 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SMAD1Q15797 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SMAD1Q15797 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
SMAD1Q15797 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SMAD1Q15797 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SMAD1Q15797 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
SMAD1Q15797 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
SMAD1Q15797 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
SMAD1Q15797 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
SMAD1Q15797 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SMAD1Q15797 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
SMAD1Q15797 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SMAD1Q15797 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
SMAD1Q15797 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SMAD1Q15797 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SMAD1Q15797 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
SMAD1Q15797 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SMAD1Q15797 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SMAD1Q15797 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SMAD1Q15797 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SMAD1Q15797 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SMAD1Q15797 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SMAD1Q15797 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SMAD1Q15797 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SMAD1Q15797 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SMAD1Q15797 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
SMAD1Q15797 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SMAD1Q15797 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SMAD1Q15797 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
SMAD1Q15797 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SMAD1Q15797 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SMAD1Q15797 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
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