Protein–RNA interactions for Protein: P32340

NDI1, Rotenone-insensitive NADH-ubiquinone oxidoreductase, mitochondrial, yeastyeast

Predictions only

Length 513 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
NDI1P32340 OTU2YHL013C 924 nt2.54□□□□□ -2
NDI1P32340 PAU23YLR037C 375 nt2.54□□□□□ -2
NDI1P32340 HRI1YLR301W 735 nt2.54□□□□□ -2
NDI1P32340 GPI15YNL038W 690 nt2.54□□□□□ -2
NDI1P32340 COQ10YOL008W 624 nt2.54□□□□□ -2
NDI1P32340 OST2YOR103C 393 nt2.54□□□□□ -2
NDI1P32340 ESL2YKR096W 3588 nt2.54□□□□□ -2
NDI1P32340 RLI1YDR091C 1827 nt2.54□□□□□ -2
NDI1P32340 SSF2YDR312W 1362 nt2.53□□□□□ -2
NDI1P32340 YMR31YFR049W 372 nt2.53□□□□□ -2
NDI1P32340 COX13YGL191W 390 nt2.53□□□□□ -2
NDI1P32340 RTS3YGR161C 792 nt2.53□□□□□ -2
NDI1P32340 YAL042C-AYAL042C-A 378 nt2.53□□□□□ -2
NDI1P32340 MRP49YKL167C 414 nt2.53□□□□□ -2
NDI1P32340 YLR302CYLR302C 363 nt2.53□□□□□ -2
NDI1P32340 RRT1YBL048W 312 nt2.53□□□□□ -2
NDI1P32340 PBI2YNL015W 228 nt2.53□□□□□ -2
NDI1P32340 FPR1YNL135C 345 nt2.53□□□□□ -2
NDI1P32340 YOL134CYOL134C 390 nt2.53□□□□□ -2
NDI1P32340 YOR050CYOR050C 348 nt2.53□□□□□ -2
NDI1P32340 SPB1YCL054W 2526 nt2.53□□□□□ -2
NDI1P32340 DNL4YOR005C 2835 nt2.53□□□□□ -2
NDI1P32340 NEW1YPL226W 3591 nt2.53□□□□□ -2.01
NDI1P32340 FUS1YCL027W 1539 nt2.52□□□□□ -2.01
NDI1P32340 PDR3YBL005W 2931 nt2.52□□□□□ -2.01
NDI1P32340 GCD10YNL062C 1437 nt2.52□□□□□ -2.01
NDI1P32340 BFR1YOR198C 1413 nt2.52□□□□□ -2.01
NDI1P32340 MES1YGR264C 2256 nt2.52□□□□□ -2.01
NDI1P32340 YOR192C-AYOR192C-A 1317 nt2.52□□□□□ -2.01
NDI1P32340 YER107W-AYER107W-A 321 nt2.52□□□□□ -2.01
NDI1P32340 YAP3YHL009C 993 nt2.52□□□□□ -2.01
NDI1P32340 YPL034WYPL034W 498 nt2.52□□□□□ -2.01
NDI1P32340 ISU1YPL135W 498 nt2.52□□□□□ -2.01
NDI1P32340 TRZ1YKR079C 2517 nt2.52□□□□□ -2.01
NDI1P32340 IRA2YOL081W 9240 nt2.52□□□□□ -2.01
NDI1P32340 MRD1YPR112C 2664 nt2.52□□□□□ -2.01
NDI1P32340 ARP8YOR141C 2646 nt2.51□□□□□ -2.01
NDI1P32340 TRA1YHR099W 11235 nt2.51□□□□□ -2.01
NDI1P32340 HMLALPHA2YCL067C 633 nt2.51□□□□□ -2.01
NDI1P32340 MATALPHA2YCR039C 633 nt2.51□□□□□ -2.01
NDI1P32340 YHR130CYHR130C 336 nt2.51□□□□□ -2.01
NDI1P32340 YLR264C-AYLR264C-A 117 nt2.51□□□□□ -2.01
NDI1P32340 YHC1YLR298C 696 nt2.51□□□□□ -2.01
NDI1P32340 HHT2YNL031C 411 nt2.51□□□□□ -2.01
NDI1P32340 YNL146C-AYNL146C-A 195 nt2.51□□□□□ -2.01
NDI1P32340 YNR021WYNR021W 1215 nt2.51□□□□□ -2.01
NDI1P32340 YLR001CYLR001C 2589 nt2.51□□□□□ -2.01
NDI1P32340 BNA7YDR428C 786 nt2.5□□□□□ -2.01
NDI1P32340 ATP6Q0085 780 nt2.5□□□□□ -2.01
