Protein–RNA interactions for Protein: P53847

DSL1, Protein transport protein DSL1, yeast

Predictions only

Length 754 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
DSL1	P53847	HRI1	YLR301W	735 nt		2.49	□□□□□ -2.01
DSL1	P53847	LSM2	YBL026W	288 nt		2.49	□□□□□ -2.01
DSL1	P53847	YNL122C	YNL122C	348 nt		2.49	□□□□□ -2.01
DSL1	P53847	SWM2	YNR004W	441 nt		2.49	□□□□□ -2.01
DSL1	P53847	PEP12	YOR036W	867 nt		2.49	□□□□□ -2.01
DSL1	P53847	SVL3	YPL032C	2478 nt		2.49	□□□□□ -2.01
DSL1	P53847	YIL080W	YIL080W	4722 nt		2.49	□□□□□ -2.01
DSL1	P53847	FUS1	YCL027W	1539 nt		2.48	□□□□□ -2.01
DSL1	P53847	HAA1	YPR008W	2085 nt		2.48	□□□□□ -2.01
DSL1	P53847	YDR199W	YDR199W	366 nt		2.48	□□□□□ -2.01
DSL1	P53847	TIF35	YDR429C	825 nt		2.48	□□□□□ -2.01
DSL1	P53847	SPO13	YHR014W	876 nt		2.48	□□□□□ -2.01
DSL1	P53847	YLR012C	YLR012C	300 nt		2.48	□□□□□ -2.01
DSL1	P53847	NYV1	YLR093C	762 nt		2.48	□□□□□ -2.01
DSL1	P53847	SSF2	YDR312W	1362 nt		2.48	□□□□□ -2.01
DSL1	P53847	SIP3	YNL257C	3690 nt		2.47	□□□□□ -2.01
DSL1	P53847	YJL181W	YJL181W	1836 nt		2.47	□□□□□ -2.01
DSL1	P53847	YEL030C-A	YEL030C-A	315 nt		2.47	□□□□□ -2.01
DSL1	P53847	YER038W-A	YER038W-A	381 nt		2.47	□□□□□ -2.01
DSL1	P53847	PEX17	YNL214W	600 nt		2.47	□□□□□ -2.01
DSL1	P53847	AYT1	YLL063C	1425 nt		2.47	□□□□□ -2.01
DSL1	P53847	RGL1	YPL066W	1440 nt		2.47	□□□□□ -2.01
DSL1	P53847	SNX41	YDR425W	1878 nt		2.47	□□□□□ -2.01
DSL1	P53847	RLF2	YPR018W	1821 nt		2.47	□□□□□ -2.01
DSL1	P53847	IRA2	YOL081W	9240 nt		2.47	□□□□□ -2.01
DSL1	P53847	AMS1	YGL156W	3252 nt		2.46	□□□□□ -2.01
DSL1	P53847	TPS2	YDR074W	2691 nt		2.46	□□□□□ -2.01
DSL1	P53847	YCR081C-A	YCR081C-A	237 nt		2.46	□□□□□ -2.02
DSL1	P53847	YFH1	YDL120W	525 nt		2.46	□□□□□ -2.02
DSL1	P53847	ADK1	YDR226W	669 nt		2.46	□□□□□ -2.02
DSL1	P53847	NOP19	YGR251W	591 nt		2.46	□□□□□ -2.02
DSL1	P53847	TIM10	YHR005C-A	282 nt		2.46	□□□□□ -2.02
DSL1	P53847	YLR154W-E	YLR154W-E	204 nt		2.46	□□□□□ -2.02
DSL1	P53847	ISU1	YPL135W	498 nt		2.46	□□□□□ -2.02
DSL1	P53847	SPB1	YCL054W	2526 nt		2.46	□□□□□ -2.02
DSL1	P53847	YDR186C	YDR186C	2634 nt		2.46	□□□□□ -2.02
DSL1	P53847	TRM2	YKR056W	1920 nt		2.46	□□□□□ -2.02
DSL1	P53847	ORC1	YML065W	2745 nt		2.46	□□□□□ -2.02
DSL1	P53847	PDR1	YGL013C	3207 nt		2.46	□□□□□ -2.02
DSL1	P53847	RPL9A	YGL147C	576 nt		2.45	□□□□□ -2.02
DSL1	P53847	YKL066W	YKL066W	444 nt		2.45	□□□□□ -2.02
DSL1	P53847	FYV7	YLR068W	456 nt		2.45	□□□□□ -2.02
DSL1	P53847	ARV1	YLR242C	966 nt		2.45	□□□□□ -2.02
DSL1	P53847	YNL046W	YNL046W	519 nt		2.45	□□□□□ -2.02
DSL1	P53847	ESF2	YNR054C	951 nt		2.45	□□□□□ -2.02
DSL1	P53847	SVS1	YPL163C	783 nt		2.45	□□□□□ -2.02
DSL1	P53847	ALG14	YBR070C	714 nt		2.45	□□□□□ -2.02
DSL1	P53847	PUF4	YGL014W	2667 nt		2.45	□□□□□ -2.02
DSL1	P53847	SHE9	YDR393W	1371 nt		2.45	□□□□□ -2.02
