Protein–RNA interactions for Protein: P40087

DDI1, DNA damage-inducible protein 1, yeastyeast

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
DDI1P40087 MF(ALPHA)1YPL187W 498 nt1.87□□□□□ -2.11
DDI1P40087 NSL1YPL233W 651 nt1.87□□□□□ -2.11
DDI1P40087 SLM4YBR077C 489 nt1.87□□□□□ -2.11
DDI1P40087 RUD3YOR216C 1455 nt1.87□□□□□ -2.11
DDI1P40087 CDC37YDR168W 1521 nt1.86□□□□□ -2.11
DDI1P40087 GDI1YER136W 1356 nt1.86□□□□□ -2.11
DDI1P40087 SIR4YDR227W 4077 nt1.86□□□□□ -2.11
DDI1P40087 YGR226CYGR226C 210 nt1.86□□□□□ -2.11
DDI1P40087 YGR242WYGR242W 309 nt1.86□□□□□ -2.11
DDI1P40087 SHE2YKL130C 741 nt1.86□□□□□ -2.11
DDI1P40087 YJL070CYJL070C 2667 nt1.86□□□□□ -2.11
DDI1P40087 VPH1YOR270C 2523 nt1.86□□□□□ -2.11
DDI1P40087 IPT1YDR072C 1584 nt1.85□□□□□ -2.11
DDI1P40087 VPS8YAL002W 3825 nt1.85□□□□□ -2.11
DDI1P40087 ECM25YJL201W 1800 nt1.85□□□□□ -2.11
DDI1P40087 YCR013CYCR013C 648 nt1.85□□□□□ -2.11
DDI1P40087 VTC1YER072W 390 nt1.85□□□□□ -2.11
DDI1P40087 LOC1YFR001W 615 nt1.85□□□□□ -2.11
DDI1P40087 YFR056CYFR056C 369 nt1.85□□□□□ -2.11
DDI1P40087 YET1YKL065C 621 nt1.85□□□□□ -2.11
DDI1P40087 VPS63YLR261C 327 nt1.85□□□□□ -2.11
DDI1P40087 TMA10YLR327C 261 nt1.85□□□□□ -2.11
DDI1P40087 YOR169CYOR169C 465 nt1.85□□□□□ -2.11
DDI1P40087 ARL3YPL051W 597 nt1.85□□□□□ -2.11
DDI1P40087 ECM5YMR176W 4236 nt1.85□□□□□ -2.11
DDI1P40087 SSF2YDR312W 1362 nt1.85□□□□□ -2.11
DDI1P40087 KAR9YPL269W 1935 nt1.84□□□□□ -2.11
DDI1P40087 IRC20YLR247C 4671 nt1.84□□□□□ -2.11
DDI1P40087 GPI8YDR331W 1236 nt1.84□□□□□ -2.11
DDI1P40087 NCB2YDR397C 441 nt1.84□□□□□ -2.11
DDI1P40087 YER158W-AYER158W-A 216 nt1.84□□□□□ -2.11
DDI1P40087 YER172C-AYER172C-A 381 nt1.84□□□□□ -2.11
DDI1P40087 YHR052W-AYHR052W-A 195 nt1.84□□□□□ -2.11
DDI1P40087 YHR054W-AYHR054W-A 195 nt1.84□□□□□ -2.11
DDI1P40087 YIL058WYIL058W 285 nt1.84□□□□□ -2.11
DDI1P40087 ATX2YOR079C 942 nt1.84□□□□□ -2.11
DDI1P40087 LEU3YLR451W 2661 nt1.84□□□□□ -2.11
DDI1P40087 RTT101YJL047C 2529 nt1.83□□□□□ -2.12
DDI1P40087 YEL057CYEL057C 702 nt1.83□□□□□ -2.12
DDI1P40087 PEA2YER149C 1263 nt1.83□□□□□ -2.12
DDI1P40087 YGL230CYGL230C 444 nt1.83□□□□□ -2.12
DDI1P40087 COX3Q0275 810 nt1.83□□□□□ -2.12
DDI1P40087 PSY1YKL076C 384 nt1.83□□□□□ -2.12
DDI1P40087 YKR051WYKR051W 1257 nt1.83□□□□□ -2.12
DDI1P40087 YAL064WYAL064W 285 nt1.83□□□□□ -2.12
DDI1P40087 MET18YIL128W 3099 nt1.83□□□□□ -2.12
DDI1P40087 FAB1YFR019W 6837 nt1.83□□□□□ -2.12
DDI1P40087 UBP11YKR098C 2154 nt1.82□□□□□ -2.12
DDI1P40087 SET2YJL168C 2202 nt1.82□□□□□ -2.12
DDI1P40087 YJL086CYJL086C 369 nt1.82□□□□□ -2.12
DDI1P40087 RPS22BYLR367W 393 nt1.82□□□□□ -2.12
DDI1P40087 GIM3YNL153C 390 nt1.82□□□□□ -2.12
DDI1P40087 TRL1YJL087C 2484 nt1.82□□□□□ -2.12
DDI1P40087 NIC96YFR002W 2520 nt1.82□□□□□ -2.12
DDI1P40087 SSY1YDR160W 2559 nt1.82□□□□□ -2.12
DDI1P40087 15S_rRNA15S_rRNA 1649 nt1.81□□□□□ -2.12
DDI1P40087 FMP16YDR070C 282 nt1.81□□□□□ -2.12
DDI1P40087 AAD16YFL057C 459 nt1.81□□□□□ -2.12
DDI1P40087 PRS3YHL011C 963 nt1.81□□□□□ -2.12
DDI1P40087 YHR050W-AYHR050W-A 171 nt1.81□□□□□ -2.12
DDI1P40087 YIR020C-BYIR020C-B 735 nt1.81□□□□□ -2.12
DDI1P40087 YLR217WYLR217W 324 nt1.81□□□□□ -2.12
DDI1P40087 SFG1YOR315W 1041 nt1.81□□□□□ -2.12
DDI1P40087 STD1YOR047C 1335 nt1.81□□□□□ -2.12
DDI1P40087 REV1YOR346W 2958 nt1.81□□□□□ -2.12
DDI1P40087 UBP1YDL122W 2430 nt1.8□□□□□ -2.12
DDI1P40087 RTT107YHR154W 3213 nt1.8□□□□□ -2.12
DDI1P40087 YCR100CYCR100C 951 nt1.8□□□□□ -2.12
DDI1P40087 UBC5YDR059C 447 nt1.8□□□□□ -2.12
DDI1P40087 SDL1YIL167W 633 nt1.8□□□□□ -2.12
DDI1P40087 SNC1YAL030W 354 nt1.8□□□□□ -2.12
DDI1P40087 YKR075W-AYKR075W-A 270 nt1.8□□□□□ -2.12
DDI1P40087 CHC1YGL206C 4962 nt1.8□□□□□ -2.12
DDI1P40087 YLR198CYLR198C 360 nt1.79□□□□□ -2.12
DDI1P40087 ATG38YLR211C 681 nt1.79□□□□□ -2.12
DDI1P40087 UBC12YLR306W 567 nt1.79□□□□□ -2.12
DDI1P40087 YMR247W-AYMR247W-A 144 nt1.79□□□□□ -2.12
DDI1P40087 BRX1YOL077C 876 nt1.79□□□□□ -2.12
DDI1P40087 YOR333CYOR333C 417 nt1.79□□□□□ -2.12
DDI1P40087 NCS2YNL119W 1482 nt1.79□□□□□ -2.12
DDI1P40087 PDR8YLR266C 2106 nt1.79□□□□□ -2.12
DDI1P40087 RTP1YMR185W 2946 nt1.79□□□□□ -2.12
DDI1P40087 PTC5YOR090C 1719 nt1.78□□□□□ -2.12
DDI1P40087 VPS38YLR360W 1320 nt1.78□□□□□ -2.12
DDI1P40087 DAD1YDR016C 285 nt1.78□□□□□ -2.12
DDI1P40087 LIN1YHR156C 1023 nt1.78□□□□□ -2.12
DDI1P40087 tT(UGU)HtT(UGU)H 72 nt1.78□□□□□ -2.12
DDI1P40087 YHR210CYHR210C 1026 nt1.78□□□□□ -2.12
DDI1P40087 YJL133C-AYJL133C-A 225 nt1.78□□□□□ -2.12
DDI1P40087 RAM2YKL019W 951 nt1.78□□□□□ -2.12
DDI1P40087 CCW14YLR390W-A 717 nt1.78□□□□□ -2.12
DDI1P40087 RIO2YNL207W 1278 nt1.78□□□□□ -2.12
DDI1P40087 YPL034WYPL034W 498 nt1.78□□□□□ -2.12
DDI1P40087 ADF1YCL058W-A 342 nt1.78□□□□□ -2.12
DDI1P40087 YHR214C-BYHR214C-B 5382 nt1.78□□□□□ -2.13
DDI1P40087 MYO2YOR326W 4725 nt1.78□□□□□ -2.13
DDI1P40087 LHS1YKL073W 2646 nt1.77□□□□□ -2.13
DDI1P40087 ATG9YDL149W 2994 nt1.77□□□□□ -2.13
DDI1P40087 TSA2YDR453C 591 nt1.77□□□□□ -2.13
DDI1P40087 HYR1YIR037W 492 nt1.77□□□□□ -2.13
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 17.6 ms