Protein–RNA interactions for Protein: Q12329

HSP42, Heat shock protein 42, yeastyeast

Predictions only

Length 375 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
HSP42Q12329 tW(CCA)MtW(CCA)M 72 nt2.51□□□□□ -2.01
HSP42Q12329 tW(CCA)PtW(CCA)P 72 nt2.51□□□□□ -2.01
HSP42Q12329 PAU8YAL068C 363 nt2.51□□□□□ -2.01
HSP42Q12329 TMA10YLR327C 261 nt2.51□□□□□ -2.01
HSP42Q12329 CCW14YLR390W-A 717 nt2.51□□□□□ -2.01
HSP42Q12329 YMR013C-AYMR013C-A 150 nt2.51□□□□□ -2.01
HSP42Q12329 CSI1YMR025W 888 nt2.51□□□□□ -2.01
HSP42Q12329 PAU20YOL161C 363 nt2.51□□□□□ -2.01
HSP42Q12329 KAP123YER110C 3342 nt2.51□□□□□ -2.01
HSP42Q12329 INP53YOR109W 3324 nt2.51□□□□□ -2.01
HSP42Q12329 MES1YGR264C 2256 nt2.51□□□□□ -2.01
HSP42Q12329 ADK1YDR226W 669 nt2.5□□□□□ -2.01
HSP42Q12329 HHT2YNL031C 411 nt2.5□□□□□ -2.01
HSP42Q12329 SIR4YDR227W 4077 nt2.5□□□□□ -2.01
HSP42Q12329 NEW1YPL226W 3591 nt2.49□□□□□ -2.01
HSP42Q12329 YEL043WYEL043W 2871 nt2.49□□□□□ -2.01
HSP42Q12329 BAS1YKR099W 2436 nt2.49□□□□□ -2.01
HSP42Q12329 SCP160YJL080C 3669 nt2.49□□□□□ -2.01
HSP42Q12329 snR84snR84 550 nt2.49□□□□□ -2.01
HSP42Q12329 SDC1YDR469W 528 nt2.49□□□□□ -2.01
HSP42Q12329 YHR052W-AYHR052W-A 195 nt2.49□□□□□ -2.01
HSP42Q12329 YHR054W-AYHR054W-A 195 nt2.49□□□□□ -2.01
HSP42Q12329 DFG10YIL049W 762 nt2.49□□□□□ -2.01
HSP42Q12329 LSM2YBL026W 288 nt2.49□□□□□ -2.01
HSP42Q12329 UBX4YMR067C 1251 nt2.49□□□□□ -2.01
HSP42Q12329 MLH1YMR167W 2310 nt2.49□□□□□ -2.01
HSP42Q12329 NPR1YNL183C 2373 nt2.48□□□□□ -2.01
HSP42Q12329 PRE1YER012W 597 nt2.48□□□□□ -2.01
HSP42Q12329 CHZ1YER030W 462 nt2.48□□□□□ -2.01
HSP42Q12329 YER175W-AYER175W-A 165 nt2.48□□□□□ -2.01
HSP42Q12329 YGR121W-AYGR121W-A 216 nt2.48□□□□□ -2.01
HSP42Q12329 YJR141WYJR141W 1044 nt2.48□□□□□ -2.01
HSP42Q12329 YBR071WYBR071W 636 nt2.48□□□□□ -2.01
HSP42Q12329 YPR096CYPR096C 303 nt2.48□□□□□ -2.01
HSP42Q12329 YPL150WYPL150W 2706 nt2.48□□□□□ -2.01
HSP42Q12329 YIL166CYIL166C 1629 nt2.48□□□□□ -2.01
HSP42Q12329 SNU114YKL173W 3027 nt2.48□□□□□ -2.01
HSP42Q12329 INO80YGL150C 4470 nt2.47□□□□□ -2.01
HSP42Q12329 RPS17BYDR447C 411 nt2.47□□□□□ -2.01
HSP42Q12329 GLC7YER133W 939 nt2.47□□□□□ -2.01
HSP42Q12329 GIC1YHR061C 945 nt2.47□□□□□ -2.01
HSP42Q12329 YIL029CYIL029C 429 nt2.47□□□□□ -2.01
HSP42Q12329 ILM1YJR118C 612 nt2.47□□□□□ -2.01
HSP42Q12329 CBF2YGR140W 2871 nt2.47□□□□□ -2.01
HSP42Q12329 GPI17YDR434W 1605 nt2.46□□□□□ -2.02
HSP42Q12329 PRE4YFR050C 801 nt2.46□□□□□ -2.02
HSP42Q12329 PRM8YGL053W 714 nt2.46□□□□□ -2.02
HSP42Q12329 ACB1YGR037C 264 nt2.46□□□□□ -2.02
HSP42Q12329 YLR154W-AYLR154W-A 186 nt2.46□□□□□ -2.02
