Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVX2

TMEM106C, Transmembrane protein 106C, humanhuman

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM106CQ9BVX2 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TMEM106CQ9BVX2 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TMEM106CQ9BVX2 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TMEM106CQ9BVX2 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TMEM106CQ9BVX2 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TMEM106CQ9BVX2 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TMEM106CQ9BVX2 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TMEM106CQ9BVX2 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
TMEM106CQ9BVX2 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
TMEM106CQ9BVX2 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TMEM106CQ9BVX2 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TMEM106CQ9BVX2 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TMEM106CQ9BVX2 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
TMEM106CQ9BVX2 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TMEM106CQ9BVX2 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TMEM106CQ9BVX2 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TMEM106CQ9BVX2 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TMEM106CQ9BVX2 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TMEM106CQ9BVX2 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TMEM106CQ9BVX2 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TMEM106CQ9BVX2 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TMEM106CQ9BVX2 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TMEM106CQ9BVX2 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TMEM106CQ9BVX2 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
TMEM106CQ9BVX2 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TMEM106CQ9BVX2 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
TMEM106CQ9BVX2 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TMEM106CQ9BVX2 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TMEM106CQ9BVX2 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TMEM106CQ9BVX2 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TMEM106CQ9BVX2 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TMEM106CQ9BVX2 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TMEM106CQ9BVX2 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
TMEM106CQ9BVX2 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TMEM106CQ9BVX2 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TMEM106CQ9BVX2 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TMEM106CQ9BVX2 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TMEM106CQ9BVX2 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TMEM106CQ9BVX2 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TMEM106CQ9BVX2 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TMEM106CQ9BVX2 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TMEM106CQ9BVX2 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TMEM106CQ9BVX2 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TMEM106CQ9BVX2 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TMEM106CQ9BVX2 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TMEM106CQ9BVX2 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TMEM106CQ9BVX2 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TMEM106CQ9BVX2 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TMEM106CQ9BVX2 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TMEM106CQ9BVX2 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TMEM106CQ9BVX2 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TMEM106CQ9BVX2 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TMEM106CQ9BVX2 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TMEM106CQ9BVX2 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TMEM106CQ9BVX2 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TMEM106CQ9BVX2 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TMEM106CQ9BVX2 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TMEM106CQ9BVX2 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TMEM106CQ9BVX2 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TMEM106CQ9BVX2 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TMEM106CQ9BVX2 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TMEM106CQ9BVX2 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TMEM106CQ9BVX2 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TMEM106CQ9BVX2 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TMEM106CQ9BVX2 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TMEM106CQ9BVX2 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TMEM106CQ9BVX2 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TMEM106CQ9BVX2 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TMEM106CQ9BVX2 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
TMEM106CQ9BVX2 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TMEM106CQ9BVX2 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TMEM106CQ9BVX2 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TMEM106CQ9BVX2 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TMEM106CQ9BVX2 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TMEM106CQ9BVX2 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TMEM106CQ9BVX2 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TMEM106CQ9BVX2 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
TMEM106CQ9BVX2 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
TMEM106CQ9BVX2 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TMEM106CQ9BVX2 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
TMEM106CQ9BVX2 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TMEM106CQ9BVX2 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
TMEM106CQ9BVX2 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TMEM106CQ9BVX2 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TMEM106CQ9BVX2 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TMEM106CQ9BVX2 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TMEM106CQ9BVX2 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TMEM106CQ9BVX2 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TMEM106CQ9BVX2 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
TMEM106CQ9BVX2 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TMEM106CQ9BVX2 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TMEM106CQ9BVX2 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TMEM106CQ9BVX2 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
TMEM106CQ9BVX2 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TMEM106CQ9BVX2 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TMEM106CQ9BVX2 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TMEM106CQ9BVX2 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TMEM106CQ9BVX2 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TMEM106CQ9BVX2 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TMEM106CQ9BVX2 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms