Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q5P6

TY4A-H, Transposon Ty4-H Gag polyprotein, yeast

Predictions only

Length 413 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
TY4A-H	Q6Q5P6	PFY1	YOR122C	381 nt		4.06	□□□□□ -1.76
TY4A-H	Q6Q5P6	YBR178W	YBR178W	375 nt		4.06	□□□□□ -1.76
TY4A-H	Q6Q5P6	HEF3	YNL014W	3135 nt		4.06	□□□□□ -1.76
TY4A-H	Q6Q5P6	TRS65	YGR166W	1683 nt		4.06	□□□□□ -1.76
TY4A-H	Q6Q5P6	YLR001C	YLR001C	2589 nt		4.06	□□□□□ -1.76
TY4A-H	Q6Q5P6	TOP1	YOL006C	2310 nt		4.05	□□□□□ -1.76
TY4A-H	Q6Q5P6	FOX2	YKR009C	2703 nt		4.05	□□□□□ -1.76
TY4A-H	Q6Q5P6	FMP46	YKR049C	402 nt		4.05	□□□□□ -1.76
TY4A-H	Q6Q5P6	TMA10	YLR327C	261 nt		4.05	□□□□□ -1.76
TY4A-H	Q6Q5P6	YOL155W-A	YOL155W-A	135 nt		4.05	□□□□□ -1.76
TY4A-H	Q6Q5P6	NTC20	YBR188C	423 nt		4.05	□□□□□ -1.76
TY4A-H	Q6Q5P6	YGL140C	YGL140C	3660 nt		4.05	□□□□□ -1.76
TY4A-H	Q6Q5P6	TIF4631	YGR162W	2859 nt		4.04	□□□□□ -1.76
TY4A-H	Q6Q5P6	YKL100C	YKL100C	1764 nt		4.04	□□□□□ -1.76
TY4A-H	Q6Q5P6	RSF2	YJR127C	4143 nt		4.04	□□□□□ -1.76
TY4A-H	Q6Q5P6	YHR214C-E	YHR214C-E	300 nt		4.04	□□□□□ -1.76
TY4A-H	Q6Q5P6	LDS2	YOL047C	1071 nt		4.04	□□□□□ -1.76
TY4A-H	Q6Q5P6	FRT2	YAL028W	1587 nt		4.04	□□□□□ -1.76
TY4A-H	Q6Q5P6	GCR1	YPL075W	2358 nt		4.04	□□□□□ -1.76
TY4A-H	Q6Q5P6	HCS1	YKL017C	2052 nt		4.04	□□□□□ -1.76
TY4A-H	Q6Q5P6	TDA1	YMR291W	1761 nt		4.04	□□□□□ -1.76
TY4A-H	Q6Q5P6	KRI1	YNL308C	1776 nt		4.04	□□□□□ -1.76
TY4A-H	Q6Q5P6	SET1	YHR119W	3243 nt		4.04	□□□□□ -1.76
TY4A-H	Q6Q5P6	PIN4	YBL051C	2007 nt		4.04	□□□□□ -1.76
TY4A-H	Q6Q5P6	BEM4	YPL161C	1902 nt		4.03	□□□□□ -1.76
TY4A-H	Q6Q5P6	CPA2	YJR109C	3357 nt		4.03	□□□□□ -1.76
TY4A-H	Q6Q5P6	SPC19	YDR201W	498 nt		4.03	□□□□□ -1.76
TY4A-H	Q6Q5P6	RPS21B	YJL136C	264 nt		4.03	□□□□□ -1.76
TY4A-H	Q6Q5P6	PSY1	YKL076C	384 nt		4.03	□□□□□ -1.76
TY4A-H	Q6Q5P6	MRP8	YKL142W	660 nt		4.03	□□□□□ -1.76
TY4A-H	Q6Q5P6	YOL085W-A	YOL085W-A	213 nt		4.03	□□□□□ -1.76
