Protein–RNA interactions for Protein: Q07657

SHS1, Seventh homolog of septin 1, yeastyeast

Predictions only

Length 551 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SHS1Q07657 AMS1YGL156W 3252 nt2.34□□□□□ -2.03
SHS1Q07657 UTP22YGR090W 3714 nt2.33□□□□□ -2.04
SHS1Q07657 YEF3YLR249W 3135 nt2.33□□□□□ -2.04
SHS1Q07657 ORC2YBR060C 1863 nt2.33□□□□□ -2.04
SHS1Q07657 YDR115WYDR115W 318 nt2.33□□□□□ -2.04
SHS1Q07657 GPI19YDR437W 423 nt2.33□□□□□ -2.04
SHS1Q07657 MPO1YGL010W 525 nt2.33□□□□□ -2.04
SHS1Q07657 RPS29AYLR388W 171 nt2.33□□□□□ -2.04
SHS1Q07657 YNR034W-AYNR034W-A 297 nt2.33□□□□□ -2.04
SHS1Q07657 YOR152CYOR152C 771 nt2.33□□□□□ -2.04
SHS1Q07657 ALG14YBR070C 714 nt2.33□□□□□ -2.04
SHS1Q07657 COG3YER157W 2406 nt2.33□□□□□ -2.04
SHS1Q07657 RGA2YDR379W 3030 nt2.33□□□□□ -2.04
SHS1Q07657 NEL1YHR035W 1893 nt2.33□□□□□ -2.04
SHS1Q07657 REF2YDR195W 1602 nt2.32□□□□□ -2.04
SHS1Q07657 DAL5YJR152W 1632 nt2.32□□□□□ -2.04
SHS1Q07657 HYP2YEL034W 474 nt2.32□□□□□ -2.04
SHS1Q07657 TDA2YER071C 381 nt2.32□□□□□ -2.04
SHS1Q07657 FAR7YFR008W 666 nt2.32□□□□□ -2.04
SHS1Q07657 YGR242WYGR242W 309 nt2.32□□□□□ -2.04
SHS1Q07657 GIM3YNL153C 390 nt2.32□□□□□ -2.04
SHS1Q07657 ESF2YNR054C 951 nt2.32□□□□□ -2.04
SHS1Q07657 YOL134CYOL134C 390 nt2.32□□□□□ -2.04
SHS1Q07657 YOR169CYOR169C 465 nt2.32□□□□□ -2.04
SHS1Q07657 SRL4YPL033C 846 nt2.32□□□□□ -2.04
SHS1Q07657 YCL007CYCL007C 393 nt2.32□□□□□ -2.04
SHS1Q07657 YKL075CYKL075C 1353 nt2.32□□□□□ -2.04
SHS1Q07657 KAR9YPL269W 1935 nt2.32□□□□□ -2.04
SHS1Q07657 KRE33YNL132W 3171 nt2.32□□□□□ -2.04
SHS1Q07657 ALK2YBL009W 2031 nt2.32□□□□□ -2.04
SHS1Q07657 PUF4YGL014W 2667 nt2.32□□□□□ -2.04
SHS1Q07657 UBP16YPL072W 1500 nt2.32□□□□□ -2.04
SHS1Q07657 YKR078WYKR078W 1758 nt2.31□□□□□ -2.04
SHS1Q07657 RLF2YPR018W 1821 nt2.31□□□□□ -2.04
SHS1Q07657 snR59snR59 78 nt2.31□□□□□ -2.04
SHS1Q07657 RPS26BYER131W 360 nt2.31□□□□□ -2.04
SHS1Q07657 SNO3YFL060C 669 nt2.31□□□□□ -2.04
SHS1Q07657 BRP1YGL007W 378 nt2.31□□□□□ -2.04
SHS1Q07657 FYV4YHR059W 393 nt2.31□□□□□ -2.04
