Protein–RNA interactions for Protein: P07196

NEFL, Neurofilament light polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEFLP07196 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
NEFLP07196 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
NEFLP07196 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
NEFLP07196 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
NEFLP07196 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
NEFLP07196 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
NEFLP07196 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
NEFLP07196 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
NEFLP07196 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
NEFLP07196 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
NEFLP07196 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
NEFLP07196 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
NEFLP07196 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
NEFLP07196 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
NEFLP07196 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
NEFLP07196 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
NEFLP07196 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
NEFLP07196 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
NEFLP07196 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
NEFLP07196 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
NEFLP07196 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
NEFLP07196 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
NEFLP07196 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
NEFLP07196 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NEFLP07196 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NEFLP07196 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NEFLP07196 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
NEFLP07196 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NEFLP07196 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NEFLP07196 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
NEFLP07196 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
NEFLP07196 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NEFLP07196 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
NEFLP07196 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NEFLP07196 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NEFLP07196 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NEFLP07196 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
NEFLP07196 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NEFLP07196 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NEFLP07196 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
NEFLP07196 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
NEFLP07196 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
NEFLP07196 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
NEFLP07196 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
NEFLP07196 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
NEFLP07196 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
NEFLP07196 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
NEFLP07196 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
NEFLP07196 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
NEFLP07196 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
NEFLP07196 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
NEFLP07196 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
NEFLP07196 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
NEFLP07196 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NEFLP07196 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NEFLP07196 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
NEFLP07196 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
NEFLP07196 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NEFLP07196 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
NEFLP07196 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
NEFLP07196 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
NEFLP07196 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
NEFLP07196 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
NEFLP07196 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
NEFLP07196 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NEFLP07196 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NEFLP07196 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NEFLP07196 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
NEFLP07196 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
NEFLP07196 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
NEFLP07196 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
NEFLP07196 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
NEFLP07196 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
NEFLP07196 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
NEFLP07196 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
NEFLP07196 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
NEFLP07196 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
NEFLP07196 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
NEFLP07196 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
NEFLP07196 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
NEFLP07196 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
NEFLP07196 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
NEFLP07196 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
NEFLP07196 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
NEFLP07196 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NEFLP07196 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
NEFLP07196 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NEFLP07196 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NEFLP07196 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NEFLP07196 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NEFLP07196 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NEFLP07196 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NEFLP07196 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NEFLP07196 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
NEFLP07196 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NEFLP07196 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
NEFLP07196 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NEFLP07196 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
NEFLP07196 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
NEFLP07196 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms