Protein–RNA interactions for Protein: P25579

LRE1, Laminarase-resistance protein LRE1, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 583 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
LRE1P25579 tW(CCA)PtW(CCA)P 72 nt2.84□□□□□ -1.95
LRE1P25579 LEE1YPL054W 906 nt2.84□□□□□ -1.95
LRE1P25579 MSS18YPR134W 807 nt2.84□□□□□ -1.95
LRE1P25579 COG3YER157W 2406 nt2.84□□□□□ -1.95
LRE1P25579 NET1YJL076W 3570 nt2.84□□□□□ -1.95
LRE1P25579 YHR214C-CYHR214C-C 1437 nt2.84□□□□□ -1.96
LRE1P25579 snR70snR70 164 nt2.83□□□□□ -1.96
LRE1P25579 YMR31YFR049W 372 nt2.83□□□□□ -1.96
LRE1P25579 YHL006W-AYHL006W-A 354 nt2.83□□□□□ -1.96
LRE1P25579 YHR028W-AYHR028W-A 321 nt2.83□□□□□ -1.96
LRE1P25579 FYV4YHR059W 393 nt2.83□□□□□ -1.96
LRE1P25579 YLR269CYLR269C 351 nt2.83□□□□□ -1.96
LRE1P25579 JIP3YLR331C 378 nt2.83□□□□□ -1.96
LRE1P25579 YMR001C-AYMR001C-A 231 nt2.83□□□□□ -1.96
LRE1P25579 CMC2YBL059C-A 330 nt2.83□□□□□ -1.96
LRE1P25579 SWM2YNR004W 441 nt2.83□□□□□ -1.96
LRE1P25579 ISU1YPL135W 498 nt2.83□□□□□ -1.96
LRE1P25579 NSL1YPL233W 651 nt2.83□□□□□ -1.96
LRE1P25579 UBP14YBR058C 2346 nt2.82□□□□□ -1.96
LRE1P25579 TIM11YDR322C-A 291 nt2.82□□□□□ -1.96
LRE1P25579 TSA2YDR453C 591 nt2.82□□□□□ -1.96
LRE1P25579 IRC4YDR540C 540 nt2.82□□□□□ -1.96
LRE1P25579 IES5YER092W 378 nt2.82□□□□□ -1.96
LRE1P25579 YHR125WYHR125W 306 nt2.82□□□□□ -1.96
LRE1P25579 YIL030W-AYIL030W-A 339 nt2.82□□□□□ -1.96
LRE1P25579 YOL057WYOL057W 2136 nt2.82□□□□□ -1.96
LRE1P25579 YPL197CYPL197C 414 nt2.82□□□□□ -1.96
LRE1P25579 YPL261CYPL261C 309 nt2.82□□□□□ -1.96
LRE1P25579 PDC2YDR081C 2778 nt2.81□□□□□ -1.96
LRE1P25579 YDR250CYDR250C 276 nt2.81□□□□□ -1.96
LRE1P25579 GIM4YEL003W 336 nt2.81□□□□□ -1.96
LRE1P25579 YIL054WYIL054W 318 nt2.81□□□□□ -1.96
LRE1P25579 YIR040CYIR040C 333 nt2.81□□□□□ -1.96
LRE1P25579 FUS1YCL027W 1539 nt2.81□□□□□ -1.96
LRE1P25579 DPB11YJL090C 2295 nt2.81□□□□□ -1.96
LRE1P25579 SOK1YDR006C 2706 nt2.81□□□□□ -1.96
LRE1P25579 YAT2YER024W 2772 nt2.81□□□□□ -1.96
LRE1P25579 RPN1YHR027C 2982 nt2.81□□□□□ -1.96
LRE1P25579 SPB1YCL054W 2526 nt2.8□□□□□ -1.96
LRE1P25579 YGR067CYGR067C 2415 nt2.8□□□□□ -1.96
LRE1P25579 KIN82YCR091W 2163 nt2.8□□□□□ -1.96
LRE1P25579 YER135CYER135C 393 nt2.8□□□□□ -1.96
LRE1P25579 YJR023CYJR023C 402 nt2.8□□□□□ -1.96
LRE1P25579 UNG1YML021C 1080 nt2.8□□□□□ -1.96
LRE1P25579 YPL150WYPL150W 2706 nt2.8□□□□□ -1.96
LRE1P25579 ATG13YPR185W 2217 nt2.79□□□□□ -1.96
LRE1P25579 RPS17BYDR447C 411 nt2.79□□□□□ -1.96
LRE1P25579 LAG1YHL003C 1236 nt2.79□□□□□ -1.96
LRE1P25579 YJR079WYJR079W 330 nt2.79□□□□□ -1.96
LRE1P25579 NFU1YKL040C 771 nt2.79□□□□□ -1.96
LRE1P25579 CMS1YLR003C 876 nt2.79□□□□□ -1.96
LRE1P25579 RPS28BYLR264W 204 nt2.79□□□□□ -1.96
LRE1P25579 ESF2YNR054C 951 nt2.79□□□□□ -1.96
LRE1P25579 DOA4YDR069C 2781 nt2.79□□□□□ -1.96
LRE1P25579 APC2YLR127C 2562 nt2.79□□□□□ -1.96
LRE1P25579 YNL034WYNL034W 1839 nt2.79□□□□□ -1.96
LRE1P25579 RNH70YGR276C 1662 nt2.79□□□□□ -1.96
LRE1P25579 CCT7YJL111W 1653 nt2.79□□□□□ -1.96
LRE1P25579 RCY1YJL204C 2523 nt2.78□□□□□ -1.96
LRE1P25579 YBR012W-AYBR012W-A 1323 nt2.78□□□□□ -1.96
LRE1P25579 YOR142W-AYOR142W-A 1323 nt2.78□□□□□ -1.96
LRE1P25579 YPR158W-AYPR158W-A 1323 nt2.78□□□□□ -1.96
LRE1P25579 DSE4YNR067C 3354 nt2.78□□□□□ -1.96
LRE1P25579 YER079WYER079W 633 nt2.78□□□□□ -1.96
LRE1P25579 NBL1YHR199C-A 222 nt2.78□□□□□ -1.96
LRE1P25579 RPL37AYLR185W 267 nt2.78□□□□□ -1.96
LRE1P25579 RPB11YOL005C 363 nt2.78□□□□□ -1.96
LRE1P25579 CDC33YOL139C 642 nt2.78□□□□□ -1.96
LRE1P25579 TFC4YGR047C 3078 nt2.78□□□□□ -1.96
LRE1P25579 GPI17YDR434W 1605 nt2.78□□□□□ -1.96
LRE1P25579 TRM2YKR056W 1920 nt2.78□□□□□ -1.97
LRE1P25579 RLF2YPR018W 1821 nt2.77□□□□□ -1.97
LRE1P25579 FKS3YMR306W 5358 nt2.77□□□□□ -1.97
LRE1P25579 YPP1YGR198W 2454 nt2.77□□□□□ -1.97
LRE1P25579 YDR269CYDR269C 324 nt2.77□□□□□ -1.97
LRE1P25579 CRG1YHR209W 876 nt2.77□□□□□ -1.97
LRE1P25579 PEP8YJL053W 1140 nt2.77□□□□□ -1.97
LRE1P25579 YOR293C-AYOR293C-A 150 nt2.77□□□□□ -1.97
LRE1P25579 DGK1YOR311C 873 nt2.77□□□□□ -1.97
LRE1P25579 YBR032WYBR032W 303 nt2.77□□□□□ -1.97
LRE1P25579 AYT1YLL063C 1425 nt2.76□□□□□ -1.97
LRE1P25579 ECM5YMR176W 4236 nt2.76□□□□□ -1.97
LRE1P25579 YER087C-AYER087C-A 552 nt2.76□□□□□ -1.97
LRE1P25579 YOL159CYOL159C 516 nt2.76□□□□□ -1.97
LRE1P25579 YOR248WYOR248W 303 nt2.76□□□□□ -1.97
LRE1P25579 TSC3YBR058C-A 243 nt2.76□□□□□ -1.97
LRE1P25579 LEU3YLR451W 2661 nt2.76□□□□□ -1.97
LRE1P25579 RGR1YLR071C 3249 nt2.76□□□□□ -1.97
LRE1P25579 MSB2YGR014W 3921 nt2.76□□□□□ -1.97
LRE1P25579 YBL005W-BYBL005W-B 5268 nt2.76□□□□□ -1.97
LRE1P25579 ROY1YMR258C 1662 nt2.76□□□□□ -1.97
LRE1P25579 YIL166CYIL166C 1629 nt2.75□□□□□ -1.97
LRE1P25579 MDM32YOR147W 1869 nt2.75□□□□□ -1.97
LRE1P25579 GIS4YML006C 2325 nt2.75□□□□□ -1.97
LRE1P25579 HPA3YEL066W 540 nt2.75□□□□□ -1.97
LRE1P25579 TPM2YIL138C 486 nt2.75□□□□□ -1.97
LRE1P25579 RPS21BYJL136C 264 nt2.75□□□□□ -1.97
LRE1P25579 TEN1YLR010C 483 nt2.75□□□□□ -1.97
LRE1P25579 URA10YMR271C 684 nt2.75□□□□□ -1.97
LRE1P25579 TAO3YIL129C 7131 nt2.75□□□□□ -1.97
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