Protein–RNA interactions for Protein: Q12010

YPQ1, Probable vacuolar amino acid transporter YPQ1, yeastyeast

Predictions only

Length 308 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YPQ1Q12010 YBR209WYBR209W 318 nt2.3□□□□□ -2.04
YPQ1Q12010 YKL075CYKL075C 1353 nt2.3□□□□□ -2.04
YPQ1Q12010 UTP15YMR093W 1542 nt2.3□□□□□ -2.04
YPQ1Q12010 SHS1YDL225W 1656 nt2.3□□□□□ -2.04
YPQ1Q12010 FUS1YCL027W 1539 nt2.29□□□□□ -2.04
YPQ1Q12010 YOR343W-AYOR343W-A 1317 nt2.29□□□□□ -2.04
YPQ1Q12010 GPI19YDR437W 423 nt2.29□□□□□ -2.04
YPQ1Q12010 YER091C-AYER091C-A 222 nt2.29□□□□□ -2.04
YPQ1Q12010 BRP1YGL007W 378 nt2.29□□□□□ -2.04
YPQ1Q12010 EAF6YJR082C 342 nt2.29□□□□□ -2.04
YPQ1Q12010 VPS51YKR020W 495 nt2.29□□□□□ -2.04
YPQ1Q12010 VPS63YLR261C 327 nt2.29□□□□□ -2.04
YPQ1Q12010 AIM32YML050W 936 nt2.29□□□□□ -2.04
YPQ1Q12010 RPS16AYMR143W 432 nt2.29□□□□□ -2.04
YPQ1Q12010 HEM4YOR278W 828 nt2.29□□□□□ -2.04
YPQ1Q12010 YPR014CYPR014C 330 nt2.29□□□□□ -2.04
YPQ1Q12010 FAR11YNL127W 2862 nt2.28□□□□□ -2.04
YPQ1Q12010 RPS1AYLR441C 768 nt2.28□□□□□ -2.04
YPQ1Q12010 RRT16YNL105W 429 nt2.28□□□□□ -2.04
YPQ1Q12010 YOL134CYOL134C 390 nt2.28□□□□□ -2.04
YPQ1Q12010 CRS5YOR031W 210 nt2.28□□□□□ -2.04
YPQ1Q12010 PIS1YPR113W 663 nt2.28□□□□□ -2.04
YPQ1Q12010 DNL4YOR005C 2835 nt2.28□□□□□ -2.04
YPQ1Q12010 DAL5YJR152W 1632 nt2.28□□□□□ -2.05
YPQ1Q12010 SSE1YPL106C 2082 nt2.27□□□□□ -2.05
YPQ1Q12010 SHE4YOR035C 2370 nt2.27□□□□□ -2.05
YPQ1Q12010 RLF2YPR018W 1821 nt2.27□□□□□ -2.05
YPQ1Q12010 YER175W-AYER175W-A 165 nt2.27□□□□□ -2.05
YPQ1Q12010 Q0142Q0142 177 nt2.27□□□□□ -2.05
YPQ1Q12010 LCL2YLR104W 396 nt2.27□□□□□ -2.05
YPQ1Q12010 RPS29AYLR388W 171 nt2.27□□□□□ -2.05
YPQ1Q12010 BER1YLR412W 825 nt2.27□□□□□ -2.05
YPQ1Q12010 LCL1YPL056C 306 nt2.27□□□□□ -2.05
YPQ1Q12010 YPL205CYPL205C 345 nt2.27□□□□□ -2.05
YPQ1Q12010 SSP1YHR184W 1716 nt2.27□□□□□ -2.05
YPQ1Q12010 BNR1YIL159W 4128 nt2.27□□□□□ -2.05
YPQ1Q12010 ESC1YMR219W 4977 nt2.27□□□□□ -2.05
YPQ1Q12010 CLN3YAL040C 1743 nt2.26□□□□□ -2.05
YPQ1Q12010 YDR338CYDR338C 2088 nt2.26□□□□□ -2.05
YPQ1Q12010 YDR239CYDR239C 2364 nt2.26□□□□□ -2.05
YPQ1Q12010 YCR090CYCR090C 549 nt2.26□□□□□ -2.05
YPQ1Q12010 snR76snR76 109 nt2.26□□□□□ -2.05
YPQ1Q12010 YDR537CYDR537C 606 nt2.26□□□□□ -2.05
YPQ1Q12010 GCN4YEL009C 846 nt2.26□□□□□ -2.05
YPQ1Q12010 TIM10YHR005C-A 282 nt2.26□□□□□ -2.05
YPQ1Q12010 YLR154W-EYLR154W-E 204 nt2.26□□□□□ -2.05
YPQ1Q12010 RPS22BYLR367W 393 nt2.26□□□□□ -2.05
YPQ1Q12010 YMR304C-AYMR304C-A 351 nt2.26□□□□□ -2.05
YPQ1Q12010 PHO80YOL001W 882 nt2.26□□□□□ -2.05
