Protein–RNA interactions for Protein: Q08438

VHS3, Phosphopantothenoylcysteine decarboxylase subunit VHS3, yeastyeast

Predictions only

Length 674 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
VHS3Q08438 YOR192C-CYOR192C-C 237 nt3.17□□□□□ -1.9
VHS3Q08438 YOR199WYOR199W 330 nt3.17□□□□□ -1.9
VHS3Q08438 YPR014CYPR014C 330 nt3.17□□□□□ -1.9
VHS3Q08438 FUN30YAL019W 3396 nt3.17□□□□□ -1.9
VHS3Q08438 NIC96YFR002W 2520 nt3.17□□□□□ -1.9
VHS3Q08438 SNT1YCR033W 3681 nt3.16□□□□□ -1.9
VHS3Q08438 MED1YPR070W 1701 nt3.16□□□□□ -1.9
VHS3Q08438 DRS2YAL026C 4068 nt3.16□□□□□ -1.9
VHS3Q08438 ATP17YDR377W 306 nt3.16□□□□□ -1.9
VHS3Q08438 TSA2YDR453C 591 nt3.16□□□□□ -1.9
VHS3Q08438 IRC4YDR540C 540 nt3.16□□□□□ -1.9
VHS3Q08438 YGR035CYGR035C 351 nt3.16□□□□□ -1.9
VHS3Q08438 YOL159C-AYOL159C-A 273 nt3.16□□□□□ -1.9
VHS3Q08438 GIS4YML006C 2325 nt3.16□□□□□ -1.9
VHS3Q08438 YAT2YER024W 2772 nt3.16□□□□□ -1.9
VHS3Q08438 BOI1YBL085W 2943 nt3.16□□□□□ -1.9
VHS3Q08438 MOT1YPL082C 5604 nt3.15□□□□□ -1.91
VHS3Q08438 YER137W-AYER137W-A 306 nt3.15□□□□□ -1.91
VHS3Q08438 SEN54YPL083C 1404 nt3.15□□□□□ -1.91
VHS3Q08438 HFD1YMR110C 1599 nt3.15□□□□□ -1.91
VHS3Q08438 FAR1YJL157C 2493 nt3.15□□□□□ -1.91
VHS3Q08438 KAP104YBR017C 2757 nt3.15□□□□□ -1.91
VHS3Q08438 MKT1YNL085W 2493 nt3.14□□□□□ -1.91
VHS3Q08438 YAL063C-AYAL063C-A 291 nt3.14□□□□□ -1.91
VHS3Q08438 CGI121YML036W 546 nt3.14□□□□□ -1.91
VHS3Q08438 YMR316C-AYMR316C-A 312 nt3.14□□□□□ -1.91
VHS3Q08438 YOR121CYOR121C 306 nt3.14□□□□□ -1.91
VHS3Q08438 YPL276WYPL276W 438 nt3.14□□□□□ -1.91
VHS3Q08438 YPR039WYPR039W 336 nt3.14□□□□□ -1.91
VHS3Q08438 BCH1YMR237W 2175 nt3.14□□□□□ -1.91
VHS3Q08438 NTO1YPR031W 2247 nt3.13□□□□□ -1.91
VHS3Q08438 APC11YDL008W 498 nt3.13□□□□□ -1.91
VHS3Q08438 HPA3YEL066W 540 nt3.13□□□□□ -1.91
VHS3Q08438 YHL006W-AYHL006W-A 354 nt3.13□□□□□ -1.91
VHS3Q08438 RPS21BYJL136C 264 nt3.13□□□□□ -1.91
VHS3Q08438 RPS1AYLR441C 768 nt3.13□□□□□ -1.91
VHS3Q08438 YMR193C-AYMR193C-A 387 nt3.13□□□□□ -1.91
VHS3Q08438 RPS7BYNL096C 573 nt3.13□□□□□ -1.91
VHS3Q08438 NSL1YPL233W 651 nt3.13□□□□□ -1.91
VHS3Q08438 PDC2YDR081C 2778 nt3.13□□□□□ -1.91
VHS3Q08438 CCT7YJL111W 1653 nt3.13□□□□□ -1.91
VHS3Q08438 NDT80YHR124W 1884 nt3.13□□□□□ -1.91
VHS3Q08438 VAS1YGR094W 3315 nt3.12□□□□□ -1.91
VHS3Q08438 YDR008CYDR008C 351 nt3.12□□□□□ -1.91
VHS3Q08438 NOP19YGR251W 591 nt3.12□□□□□ -1.91
VHS3Q08438 RPC10YHR143W-A 213 nt3.12□□□□□ -1.91
VHS3Q08438 PET191YJR034W 327 nt3.12□□□□□ -1.91
VHS3Q08438 YJR140W-AYJR140W-A 150 nt3.12□□□□□ -1.91
VHS3Q08438 YKL136WYKL136W 399 nt3.12□□□□□ -1.91
VHS3Q08438 ICY1YMR195W 384 nt3.12□□□□□ -1.91
VHS3Q08438 SWM2YNR004W 441 nt3.12□□□□□ -1.91
VHS3Q08438 YJR098CYJR098C 1971 nt3.12□□□□□ -1.91
VHS3Q08438 ITC1YGL133W 3795 nt3.12□□□□□ -1.91
VHS3Q08438 DIE2YGR227W 1578 nt3.12□□□□□ -1.91
VHS3Q08438 RCY1YJL204C 2523 nt3.11□□□□□ -1.91
VHS3Q08438 MRH1YDR033W 963 nt3.11□□□□□ -1.91
VHS3Q08438 RPL27BYDR471W 411 nt3.11□□□□□ -1.91
VHS3Q08438 YER188C-AYER188C-A 300 nt3.11□□□□□ -1.91
VHS3Q08438 YIL115W-AYIL115W-A 372 nt3.11□□□□□ -1.91
VHS3Q08438 PEP8YJL053W 1140 nt3.11□□□□□ -1.91
VHS3Q08438 YKL111CYKL111C 336 nt3.11□□□□□ -1.91
VHS3Q08438 YML099W-AYML099W-A 330 nt3.11□□□□□ -1.91
VHS3Q08438 SLH1YGR271W 5904 nt3.11□□□□□ -1.91
VHS3Q08438 YTA7YGR270W 4140 nt3.1□□□□□ -1.91
VHS3Q08438 tQ(UUG)BtQ(UUG)B 72 nt3.1□□□□□ -1.91
VHS3Q08438 FYV4YHR059W 393 nt3.1□□□□□ -1.91
VHS3Q08438 YHR139C-AYHR139C-A 312 nt3.1□□□□□ -1.91
VHS3Q08438 BAT1YHR208W 1182 nt3.1□□□□□ -1.91
VHS3Q08438 YIL054WYIL054W 318 nt3.1□□□□□ -1.91
VHS3Q08438 YML009C-AYML009C-A 327 nt3.1□□□□□ -1.91
VHS3Q08438 SMC2YFR031C 3513 nt3.1□□□□□ -1.91
VHS3Q08438 ROM1YGR070W 3468 nt3.1□□□□□ -1.91
VHS3Q08438 SIP3YNL257C 3690 nt3.09□□□□□ -1.91
VHS3Q08438 SPC72YAL047C 1869 nt3.09□□□□□ -1.91
VHS3Q08438 DYN2YDR424C 279 nt3.09□□□□□ -1.91
VHS3Q08438 YER107W-AYER107W-A 321 nt3.09□□□□□ -1.91
VHS3Q08438 RPL19BYBL027W 570 nt3.09□□□□□ -1.91
VHS3Q08438 YOR146WYOR146W 306 nt3.09□□□□□ -1.91
VHS3Q08438 snR42snR42 351 nt3.09□□□□□ -1.91
VHS3Q08438 AYT1YLL063C 1425 nt3.09□□□□□ -1.92
VHS3Q08438 GCD6YDR211W 2139 nt3.08□□□□□ -1.92
VHS3Q08438 ECM29YHL030W 5607 nt3.08□□□□□ -1.92
VHS3Q08438 PMR1YGL167C 2853 nt3.08□□□□□ -1.92
VHS3Q08438 YDL068WYDL068W 330 nt3.08□□□□□ -1.92
VHS3Q08438 YMR31YFR049W 372 nt3.08□□□□□ -1.92
VHS3Q08438 YPL225WYPL225W 441 nt3.08□□□□□ -1.92
VHS3Q08438 TOR1YJR066W 7413 nt3.07□□□□□ -1.92
VHS3Q08438 JIP3YLR331C 378 nt3.07□□□□□ -1.92
VHS3Q08438 RPL6AYML073C 531 nt3.07□□□□□ -1.92
VHS3Q08438 PEP12YOR036W 867 nt3.07□□□□□ -1.92
VHS3Q08438 GCD10YNL062C 1437 nt3.07□□□□□ -1.92
VHS3Q08438 SEC7YDR170C 6030 nt3.07□□□□□ -1.92
VHS3Q08438 YSW1YBR148W 1830 nt3.07□□□□□ -1.92
VHS3Q08438 NPR1YNL183C 2373 nt3.07□□□□□ -1.92
VHS3Q08438 ATG26YLR189C 3597 nt3.06□□□□□ -1.92
VHS3Q08438 FMP32YFL046W 624 nt3.06□□□□□ -1.92
VHS3Q08438 YHL005CYHL005C 393 nt3.06□□□□□ -1.92
VHS3Q08438 YHR052W-AYHR052W-A 195 nt3.06□□□□□ -1.92
VHS3Q08438 YHR054W-AYHR054W-A 195 nt3.06□□□□□ -1.92
VHS3Q08438 TIM8YJR135W-A 264 nt3.06□□□□□ -1.92
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 35.1 ms