TY4A-H	Q6Q5P6	YPL080C	YPL080C	327 nt		4.03	□□□□□ -1.76
TY4A-H	Q6Q5P6	RKM1	YPL208W	1752 nt		4.03	□□□□□ -1.76
TY4A-H	Q6Q5P6	MIP6	YHR015W	1980 nt		4.03	□□□□□ -1.76
TY4A-H	Q6Q5P6	KIN82	YCR091W	2163 nt		4.03	□□□□□ -1.76
TY4A-H	Q6Q5P6	LCB4	YOR171C	1875 nt		4.03	□□□□□ -1.77
TY4A-H	Q6Q5P6	KIN2	YLR096W	3444 nt		4.02	□□□□□ -1.77
TY4A-H	Q6Q5P6	EMP70	YLR083C	2004 nt		4.02	□□□□□ -1.77
TY4A-H	Q6Q5P6	FRE4	YNR060W	2160 nt		4.02	□□□□□ -1.77
TY4A-H	Q6Q5P6	RPS29B	YDL061C	171 nt		4.02	□□□□□ -1.77
TY4A-H	Q6Q5P6	YFH1	YDL120W	525 nt		4.02	□□□□□ -1.77
TY4A-H	Q6Q5P6	YEL075C	YEL075C	369 nt		4.02	□□□□□ -1.77
TY4A-H	Q6Q5P6	TAR1	YLR154W-C	375 nt		4.02	□□□□□ -1.77
TY4A-H	Q6Q5P6	SNX41	YDR425W	1878 nt		4.02	□□□□□ -1.77
TY4A-H	Q6Q5P6	ECM16	YMR128W	3804 nt		4.02	□□□□□ -1.77
TY4A-H	Q6Q5P6	YKL222C	YKL222C	2118 nt		4.01	□□□□□ -1.77
TY4A-H	Q6Q5P6	XRS2	YDR369C	2565 nt		4.01	□□□□□ -1.77
TY4A-H	Q6Q5P6	FRQ1	YDR373W	573 nt		4.01	□□□□□ -1.77
TY4A-H	Q6Q5P6	YEL018C-A	YEL018C-A	534 nt		4.01	□□□□□ -1.77
TY4A-H	Q6Q5P6	YEL020C-B	YEL020C-B	198 nt		4.01	□□□□□ -1.77
TY4A-H	Q6Q5P6	CDC26	YFR036W	375 nt		4.01	□□□□□ -1.77
TY4A-H	Q6Q5P6	BAT1	YHR208W	1182 nt		4.01	□□□□□ -1.77
TY4A-H	Q6Q5P6	URM1	YIL008W	300 nt		4.01	□□□□□ -1.77
TY4A-H	Q6Q5P6	PAU14	YIL176C	363 nt		4.01	□□□□□ -1.77
TY4A-H	Q6Q5P6	PAU1	YJL223C	363 nt		4.01	□□□□□ -1.77
TY4A-H	Q6Q5P6	MSH4	YFL003C	2637 nt		4.01	□□□□□ -1.77
TY4A-H	Q6Q5P6	YJL016W	YJL016W	1686 nt		4	□□□□□ -1.77
TY4A-H	Q6Q5P6	GSC2	YGR032W	5688 nt		4	□□□□□ -1.77
TY4A-H	Q6Q5P6	YBR259W	YBR259W	2067 nt		4	□□□□□ -1.77
TY4A-H	Q6Q5P6	YAR070C	YAR070C	300 nt		4	□□□□□ -1.77
TY4A-H	Q6Q5P6	snR48	snR48	113 nt		4	□□□□□ -1.77
TY4A-H	Q6Q5P6	PCF11	YDR228C	1881 nt		4	□□□□□ -1.77
TY4A-H	Q6Q5P6	EBS1	YDR206W	2655 nt		3.99	□□□□□ -1.77
TY4A-H	Q6Q5P6	ATP22	YDR350C	2055 nt		3.99	□□□□□ -1.77
TY4A-H	Q6Q5P6	TMA17	YDL110C	453 nt		3.99	□□□□□ -1.77
TY4A-H	Q6Q5P6	YDL185C-A	YDL185C-A	228 nt		3.99	□□□□□ -1.77
TY4A-H	Q6Q5P6	LSM2	YBL026W	288 nt		3.99	□□□□□ -1.77