NDI1P32340 YER084W-AYER084W-A 513 nt2.5□□□□□ -2.01
NDI1P32340 EMC6YLL014W 327 nt2.5□□□□□ -2.01
NDI1P32340 CTK3YML112W 891 nt2.5□□□□□ -2.01
NDI1P32340 ESF2YNR054C 951 nt2.5□□□□□ -2.01
NDI1P32340 YOL150CYOL150C 312 nt2.5□□□□□ -2.01
NDI1P32340 YOR055WYOR055W 435 nt2.5□□□□□ -2.01
NDI1P32340 RPB5YBR154C 648 nt2.5□□□□□ -2.01
NDI1P32340 POM152YMR129W 4014 nt2.5□□□□□ -2.01
NDI1P32340 NPR3YHL023C 3441 nt2.49□□□□□ -2.01
NDI1P32340 PUF4YGL014W 2667 nt2.49□□□□□ -2.01
NDI1P32340 YGR042WYGR042W 816 nt2.49□□□□□ -2.01
NDI1P32340 YLR171WYLR171W 390 nt2.49□□□□□ -2.01
NDI1P32340 LSM2YBL026W 288 nt2.49□□□□□ -2.01
NDI1P32340 TOM22YNL131W 459 nt2.49□□□□□ -2.01
NDI1P32340 COG3YER157W 2406 nt2.49□□□□□ -2.01
NDI1P32340 SNF12YNR023W 1701 nt2.48□□□□□ -2.01
NDI1P32340 HYP2YEL034W 474 nt2.48□□□□□ -2.01
NDI1P32340 YER038W-AYER038W-A 381 nt2.48□□□□□ -2.01
NDI1P32340 BI2Q0110 1272 nt2.48□□□□□ -2.01
NDI1P32340 ARV1YLR242C 966 nt2.48□□□□□ -2.01
NDI1P32340 RPL36AYMR194W 303 nt2.48□□□□□ -2.01
NDI1P32340 TOP2YNL088W 4287 nt2.48□□□□□ -2.01
NDI1P32340 SGS1YMR190C 4344 nt2.48□□□□□ -2.01
NDI1P32340 YCR081C-AYCR081C-A 237 nt2.47□□□□□ -2.01
NDI1P32340 DDR48YMR173W 1293 nt2.47□□□□□ -2.01
NDI1P32340 YNL324WYNL324W 396 nt2.47□□□□□ -2.01
NDI1P32340 snR43snR43 209 nt2.47□□□□□ -2.01
NDI1P32340 AMS1YGL156W 3252 nt2.47□□□□□ -2.01
NDI1P32340 PSD2YGR170W 3417 nt2.47□□□□□ -2.01
NDI1P32340 RLF2YPR018W 1821 nt2.47□□□□□ -2.01
NDI1P32340 YDR239CYDR239C 2364 nt2.46□□□□□ -2.01
NDI1P32340 snR76snR76 109 nt2.46□□□□□ -2.02
NDI1P32340 YER119C-AYER119C-A 372 nt2.46□□□□□ -2.02
NDI1P32340 YJL127C-BYJL127C-B 159 nt2.46□□□□□ -2.02
NDI1P32340 SPC1YJR010C-A 285 nt2.46□□□□□ -2.02
NDI1P32340 YKL068W-AYKL068W-A 237 nt2.46□□□□□ -2.02
NDI1P32340 ALG14YBR070C 714 nt2.46□□□□□ -2.02
NDI1P32340 IRC16YPR038W 360 nt2.46□□□□□ -2.02
NDI1P32340 BUB1YGR188C 3066 nt2.46□□□□□ -2.02
NDI1P32340 YKU80YMR106C 1890 nt2.45□□□□□ -2.02
NDI1P32340 SIP3YNL257C 3690 nt2.45□□□□□ -2.02
NDI1P32340 GDS1YOR355W 1569 nt2.45□□□□□ -2.02
NDI1P32340 SMY2YBR172C 2223 nt2.45□□□□□ -2.02
NDI1P32340 ISW1YBR245C 3390 nt2.45□□□□□ -2.02
NDI1P32340 HMRA1YCR097W 381 nt2.45□□□□□ -2.02
NDI1P32340 RTR2YDR066C 591 nt2.45□□□□□ -2.02
NDI1P32340 GPI19YDR437W 423 nt2.45□□□□□ -2.02
NDI1P32340 YGR050CYGR050C 357 nt2.45□□□□□ -2.02
NDI1P32340 FYV4YHR059W 393 nt2.45□□□□□ -2.02
NDI1P32340 RPI1YIL119C 1224 nt2.45□□□□□ -2.02
NDI1P32340 SWM2YNR004W 441 nt2.45□□□□□ -2.02
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 17.2 ms