DSL1	P53847	YCR108C	YCR108C	192 nt		2.44	□□□□□ -2.02
DSL1	P53847	RPS17B	YDR447C	411 nt		2.44	□□□□□ -2.02
DSL1	P53847	RPL29	YFR032C-A	180 nt		2.44	□□□□□ -2.02
DSL1	P53847	RTS3	YGR161C	792 nt		2.44	□□□□□ -2.02
DSL1	P53847	YKL033W-A	YKL033W-A	711 nt		2.44	□□□□□ -2.02
DSL1	P53847	YNL146C-A	YNL146C-A	195 nt		2.44	□□□□□ -2.02
DSL1	P53847	PET123	YOR158W	957 nt		2.44	□□□□□ -2.02
DSL1	P53847	TOA1	YOR194C	861 nt		2.44	□□□□□ -2.02
DSL1	P53847	NSL1	YPL233W	651 nt		2.44	□□□□□ -2.02
DSL1	P53847	KSP1	YHR082C	3090 nt		2.44	□□□□□ -2.02
DSL1	P53847	NPR1	YNL183C	2373 nt		2.44	□□□□□ -2.02
DSL1	P53847	YIL166C	YIL166C	1629 nt		2.43	□□□□□ -2.02
DSL1	P53847	VAC8	YEL013W	1737 nt		2.43	□□□□□ -2.02
DSL1	P53847	HNT1	YDL125C	477 nt		2.43	□□□□□ -2.02
DSL1	P53847	MXR1	YER042W	555 nt		2.43	□□□□□ -2.02
DSL1	P53847	RAD6	YGL058W	519 nt		2.43	□□□□□ -2.02
DSL1	P53847	RPF1	YHR088W	888 nt		2.43	□□□□□ -2.02
DSL1	P53847	MCD1	YDL003W	1701 nt		2.42	□□□□□ -2.02
DSL1	P53847	TRS130	YMR218C	3309 nt		2.42	□□□□□ -2.02
DSL1	P53847	SSD1	YDR293C	3753 nt		2.42	□□□□□ -2.02
DSL1	P53847	AFI1	YOR129C	2682 nt		2.42	□□□□□ -2.02
DSL1	P53847	TSA2	YDR453C	591 nt		2.42	□□□□□ -2.02
DSL1	P53847	PEX4	YGR133W	552 nt		2.42	□□□□□ -2.02
DSL1	P53847	RGM1	YMR182C	636 nt		2.42	□□□□□ -2.02
DSL1	P53847	YOR032W-A	YOR032W-A	201 nt		2.42	□□□□□ -2.02
DSL1	P53847	YOR055W	YOR055W	435 nt		2.42	□□□□□ -2.02
DSL1	P53847	YNL034W	YNL034W	1839 nt		2.42	□□□□□ -2.02
DSL1	P53847	TOR1	YJR066W	7413 nt		2.41	□□□□□ -2.02
DSL1	P53847	GLC7	YER133W	939 nt		2.41	□□□□□ -2.02
DSL1	P53847	LAG1	YHL003C	1236 nt		2.41	□□□□□ -2.02
DSL1	P53847	GPI14	YJR013W	1212 nt		2.41	□□□□□ -2.02
DSL1	P53847	FPR1	YNL135C	345 nt		2.41	□□□□□ -2.02
DSL1	P53847	COQ10	YOL008W	624 nt		2.41	□□□□□ -2.02
DSL1	P53847	PTP3	YER075C	2787 nt		2.41	□□□□□ -2.02
DSL1	P53847	YAP3	YHL009C	993 nt		2.4	□□□□□ -2.03
DSL1	P53847	YAL042C-A	YAL042C-A	378 nt		2.4	□□□□□ -2.03
DSL1	P53847	COX14	YML129C	213 nt		2.4	□□□□□ -2.03
DSL1	P53847	RGA2	YDR379W	3030 nt		2.39	□□□□□ -2.03
DSL1	P53847	GPI17	YDR434W	1605 nt		2.39	□□□□□ -2.03
DSL1	P53847	USO1	YDL058W	5373 nt		2.39	□□□□□ -2.03
DSL1	P53847	YCR001W	YCR001W	315 nt		2.39	□□□□□ -2.03
DSL1	P53847	PEP8	YJL053W	1140 nt		2.39	□□□□□ -2.03
DSL1	P53847	YPL080C	YPL080C	327 nt		2.39	□□□□□ -2.03
DSL1	P53847	TAE2	YPL009C	3117 nt		2.39	□□□□□ -2.03
DSL1	P53847	PSO2	YMR137C	1986 nt		2.38	□□□□□ -2.03
DSL1	P53847	snR76	snR76	109 nt		2.38	□□□□□ -2.03
DSL1	P53847	ASM4	YDL088C	1587 nt		2.38	□□□□□ -2.03
DSL1	P53847	RPL16A	YIL133C	600 nt		2.38	□□□□□ -2.03
DSL1	P53847	CMS1	YLR003C	876 nt		2.38	□□□□□ -2.03
DSL1	P53847	CTK3	YML112W	891 nt		2.38	□□□□□ -2.03
DSL1	P53847	RPL36A	YMR194W	303 nt		2.38	□□□□□ -2.03

Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 43.3 ms