TY4A-H	Q6Q5P6	YDR089W	YDR089W	2610 nt		3.99	□□□□□ -1.77
TY4A-H	Q6Q5P6	CCM1	YGR150C	2595 nt		3.99	□□□□□ -1.77
TY4A-H	Q6Q5P6	PBS2	YJL128C	2007 nt		3.99	□□□□□ -1.77
TY4A-H	Q6Q5P6	RPN2	YIL075C	2838 nt		3.98	□□□□□ -1.77
TY4A-H	Q6Q5P6	HTA1	YDR225W	399 nt		3.98	□□□□□ -1.77
TY4A-H	Q6Q5P6	YER091C-A	YER091C-A	222 nt		3.98	□□□□□ -1.77
TY4A-H	Q6Q5P6	BCD1	YHR040W	1101 nt		3.98	□□□□□ -1.77
TY4A-H	Q6Q5P6	RPC10	YHR143W-A	213 nt		3.98	□□□□□ -1.77
TY4A-H	Q6Q5P6	YKL111C	YKL111C	336 nt		3.98	□□□□□ -1.77
TY4A-H	Q6Q5P6	YAL059C-A	YAL059C-A	423 nt		3.98	□□□□□ -1.77
TY4A-H	Q6Q5P6	YLR342W-A	YLR342W-A	174 nt		3.98	□□□□□ -1.77
TY4A-H	Q6Q5P6	AIP1	YMR092C	1848 nt		3.98	□□□□□ -1.77
TY4A-H	Q6Q5P6	OSW7	YFR039C	1533 nt		3.97	□□□□□ -1.77
TY4A-H	Q6Q5P6	FUS1	YCL027W	1539 nt		3.97	□□□□□ -1.77
TY4A-H	Q6Q5P6	KAP95	YLR347C	2586 nt		3.97	□□□□□ -1.77
TY4A-H	Q6Q5P6	YDL062W	YDL062W	426 nt		3.97	□□□□□ -1.77
TY4A-H	Q6Q5P6	ADK1	YDR226W	669 nt		3.97	□□□□□ -1.77
TY4A-H	Q6Q5P6	YDR246W-A	YDR246W-A	201 nt		3.97	□□□□□ -1.77
TY4A-H	Q6Q5P6	RPS26B	YER131W	360 nt		3.97	□□□□□ -1.77
TY4A-H	Q6Q5P6	YER188C-A	YER188C-A	300 nt		3.97	□□□□□ -1.77
TY4A-H	Q6Q5P6	ALG13	YGL047W	609 nt		3.97	□□□□□ -1.77
TY4A-H	Q6Q5P6	YGL074C	YGL074C	327 nt		3.97	□□□□□ -1.77
TY4A-H	Q6Q5P6	tL(UAG)J	tL(UAG)J	82 nt		3.97	□□□□□ -1.77
TY4A-H	Q6Q5P6	tL(UAG)L1	tL(UAG)L1	82 nt		3.97	□□□□□ -1.77
TY4A-H	Q6Q5P6	tL(UAG)L2	tL(UAG)L2	82 nt		3.97	□□□□□ -1.77
TY4A-H	Q6Q5P6	RPL37A	YLR185W	267 nt		3.97	□□□□□ -1.77
TY4A-H	Q6Q5P6	COA4	YLR218C	453 nt		3.97	□□□□□ -1.77
TY4A-H	Q6Q5P6	LTP1	YPR073C	486 nt		3.97	□□□□□ -1.77
TY4A-H	Q6Q5P6	VPS52	YDR484W	1926 nt		3.97	□□□□□ -1.77
TY4A-H	Q6Q5P6	SPA2	YLL021W	4401 nt		3.96	□□□□□ -1.78
TY4A-H	Q6Q5P6	HTL1	YCR020W-B	237 nt		3.96	□□□□□ -1.78
TY4A-H	Q6Q5P6	RPL29	YFR032C-A	180 nt		3.96	□□□□□ -1.78
TY4A-H	Q6Q5P6	RPL26A	YLR344W	384 nt		3.96	□□□□□ -1.78

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