Protein–RNA interactions for Protein: Q12129

NMD4, Nonsense-mediated decay protein 4, yeastyeast

Predictions only

Length 218 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
NMD4Q12129 YPR089WYPR089W 2667 nt2.59□□□□□ -1.99
NMD4Q12129 JSN1YJR091C 3276 nt2.59□□□□□ -1.99
NMD4Q12129 KSP1YHR082C 3090 nt2.59□□□□□ -1.99
NMD4Q12129 YCR108CYCR108C 192 nt2.59□□□□□ -1.99
NMD4Q12129 GPI8YDR331W 1236 nt2.59□□□□□ -1.99
NMD4Q12129 YGL165CYGL165C 579 nt2.59□□□□□ -1.99
NMD4Q12129 YHR086W-AYHR086W-A 162 nt2.59□□□□□ -1.99
NMD4Q12129 RPL16AYIL133C 600 nt2.59□□□□□ -1.99
NMD4Q12129 JIP3YLR331C 378 nt2.59□□□□□ -1.99
NMD4Q12129 ESL2YKR096W 3588 nt2.59□□□□□ -1.99
NMD4Q12129 SAP1YER047C 2694 nt2.59□□□□□ -2
NMD4Q12129 YPL150WYPL150W 2706 nt2.59□□□□□ -2
NMD4Q12129 SUL1YBR294W 2580 nt2.58□□□□□ -2
NMD4Q12129 JIP5YPR169W 1479 nt2.58□□□□□ -2
NMD4Q12129 RPL14BYHL001W 417 nt2.58□□□□□ -2
NMD4Q12129 LAG1YHL003C 1236 nt2.58□□□□□ -2
NMD4Q12129 YIL058WYIL058W 285 nt2.58□□□□□ -2
NMD4Q12129 HYR1YIR037W 492 nt2.58□□□□□ -2
NMD4Q12129 YJL202CYJL202C 348 nt2.58□□□□□ -2
NMD4Q12129 GPI14YJR013W 1212 nt2.58□□□□□ -2
NMD4Q12129 RPL37AYLR185W 267 nt2.58□□□□□ -2
NMD4Q12129 GPI15YNL038W 690 nt2.58□□□□□ -2
NMD4Q12129 AXL1YPR122W 3627 nt2.58□□□□□ -2
NMD4Q12129 RRP12YPL012W 3687 nt2.58□□□□□ -2
NMD4Q12129 HOS4YIL112W 3252 nt2.58□□□□□ -2
NMD4Q12129 RGL1YPL066W 1440 nt2.58□□□□□ -2
NMD4Q12129 SEC26YDR238C 2922 nt2.57□□□□□ -2
NMD4Q12129 YGR045CYGR045C 363 nt2.57□□□□□ -2
NMD4Q12129 YGR050CYGR050C 357 nt2.57□□□□□ -2
NMD4Q12129 RPS22AYJL190C 393 nt2.57□□□□□ -2
NMD4Q12129 FYV7YLR068W 456 nt2.57□□□□□ -2
NMD4Q12129 RPO41YFL036W 4056 nt2.57□□□□□ -2
NMD4Q12129 RTT10YPL183C 3042 nt2.57□□□□□ -2
NMD4Q12129 VPS64YDR200C 1815 nt2.56□□□□□ -2
NMD4Q12129 RNR4YGR180C 1038 nt2.56□□□□□ -2
NMD4Q12129 YAP3YHL009C 993 nt2.56□□□□□ -2
NMD4Q12129 TPM2YIL138C 486 nt2.56□□□□□ -2
NMD4Q12129 PEP8YJL053W 1140 nt2.56□□□□□ -2
NMD4Q12129 PBI2YNL015W 228 nt2.56□□□□□ -2
NMD4Q12129 PES4YFR023W 1836 nt2.56□□□□□ -2
NMD4Q12129 SKT5YBL061C 2091 nt2.56□□□□□ -2
NMD4Q12129 YER119C-AYER119C-A 372 nt2.55□□□□□ -2
NMD4Q12129 YGR018CYGR018C 330 nt2.55□□□□□ -2
NMD4Q12129 YKL068W-AYKL068W-A 237 nt2.55□□□□□ -2
NMD4Q12129 URA10YMR271C 684 nt2.55□□□□□ -2
NMD4Q12129 SNU114YKL173W 3027 nt2.55□□□□□ -2
NMD4Q12129 PRP6YBR055C 2700 nt2.55□□□□□ -2
NMD4Q12129 SSY1YDR160W 2559 nt2.55□□□□□ -2
NMD4Q12129 HRD3YLR207W 2502 nt2.54□□□□□ -2
