RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487311.1

SRRT-212, Transcript of serrate, RNA effector molecule, humanhuman

TSL 2

Gene SRRT, Length 563 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRT-212ENST00000487311 NISCHQ9Y2I1 1504 aa40.83■■■■■ 4.13
SRRT-212ENST00000487311 ABCC9O60706 1549 aa36.89■■■■□ 3.5
SRRT-212ENST00000487311 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa36.56■■■■□ 3.44
SRRT-212ENST00000487311 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa34.92■■■■□ 3.18
SRRT-212ENST00000487311 DNAJC5BQ9UF47 199 aa34.91■■■■□ 3.18
SRRT-212ENST00000487311 DCAF8L2P0C7V8 631 aa34.67■■■■□ 3.14
SRRT-212ENST00000487311 NACADO15069 1562 aa34.66■■■■□ 3.14
SRRT-212ENST00000487311 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP34.42■■■■□ 3.15e-9■■■■■ 27.5
SRRT-212ENST00000487311 UNC13AQ9UPW8 1703 aa34.18■■■■□ 3.06
SRRT-212ENST00000487311 MYO15BQ96JP2 1530 aa34.12■■■■□ 3.05
SRRT-212ENST00000487311 BICRAQ9NZM4 1560 aa34.02■■■■□ 3.04
SRRT-212ENST00000487311 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP33.77■■■■□ 3
SRRT-212ENST00000487311 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa33.64■■■□□ 2.98
SRRT-212ENST00000487311 SCRIBQ14160 1630 aa33.42■■■□□ 2.94
SRRT-212ENST00000487311 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa33.36■■■□□ 2.93
SRRT-212ENST00000487311 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa33.27■■■□□ 2.92
SRRT-212ENST00000487311 CECR2Q9BXF3 1484 aa33.2■■■□□ 2.91
SRRT-212ENST00000487311 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP33.14■■■□□ 2.9
SRRT-212ENST00000487311 NCAPD3P42695 1498 aa32.08■■■□□ 2.73
SRRT-212ENST00000487311 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa32.05■■■□□ 2.72
SRRT-212ENST00000487311 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa31.97■■■□□ 2.71
SRRT-212ENST00000487311 SMARCA4P51532 1647 aa31.84■■■□□ 2.69
SRRT-212ENST00000487311 ERCC6Q03468 1493 aa31.78■■■□□ 2.68
SRRT-212ENST00000487311 SMARCA2P51531 1590 aa31.77■■■□□ 2.68
SRRT-212ENST00000487311 CUX2O14529 1486 aa31.75■■■□□ 2.67
SRRT-212ENST00000487311 HMGXB3Q12766 1538 aa31.74■■■□□ 2.67
SRRT-212ENST00000487311 NESP48681 1621 aa31.67■■■□□ 2.66
SRRT-212ENST00000487311 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP31.64■■■□□ 2.65
SRRT-212ENST00000487311 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP31.6■■■□□ 2.65
SRRT-212ENST00000487311 PEG3Q9GZU2 1588 aa31.51■■■□□ 2.64
SRRT-212ENST00000487311 MROH2BQ7Z745 1585 aa31.51■■■□□ 2.63
SRRT-212ENST00000487311 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa31.3■■■□□ 2.6
SRRT-212ENST00000487311 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP31.27■■■□□ 2.6
SRRT-212ENST00000487311 PDS5BQ9NTI5 1447 aa31.16■■■□□ 2.58
SRRT-212ENST00000487311 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa31.16■■■□□ 2.58
SRRT-212ENST00000487311 CADPSQ9ULU8 1353 aa31.12■■■□□ 2.57
SRRT-212ENST00000487311 WIZO95785 1651 aa31.1■■■□□ 2.57
SRRT-212ENST00000487311 MRC2Q9UBG0 1479 aa30.89■■■□□ 2.54
SRRT-212ENST00000487311 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP30.81■■■□□ 2.52
SRRT-212ENST00000487311 WDR62O43379 1518 aa30.81■■■□□ 2.52
SRRT-212ENST00000487311 FANCD2Q9BXW9 1451 aa30.73■■■□□ 2.51
SRRT-212ENST00000487311 CEP164Q9UPV0 1460 aa30.73■■■□□ 2.51
SRRT-212ENST00000487311 CFTRP13569 1480 aa30.7■■■□□ 2.51
SRRT-212ENST00000487311 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP30.63■■■□□ 2.49
SRRT-212ENST00000487311 TRIM41Q8WV44 630 aa30.6■■■□□ 2.49
SRRT-212ENST00000487311 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP30.52■■■□□ 2.48
SRRT-212ENST00000487311 OSCARQ8IYS5 282 aa30.4■■■□□ 2.46
SRRT-212ENST00000487311 CCDC88BA6NC98 1476 aa30.38■■■□□ 2.45
SRRT-212ENST00000487311 PRDM2Q13029 1718 aa30.25■■■□□ 2.43
SRRT-212ENST00000487311 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP30.19■■■□□ 2.42
SRRT-212ENST00000487311 TOPBP1Q92547 1522 aa30.14■■■□□ 2.42
SRRT-212ENST00000487311 IFT140Q96RY7 1462 aa30.12■■■□□ 2.41
SRRT-212ENST00000487311 ABCC8Q09428 1581 aa29.99■■■□□ 2.39
SRRT-212ENST00000487311 DNMBPQ6XZF7 1577 aa29.96■■■□□ 2.39
SRRT-212ENST00000487311 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa29.94■■■□□ 2.38
SRRT-212ENST00000487311 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa29.94■■■□□ 2.38
SRRT-212ENST00000487311 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa29.94■■■□□ 2.38
SRRT-212ENST00000487311 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP29.93■■■□□ 2.38
SRRT-212ENST00000487311 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP29.9■■■□□ 2.38
SRRT-212ENST00000487311 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP29.86■■■□□ 2.37
SRRT-212ENST00000487311 ARHGEF11O15085 1522 aa29.83■■■□□ 2.37
SRRT-212ENST00000487311 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP29.82■■■□□ 2.36
SRRT-212ENST00000487311 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa29.79■■■□□ 2.36
SRRT-212ENST00000487311 FBLN2P98095 1184 aa29.76■■■□□ 2.35
SRRT-212ENST00000487311 CYB5RLQ6IPT4 315 aa29.75■■■□□ 2.35
SRRT-212ENST00000487311 SOGA1O94964 1423 aa29.72■■■□□ 2.35
SRRT-212ENST00000487311 CHD1O14646 1710 aa29.72■■■□□ 2.35
SRRT-212ENST00000487311 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP29.72■■■□□ 2.35
SRRT-212ENST00000487311 FGD5Q6ZNL6 1462 aa29.61■■■□□ 2.33
SRRT-212ENST00000487311 CUX1P39880 1505 aa29.59■■■□□ 2.33
SRRT-212ENST00000487311 ARAP1Q96P48 1450 aa29.55■■■□□ 2.32
SRRT-212ENST00000487311 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa29.54■■■□□ 2.32
SRRT-212ENST00000487311 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP29.49■■■□□ 2.31
SRRT-212ENST00000487311 WDR97A6NE52 1622 aa29.42■■■□□ 2.3
SRRT-212ENST00000487311 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP29.42■■■□□ 2.3
SRRT-212ENST00000487311 TRHP20396 242 aaPredicted RBP29.42■■■□□ 2.3
SRRT-212ENST00000487311 GRIN2BQ13224 1484 aa29.42■■■□□ 2.3
SRRT-212ENST00000487311 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP29.4■■■□□ 2.3
SRRT-212ENST00000487311 CLASP1Q7Z460 1538 aa29.4■■■□□ 2.3
SRRT-212ENST00000487311 SYNJ2O15056 1496 aa29.33■■■□□ 2.29
SRRT-212ENST00000487311 GAPVD1Q14C86 1478 aa29.32■■■□□ 2.28
SRRT-212ENST00000487311 SYNJ1O43426 1573 aa29.31■■■□□ 2.28
SRRT-212ENST00000487311 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa29.25■■■□□ 2.27
SRRT-212ENST00000487311 PBRM1Q86U86 1689 aa29.24■■■□□ 2.27
SRRT-212ENST00000487311 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa29.19■■■□□ 2.26
SRRT-212ENST00000487311 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP29.11■■■□□ 2.25
SRRT-212ENST00000487311 GRIN2AQ12879 1464 aa29.04■■■□□ 2.24
SRRT-212ENST00000487311 ERCC6L2Q5T890 1561 aa29.02■■■□□ 2.24
SRRT-212ENST00000487311 TOP2BQ02880 1626 aa29.01■■■□□ 2.23
SRRT-212ENST00000487311 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa28.99■■■□□ 2.23
SRRT-212ENST00000487311 NUP160Q12769 1436 aa28.97■■■□□ 2.23
SRRT-212ENST00000487311 ADAMTS12P58397 1594 aa28.96■■■□□ 2.23
SRRT-212ENST00000487311 CEP170Q5SW79 1584 aa28.96■■■□□ 2.23
SRRT-212ENST00000487311 FHAD1B1AJZ9 1412 aa28.93■■■□□ 2.22
SRRT-212ENST00000487311 ERICH3Q5RHP9 1530 aa28.84■■■□□ 2.21
SRRT-212ENST00000487311 SHROOM2Q13796 1616 aa28.81■■■□□ 2.2
SRRT-212ENST00000487311 JPH4Q96JJ6 628 aa28.77■■■□□ 2.2
SRRT-212ENST00000487311 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP28.73■■■□□ 2.19
SRRT-212ENST00000487311 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP28.62■■■□□ 2.17
SRRT-212ENST00000487311 IGF1RP08069 1367 aa28.59■■■□□ 2.17
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