HSP42Q12329 YLR252WYLR252W 306 nt2.46□□□□□ -2.02
HSP42Q12329 HRI1YLR301W 735 nt2.46□□□□□ -2.02
HSP42Q12329 OST2YOR103C 393 nt2.46□□□□□ -2.02
HSP42Q12329 Q0017Q0017 162 nt2.46□□□□□ -2.02
HSP42Q12329 YNL034WYNL034W 1839 nt2.46□□□□□ -2.02
HSP42Q12329 PSK2YOL045W 3306 nt2.46□□□□□ -2.02
HSP42Q12329 SSF2YDR312W 1362 nt2.46□□□□□ -2.02
HSP42Q12329 SPF1YEL031W 3648 nt2.46□□□□□ -2.02
HSP42Q12329 RPS17AYML024W 411 nt2.45□□□□□ -2.02
HSP42Q12329 RSA1YPL193W 1146 nt2.45□□□□□ -2.02
HSP42Q12329 DAD3YBR233W-A 285 nt2.45□□□□□ -2.02
HSP42Q12329 GIS1YDR096W 2685 nt2.45□□□□□ -2.02
HSP42Q12329 TRA1YHR099W 11235 nt2.45□□□□□ -2.02
HSP42Q12329 PTP3YER075C 2787 nt2.44□□□□□ -2.02
HSP42Q12329 BCK1YJL095W 4437 nt2.44□□□□□ -2.02
HSP42Q12329 YGL165CYGL165C 579 nt2.44□□□□□ -2.02
HSP42Q12329 YAL026C-AYAL026C-A 438 nt2.44□□□□□ -2.02
HSP42Q12329 YHC1YLR298C 696 nt2.44□□□□□ -2.02
HSP42Q12329 IGO1YNL157W 507 nt2.44□□□□□ -2.02
HSP42Q12329 TRM7YBR061C 933 nt2.44□□□□□ -2.02
HSP42Q12329 NSL1YPL233W 651 nt2.44□□□□□ -2.02
HSP42Q12329 JID1YPR061C 906 nt2.44□□□□□ -2.02
HSP42Q12329 COS111YBR203W 2775 nt2.44□□□□□ -2.02
HSP42Q12329 SSF1YHR066W 1362 nt2.44□□□□□ -2.02
HSP42Q12329 IST2YBR086C 2841 nt2.44□□□□□ -2.02
HSP42Q12329 PHR1YOR386W 1698 nt2.44□□□□□ -2.02
HSP42Q12329 YOL098CYOL098C 3114 nt2.43□□□□□ -2.02
HSP42Q12329 YJL181WYJL181W 1836 nt2.43□□□□□ -2.02
HSP42Q12329 YER038W-AYER038W-A 381 nt2.43□□□□□ -2.02
HSP42Q12329 EMC6YLL014W 327 nt2.43□□□□□ -2.02
HSP42Q12329 ARV1YLR242C 966 nt2.43□□□□□ -2.02
HSP42Q12329 FKS3YMR306W 5358 nt2.43□□□□□ -2.02
HSP42Q12329 BNI1YNL271C 5862 nt2.43□□□□□ -2.02
HSP42Q12329 YOR343W-AYOR343W-A 1317 nt2.42□□□□□ -2.02
HSP42Q12329 OSW7YFR039C 1533 nt2.42□□□□□ -2.02
HSP42Q12329 STE11YLR362W 2154 nt2.42□□□□□ -2.02
HSP42Q12329 YCR108CYCR108C 192 nt2.42□□□□□ -2.02
HSP42Q12329 APQ13YJL075C 417 nt2.42□□□□□ -2.02
HSP42Q12329 JIP3YLR331C 378 nt2.42□□□□□ -2.02
HSP42Q12329 BER1YLR412W 825 nt2.42□□□□□ -2.02
HSP42Q12329 PSO2YMR137C 1986 nt2.41□□□□□ -2.02
HSP42Q12329 BI4Q0120 1917 nt2.41□□□□□ -2.02
HSP42Q12329 YGL015CYGL015C 393 nt2.41□□□□□ -2.02
HSP42Q12329 GET1YGL020C 708 nt2.41□□□□□ -2.02
HSP42Q12329 RAD6YGL058W 519 nt2.41□□□□□ -2.02
HSP42Q12329 ALG14YBR070C 714 nt2.41□□□□□ -2.02
HSP42Q12329 PRP6YBR055C 2700 nt2.41□□□□□ -2.02
HSP42Q12329 RAV1YJR033C 4074 nt2.41□□□□□ -2.02
HSP42Q12329 REV3YPL167C 4515 nt2.41□□□□□ -2.02
HSP42Q12329 PHO91YNR013C 2685 nt2.41□□□□□ -2.02
HSP42Q12329 YPR089WYPR089W 2667 nt2.41□□□□□ -2.02
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