NMD4Q12129 ROY1YMR258C 1662 nt2.54□□□□□ -2
NMD4Q12129 PFF1YBR074W 2931 nt2.54□□□□□ -2
NMD4Q12129 ASG1YIL130W 2895 nt2.54□□□□□ -2
NMD4Q12129 IKI3YLR384C 4050 nt2.54□□□□□ -2
NMD4Q12129 MXR1YER042W 555 nt2.54□□□□□ -2
NMD4Q12129 CTK3YML112W 891 nt2.54□□□□□ -2
NMD4Q12129 ATX2YOR079C 942 nt2.54□□□□□ -2
NMD4Q12129 YPL197CYPL197C 414 nt2.54□□□□□ -2
NMD4Q12129 SWA2YDR320C 2007 nt2.54□□□□□ -2
NMD4Q12129 GIN4YDR507C 3429 nt2.54□□□□□ -2
NMD4Q12129 SMY2YBR172C 2223 nt2.53□□□□□ -2
NMD4Q12129 SHE9YDR393W 1371 nt2.53□□□□□ -2
NMD4Q12129 YJL070CYJL070C 2667 nt2.53□□□□□ -2
NMD4Q12129 ACB1YGR037C 264 nt2.53□□□□□ -2
NMD4Q12129 RPF1YHR088W 888 nt2.53□□□□□ -2
NMD4Q12129 SYS1YJL004C 612 nt2.53□□□□□ -2
NMD4Q12129 YJL127C-BYJL127C-B 159 nt2.53□□□□□ -2
NMD4Q12129 CMS1YLR003C 876 nt2.53□□□□□ -2
NMD4Q12129 PRE8YML092C 753 nt2.53□□□□□ -2
NMD4Q12129 DDR48YMR173W 1293 nt2.53□□□□□ -2
NMD4Q12129 RPB11YOL005C 363 nt2.53□□□□□ -2
NMD4Q12129 YOR032W-AYOR032W-A 201 nt2.53□□□□□ -2
NMD4Q12129 IRC16YPR038W 360 nt2.53□□□□□ -2
NMD4Q12129 MDM32YOR147W 1869 nt2.53□□□□□ -2
NMD4Q12129 YNL018CYNL018C 1839 nt2.53□□□□□ -2
NMD4Q12129 PSD2YGR170W 3417 nt2.52□□□□□ -2.01
NMD4Q12129 DNA2YHR164C 4569 nt2.52□□□□□ -2.01
NMD4Q12129 YEL030C-AYEL030C-A 315 nt2.52□□□□□ -2.01
NMD4Q12129 SMB1YER029C 591 nt2.52□□□□□ -2.01
NMD4Q12129 RAM2YKL019W 951 nt2.52□□□□□ -2.01
NMD4Q12129 PKR1YMR123W 369 nt2.52□□□□□ -2.01
NMD4Q12129 RPS7BYNL096C 573 nt2.52□□□□□ -2.01
NMD4Q12129 NOP15YNL110C 663 nt2.52□□□□□ -2.01
NMD4Q12129 IGO1YNL157W 507 nt2.52□□□□□ -2.01
NMD4Q12129 MGR1YCL044C 1254 nt2.52□□□□□ -2.01
NMD4Q12129 BRO1YPL084W 2535 nt2.52□□□□□ -2.01
NMD4Q12129 TOP2YNL088W 4287 nt2.52□□□□□ -2.01
NMD4Q12129 TRA1YHR099W 11235 nt2.52□□□□□ -2.01
NMD4Q12129 INP51YIL002C 2841 nt2.51□□□□□ -2.01
NMD4Q12129 VPS16YPL045W 2397 nt2.51□□□□□ -2.01
NMD4Q12129 AAD16YFL057C 459 nt2.51□□□□□ -2.01
NMD4Q12129 YPS5YGL259W 498 nt2.51□□□□□ -2.01
NMD4Q12129 YHR130CYHR130C 336 nt2.51□□□□□ -2.01
NMD4Q12129 LCL1YPL056C 306 nt2.51□□□□□ -2.01
NMD4Q12129 HSC82YMR186W 2118 nt2.51□□□□□ -2.01
NMD4Q12129 AYT1YLL063C 1425 nt2.51□□□□□ -2.01
NMD4Q12129 YIL080WYIL080W 4722 nt2.5□□□□□ -2.01
NMD4Q12129 BNA7YDR428C 786 nt2.5□□□□□ -2.01
NMD4Q12129 RMP1YLR145W 606 nt2.5□□□□□ -2.01
NMD4Q12129 RPS29AYLR388W 171 nt2.5□□□□□ -2.01
NMD4Q12129 YOR105WYOR105W 327 nt2.5□□□□□ -2.01
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