Protein–RNA interactions for Protein: Q12153

SSF2, Ribosome biogenesis protein SSF2, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SSF2Q12153 YLR159C-AYLR159C-A 132 nt3.74□□□□□ -1.81
SSF2Q12153 TOM70YNL121C 1854 nt3.74□□□□□ -1.81
SSF2Q12153 YOL019W-AYOL019W-A 153 nt3.74□□□□□ -1.81
SSF2Q12153 PDC2YDR081C 2778 nt3.74□□□□□ -1.81
SSF2Q12153 POM152YMR129W 4014 nt3.73□□□□□ -1.81
SSF2Q12153 BCH1YMR237W 2175 nt3.73□□□□□ -1.81
SSF2Q12153 ENA5YDR038C 3276 nt3.73□□□□□ -1.81
SSF2Q12153 ENA2YDR039C 3276 nt3.73□□□□□ -1.81
SSF2Q12153 ENA1YDR040C 3276 nt3.73□□□□□ -1.81
SSF2Q12153 NPR1YNL183C 2373 nt3.73□□□□□ -1.81
SSF2Q12153 YDR193WYDR193W 399 nt3.73□□□□□ -1.81
SSF2Q12153 ERG28YER044C 447 nt3.73□□□□□ -1.81
SSF2Q12153 CRG1YHR209W 876 nt3.73□□□□□ -1.81
SSF2Q12153 TEN1YLR010C 483 nt3.73□□□□□ -1.81
SSF2Q12153 RPS28BYLR264W 204 nt3.73□□□□□ -1.81
SSF2Q12153 CDC33YOL139C 642 nt3.73□□□□□ -1.81
SSF2Q12153 RPL20BYOR312C 519 nt3.73□□□□□ -1.81
SSF2Q12153 NSL1YPL233W 651 nt3.73□□□□□ -1.81
SSF2Q12153 GPX2YBR244W 489 nt3.73□□□□□ -1.81
SSF2Q12153 MET10YFR030W 3108 nt3.73□□□□□ -1.81
SSF2Q12153 XRS2YDR369C 2565 nt3.73□□□□□ -1.81
SSF2Q12153 STE23YLR389C 3084 nt3.73□□□□□ -1.81
SSF2Q12153 DPB11YJL090C 2295 nt3.73□□□□□ -1.81
SSF2Q12153 MDM32YOR147W 1869 nt3.73□□□□□ -1.81
SSF2Q12153 SNT1YCR033W 3681 nt3.72□□□□□ -1.81
SSF2Q12153 MRH1YDR033W 963 nt3.72□□□□□ -1.81
SSF2Q12153 GPI19YDR437W 423 nt3.72□□□□□ -1.81
SSF2Q12153 YAL026C-AYAL026C-A 438 nt3.72□□□□□ -1.81
SSF2Q12153 SIP18YMR175W 240 nt3.72□□□□□ -1.81
SSF2Q12153 NUP159YIL115C 4383 nt3.72□□□□□ -1.81
SSF2Q12153 PES4YFR023W 1836 nt3.72□□□□□ -1.81
SSF2Q12153 MTR4YJL050W 3222 nt3.72□□□□□ -1.81
SSF2Q12153 YLR352WYLR352W 2424 nt3.71□□□□□ -1.82
SSF2Q12153 YHL006W-AYHL006W-A 354 nt3.71□□□□□ -1.82
SSF2Q12153 YJR023CYJR023C 402 nt3.71□□□□□ -1.82
SSF2Q12153 YJR079WYJR079W 330 nt3.71□□□□□ -1.82
SSF2Q12153 SSN8YNL025C 972 nt3.71□□□□□ -1.82
SSF2Q12153 PEX17YNL214W 600 nt3.71□□□□□ -1.82
SSF2Q12153 SLM6YBR266C 453 nt3.71□□□□□ -1.82
SSF2Q12153 FAR1YJL157C 2493 nt3.7□□□□□ -1.82
SSF2Q12153 BOI1YBL085W 2943 nt3.7□□□□□ -1.82
SSF2Q12153 YER068C-AYER068C-A 432 nt3.7□□□□□ -1.82
SSF2Q12153 YHR214W-AYHR214W-A 486 nt3.7□□□□□ -1.82
SSF2Q12153 HIT1YJR055W 495 nt3.7□□□□□ -1.82
SSF2Q12153 YJR140W-AYJR140W-A 150 nt3.7□□□□□ -1.82
SSF2Q12153 YAR068WYAR068W 486 nt3.7□□□□□ -1.82
SSF2Q12153 GIS2YNL255C 462 nt3.7□□□□□ -1.82
SSF2Q12153 ERP4YOR016C 624 nt3.7□□□□□ -1.82
SSF2Q12153 YHR080CYHR080C 4038 nt3.7□□□□□ -1.82
SSF2Q12153 AI2Q0055 2565 nt3.7□□□□□ -1.82
SSF2Q12153 NTO1YPR031W 2247 nt3.69□□□□□ -1.82
SSF2Q12153 RRF1YHR038W 693 nt3.69□□□□□ -1.82
SSF2Q12153 YJR011CYJR011C 786 nt3.69□□□□□ -1.82
SSF2Q12153 BSC3YLR465C 309 nt3.69□□□□□ -1.82
SSF2Q12153 ZEO1YOL109W 342 nt3.69□□□□□ -1.82
SSF2Q12153 YPR014CYPR014C 330 nt3.69□□□□□ -1.82
SSF2Q12153 CDH1YGL003C 1701 nt3.69□□□□□ -1.82
SSF2Q12153 LEU3YLR451W 2661 nt3.68□□□□□ -1.82
SSF2Q12153 ROY1YMR258C 1662 nt3.68□□□□□ -1.82
SSF2Q12153 PSK1YAL017W 4071 nt3.68□□□□□ -1.82
SSF2Q12153 CHO2YGR157W 2610 nt3.68□□□□□ -1.82
SSF2Q12153 RRP5YMR229C 5190 nt3.68□□□□□ -1.82
SSF2Q12153 YIL030W-AYIL030W-A 339 nt3.68□□□□□ -1.82
SSF2Q12153 YNL043CYNL043C 321 nt3.68□□□□□ -1.82
SSF2Q12153 snR13snR13 124 nt3.68□□□□□ -1.82
SSF2Q12153 YPL185WYPL185W 396 nt3.68□□□□□ -1.82
SSF2Q12153 snR42snR42 351 nt3.68□□□□□ -1.82
SSF2Q12153 NDT80YHR124W 1884 nt3.68□□□□□ -1.82
SSF2Q12153 SEN54YPL083C 1404 nt3.68□□□□□ -1.82
SSF2Q12153 COG3YER157W 2406 nt3.68□□□□□ -1.82
SSF2Q12153 MED1YPR070W 1701 nt3.67□□□□□ -1.82
SSF2Q12153 NIC96YFR002W 2520 nt3.67□□□□□ -1.82
SSF2Q12153 RPS21BYJL136C 264 nt3.67□□□□□ -1.82
SSF2Q12153 PEP12YOR036W 867 nt3.67□□□□□ -1.82
SSF2Q12153 YPR197CYPR197C 564 nt3.67□□□□□ -1.82
SSF2Q12153 PFK26YIL107C 2484 nt3.67□□□□□ -1.82
SSF2Q12153 POL3YDL102W 3294 nt3.66□□□□□ -1.82
SSF2Q12153 CHA4YLR098C 1947 nt3.66□□□□□ -1.82
SSF2Q12153 YOR296WYOR296W 3870 nt3.66□□□□□ -1.82
SSF2Q12153 FUS1YCL027W 1539 nt3.66□□□□□ -1.82
SSF2Q12153 YIR040CYIR040C 333 nt3.66□□□□□ -1.82
SSF2Q12153 YKL111CYKL111C 336 nt3.66□□□□□ -1.82
SSF2Q12153 RPS21AYKR057W 264 nt3.66□□□□□ -1.82
SSF2Q12153 MAK21YDR060W 3078 nt3.65□□□□□ -1.82
SSF2Q12153 STE6YKL209C 3873 nt3.65□□□□□ -1.82
SSF2Q12153 ATP17YDR377W 306 nt3.65□□□□□ -1.83
SSF2Q12153 SDH7YDR511W 402 nt3.65□□□□□ -1.83
SSF2Q12153 YMR31YFR049W 372 nt3.65□□□□□ -1.83
SSF2Q12153 RPL30YGL030W 318 nt3.65□□□□□ -1.83
SSF2Q12153 NOP19YGR251W 591 nt3.65□□□□□ -1.83
SSF2Q12153 JIP3YLR331C 378 nt3.65□□□□□ -1.83
SSF2Q12153 YML003WYML003W 873 nt3.65□□□□□ -1.83
SSF2Q12153 URA10YMR271C 684 nt3.65□□□□□ -1.83
SSF2Q12153 YMR294W-AYMR294W-A 360 nt3.65□□□□□ -1.83
SSF2Q12153 YOR385WYOR385W 873 nt3.65□□□□□ -1.83
SSF2Q12153 DUF1YOL087C 3351 nt3.65□□□□□ -1.83
SSF2Q12153 SPB1YCL054W 2526 nt3.65□□□□□ -1.83
SSF2Q12153 YGR025WYGR025W 303 nt3.64□□□□□ -1.83
SSF2Q12153 SOK1YDR006C 2706 nt3.64□□□□□ -1.83
SSF2Q12153 YAT2YER024W 2772 nt3.63□□□□□ -1.83
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 38.9 ms