Protein–RNA interactions for Protein: Q13595

TRA2A, Transformer-2 protein homolog alpha, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 282 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRA2AQ13595 LAS1L-205ENST00000484069 5205 ntTSL 211.59□□□□□ -0.558e-10■□□□□ 10.7
TRA2AQ13595 LAS1L-203ENST00000374811 2439 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.618e-10■□□□□ 10.7
TRA2AQ13595 SUPT5H-211ENST00000598459 548 ntTSL 58.58□□□□□ -1.046e-8■□□□□ 10.7
TRA2AQ13595 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.12e-15■□□□□ 10.7
TRA2AQ13595 RBM39-219ENST00000453310 1068 ntTSL 215.17■□□□□ 0.022e-15■□□□□ 10.7
TRA2AQ13595 RBM39-209ENST00000416529 594 ntTSL 37.49□□□□□ -1.212e-15■□□□□ 10.7
TRA2AQ13595 RPL7A-208ENST00000492798 374 ntTSL 1 (best)6.34□□□□□ -1.391e-323■□□□□ 10.7
TRA2AQ13595 SNORD36C-201ENST00000516733 66 ntBASIC0.89□□□□□ -2.271e-323■□□□□ 10.7
TRA2AQ13595 HNRNPM-208ENST00000597270 1147 ntTSL 220.19■□□□□ 0.824e-9■□□□□ 10.7
TRA2AQ13595 SNHG26-201ENST00000415611 1099 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.821e-52■□□□□ 10.7
TRA2AQ13595 SNHG26-202ENST00000422542 1106 ntTSL 3 BASIC8.92□□□□□ -0.981e-52■□□□□ 10.7
TRA2AQ13595 SNHG26-203ENST00000432668 574 ntTSL 36.03□□□□□ -1.441e-52■□□□□ 10.7
TRA2AQ13595 SNORD93-201ENST00000408813 74 ntBASIC0.6□□□□□ -2.311e-52■□□□□ 10.7
TRA2AQ13595 RPL7-205ENST00000431653 563 ntTSL 36.17□□□□□ -1.424e-18■□□□□ 10.7
TRA2AQ13595 RPL7-206ENST00000435330 445 ntTSL 33.72□□□□□ -1.814e-18■□□□□ 10.7
TRA2AQ13595 EWSR1-205ENST00000360091 1289 ntTSL 519.4■□□□□ 0.73e-7■□□□□ 10.7
TRA2AQ13595 EWSR1-218ENST00000483629 1818 ntTSL 516.81■□□□□ 0.283e-7■□□□□ 10.7
TRA2AQ13595 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.263e-7■□□□□ 10.7
TRA2AQ13595 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.193e-7■□□□□ 10.7
TRA2AQ13595 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.143e-7■□□□□ 10.7
TRA2AQ13595 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.013e-7■□□□□ 10.7
TRA2AQ13595 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.073e-7■□□□□ 10.7
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TRA2AQ13595 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.13e-7■□□□□ 10.7
TRA2AQ13595 EWSR1-215ENST00000469669 2630 ntTSL 214.34□□□□□ -0.113e-7■□□□□ 10.7
TRA2AQ13595 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.123e-7■□□□□ 10.7
TRA2AQ13595 EWSR1-216ENST00000479135 7285 ntTSL 1 (best)9.22□□□□□ -0.933e-7■□□□□ 10.7
TRA2AQ13595 ABCC2-202ENST00000370449 5312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.045e-7■□□□□ 10.7
TRA2AQ13595 MDM2-225ENST00000539479 845 ntTSL 1 (best)5.82□□□□□ -1.481e-7■□□□□ 10.7
TRA2AQ13595 DCAF8-208ENST00000461888 2277 ntTSL 514.93□□□□□ -0.023e-7■□□□□ 10.7
TRA2AQ13595 DCAF8-201ENST00000326837 3972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.433e-7■□□□□ 10.7
TRA2AQ13595 AL139011.2-201ENST00000556710 2635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.613e-7■□□□□ 10.7
TRA2AQ13595 DCAF8-202ENST00000368073 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.893e-7■□□□□ 10.7
TRA2AQ13595 DCAF8-203ENST00000368074 3824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.173e-7■□□□□ 10.7
TRA2AQ13595 MXD1-202ENST00000409442 982 ntTSL 221.06■□□□□ 0.965e-8■□□□□ 10.6
TRA2AQ13595 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.459e-6■□□□□ 10.6
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TRA2AQ13595 FAM13B-203ENST00000425075 3098 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.485e-8■□□□□ 10.6
TRA2AQ13595 FAM13B-201ENST00000033079 5465 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.495e-8■□□□□ 10.6
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TRA2AQ13595 NUMA1-220ENST00000541584 3557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best)9.78□□□□□ -0.842e-10■□□□□ 10.6
TRA2AQ13595 FAM13B-202ENST00000420893 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.865e-8■□□□□ 10.6
TRA2AQ13595 PPWD1-213ENST00000515447 580 ntTSL 49.33□□□□□ -0.929e-6■□□□□ 10.6
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TRA2AQ13595 OGDH-206ENST00000447398 3474 ntTSL 5 BASIC8.68□□□□□ -1.029e-6■□□□□ 10.6
TRA2AQ13595 CIT-201ENST00000261833 8578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.053e-6■□□□□ 10.6
TRA2AQ13595 OGDH-202ENST00000419661 789 ntTSL 58.4□□□□□ -1.069e-6■□□□□ 10.6
TRA2AQ13595 OGDH-207ENST00000449767 3479 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC8.34□□□□□ -1.079e-6■□□□□ 10.6
TRA2AQ13595 PPWD1-215ENST00000538977 2055 ntTSL 2 BASIC8.25□□□□□ -1.099e-6■□□□□ 10.6
TRA2AQ13595 DNAJC8-206ENST00000603289 483 ntTSL 58.05□□□□□ -1.129e-6■□□□□ 10.6
TRA2AQ13595 OGDH-210ENST00000631326 4116 ntTSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.159e-6■□□□□ 10.6
TRA2AQ13595 PPWD1-209ENST00000511908 1981 ntTSL 27.67□□□□□ -1.189e-6■□□□□ 10.6
TRA2AQ13595 RBM39-239ENST00000494274 704 ntTSL 37.11□□□□□ -1.275e-8■□□□□ 10.6
TRA2AQ13595 NEMF-206ENST00000555411 573 ntTSL 47.02□□□□□ -1.299e-6■□□□□ 10.6
TRA2AQ13595 SSRP1-205ENST00000635721 675 ntTSL 56.83□□□□□ -1.321e-6■□□□□ 10.6
TRA2AQ13595 PPWD1-201ENST00000261308 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.379e-6■□□□□ 10.6
TRA2AQ13595 PPWD1-214ENST00000535264 2195 ntTSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.379e-6■□□□□ 10.6
TRA2AQ13595 CEP85-204ENST00000468163 453 ntTSL 26.31□□□□□ -1.49e-6■□□□□ 10.6
TRA2AQ13595 NSD3-206ENST00000527502 4471 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.519e-6■□□□□ 10.6
TRA2AQ13595 CIT-207ENST00000536325 329 ntTSL 33.88□□□□□ -1.793e-6■□□□□ 10.6
TRA2AQ13595 AFDN-219ENST00000509296 686 ntTSL 43.58□□□□□ -1.845e-8■□□□□ 10.6
TRA2AQ13595 SMC4-225ENST00000497203 490 ntTSL 33.5□□□□□ -1.852e-10■□□□□ 10.6
TRA2AQ13595 LARP1-211ENST00000521577 817 ntTSL 523.92■■□□□ 1.428e-7■□□□□ 10.6
TRA2AQ13595 LARP1-204ENST00000518297 2630 ntTSL 518.18■□□□□ 0.58e-7■□□□□ 10.6
TRA2AQ13595 LARP1-215ENST00000524248 2128 ntTSL 514.89□□□□□ -0.038e-7■□□□□ 10.6
TRA2AQ13595 LARP1-201ENST00000336314 6595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.628e-7■□□□□ 10.6
TRA2AQ13595 LARP1-213ENST00000523163 843 ntTSL 57.75□□□□□ -1.178e-7■□□□□ 10.6
TRA2AQ13595 LARP1-210ENST00000519931 569 ntTSL 47.07□□□□□ -1.288e-7■□□□□ 10.6
TRA2AQ13595 LARP1-202ENST00000517616 501 ntTSL 53.36□□□□□ -1.878e-7■□□□□ 10.6
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