YPQ1Q12010 ISU1YPL135W 498 nt2.26□□□□□ -2.05
YPQ1Q12010 YBR062CYBR062C 543 nt2.26□□□□□ -2.05
YPQ1Q12010 YBL005W-BYBL005W-B 5268 nt2.26□□□□□ -2.05
YPQ1Q12010 SMY2YBR172C 2223 nt2.26□□□□□ -2.05
YPQ1Q12010 KRE33YNL132W 3171 nt2.26□□□□□ -2.05
YPQ1Q12010 PUF4YGL014W 2667 nt2.25□□□□□ -2.05
YPQ1Q12010 ASM4YDL088C 1587 nt2.25□□□□□ -2.05
YPQ1Q12010 TRA1YHR099W 11235 nt2.25□□□□□ -2.05
YPQ1Q12010 YGR042WYGR042W 816 nt2.25□□□□□ -2.05
YPQ1Q12010 OTU2YHL013C 924 nt2.25□□□□□ -2.05
YPQ1Q12010 YJL086CYJL086C 369 nt2.25□□□□□ -2.05
YPQ1Q12010 YLR255CYLR255C 354 nt2.25□□□□□ -2.05
YPQ1Q12010 YMR144WYMR144W 1029 nt2.25□□□□□ -2.05
YPQ1Q12010 TOM22YNL131W 459 nt2.25□□□□□ -2.05
YPQ1Q12010 ATX2YOR079C 942 nt2.25□□□□□ -2.05
YPQ1Q12010 YPR145C-AYPR145C-A 237 nt2.25□□□□□ -2.05
YPQ1Q12010 RPB5YBR154C 648 nt2.25□□□□□ -2.05
YPQ1Q12010 ICR1ICR1 3199 nt2.25□□□□□ -2.05
YPQ1Q12010 SIR3YLR442C 2937 nt2.24□□□□□ -2.05
YPQ1Q12010 YDR199WYDR199W 366 nt2.24□□□□□ -2.05
YPQ1Q12010 BTT1YDR252W 450 nt2.24□□□□□ -2.05
YPQ1Q12010 CHZ1YER030W 462 nt2.24□□□□□ -2.05
YPQ1Q12010 YJL007CYJL007C 315 nt2.24□□□□□ -2.05
YPQ1Q12010 YJL202CYJL202C 348 nt2.24□□□□□ -2.05
YPQ1Q12010 SYM1YLR251W 594 nt2.24□□□□□ -2.05
YPQ1Q12010 YLR252WYLR252W 306 nt2.24□□□□□ -2.05
YPQ1Q12010 YLR264C-AYLR264C-A 117 nt2.24□□□□□ -2.05
YPQ1Q12010 RGM1YMR182C 636 nt2.24□□□□□ -2.05
YPQ1Q12010 YBT1YLL048C 4986 nt2.24□□□□□ -2.05
YPQ1Q12010 AMS1YGL156W 3252 nt2.24□□□□□ -2.05
YPQ1Q12010 TMA64YDR117C 1698 nt2.24□□□□□ -2.05
YPQ1Q12010 YKU80YMR106C 1890 nt2.24□□□□□ -2.05
YPQ1Q12010 ALK2YBL009W 2031 nt2.24□□□□□ -2.05
YPQ1Q12010 UTP22YGR090W 3714 nt2.24□□□□□ -2.05
YPQ1Q12010 COG3YER157W 2406 nt2.23□□□□□ -2.05
YPQ1Q12010 SCY1YGL083W 2415 nt2.23□□□□□ -2.05
YPQ1Q12010 SPR3YGR059W 1539 nt2.23□□□□□ -2.05
YPQ1Q12010 UBP16YPL072W 1500 nt2.23□□□□□ -2.05
YPQ1Q12010 ORC2YBR060C 1863 nt2.23□□□□□ -2.05
YPQ1Q12010 PCK1YKR097W 1650 nt2.23□□□□□ -2.05
YPQ1Q12010 IRC2YDR112W 309 nt2.23□□□□□ -2.05
YPQ1Q12010 ADK1YDR226W 669 nt2.23□□□□□ -2.05
YPQ1Q12010 MET32YDR253C 576 nt2.23□□□□□ -2.05
YPQ1Q12010 RPL9AYGL147C 576 nt2.23□□□□□ -2.05
YPQ1Q12010 COX13YGL191W 390 nt2.23□□□□□ -2.05
YPQ1Q12010 EMP24YGL200C 612 nt2.23□□□□□ -2.05
YPQ1Q12010 SPO13YHR014W 876 nt2.23□□□□□ -2.05
YPQ1Q12010 YAL042C-AYAL042C-A 378 nt2.23□□□□□ -2.05
YPQ1Q12010 RNP1YLL046C 750 nt2.23□□□□□ -2.05
YPQ1Q12010 COX8YLR395C 237 nt2.23□□□□□ -2.05
YPQ1Q12010 YMR173W-AYMR173W-A 1185 nt2.23□□□□□ -2.05
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 58.8 ms