SHS1Q07657 AIM18YHR198C 966 nt2.31□□□□□ -2.04
SHS1Q07657 SNO2YNL334C 669 nt2.31□□□□□ -2.04
SHS1Q07657 YDR179W-AYDR179W-A 1392 nt2.31□□□□□ -2.04
SHS1Q07657 MLH1YMR167W 2310 nt2.31□□□□□ -2.04
SHS1Q07657 PSD2YGR170W 3417 nt2.31□□□□□ -2.04
SHS1Q07657 SIP3YNL257C 3690 nt2.31□□□□□ -2.04
SHS1Q07657 snR5snR5 204 nt2.3□□□□□ -2.04
SHS1Q07657 PRP38YGR075C 729 nt2.3□□□□□ -2.04
SHS1Q07657 YJL119CYJL119C 324 nt2.3□□□□□ -2.04
SHS1Q07657 ACF4YJR083C 930 nt2.3□□□□□ -2.04
SHS1Q07657 SRP21YKL122C 504 nt2.3□□□□□ -2.04
SHS1Q07657 ECM9YKR004C 1134 nt2.3□□□□□ -2.04
SHS1Q07657 RGM1YMR182C 636 nt2.3□□□□□ -2.04
SHS1Q07657 YRR1YOR162C 2433 nt2.3□□□□□ -2.04
SHS1Q07657 DNF1YER166W 4716 nt2.29□□□□□ -2.04
SHS1Q07657 PUT3YKL015W 2940 nt2.29□□□□□ -2.04
SHS1Q07657 UBP1YDL122W 2430 nt2.29□□□□□ -2.04
SHS1Q07657 YDR042CYDR042C 603 nt2.29□□□□□ -2.04
SHS1Q07657 ADK1YDR226W 669 nt2.29□□□□□ -2.04
SHS1Q07657 YHL006W-AYHL006W-A 354 nt2.29□□□□□ -2.04
SHS1Q07657 AIM19YIL087C 474 nt2.29□□□□□ -2.04
SHS1Q07657 VPH2YKL119C 648 nt2.29□□□□□ -2.04
SHS1Q07657 YLR224WYLR224W 1110 nt2.29□□□□□ -2.04
SHS1Q07657 YAP7YOL028C 738 nt2.29□□□□□ -2.04
SHS1Q07657 YOL029CYOL029C 606 nt2.29□□□□□ -2.04
SHS1Q07657 PEP12YOR036W 867 nt2.29□□□□□ -2.04
SHS1Q07657 ARL3YPL051W 597 nt2.29□□□□□ -2.04
SHS1Q07657 HRD3YLR207W 2502 nt2.29□□□□□ -2.04
SHS1Q07657 SHE4YOR035C 2370 nt2.29□□□□□ -2.04
SHS1Q07657 MES1YGR264C 2256 nt2.29□□□□□ -2.04
SHS1Q07657 snR76snR76 109 nt2.28□□□□□ -2.04
SHS1Q07657 TMA20YER007C-A 546 nt2.28□□□□□ -2.04
SHS1Q07657 EMP24YGL200C 612 nt2.28□□□□□ -2.04
SHS1Q07657 PEX4YGR133W 552 nt2.28□□□□□ -2.04
SHS1Q07657 YJL202CYJL202C 348 nt2.28□□□□□ -2.04
SHS1Q07657 PRP21YJL203W 843 nt2.28□□□□□ -2.04
SHS1Q07657 RPS22BYLR367W 393 nt2.28□□□□□ -2.04
SHS1Q07657 PDP3YLR455W 915 nt2.28□□□□□ -2.04
SHS1Q07657 VID24YBR105C 1089 nt2.28□□□□□ -2.04
SHS1Q07657 MUD1YBR119W 897 nt2.28□□□□□ -2.04
SHS1Q07657 INP51YIL002C 2841 nt2.28□□□□□ -2.04
SHS1Q07657 SPF1YEL031W 3648 nt2.28□□□□□ -2.04
SHS1Q07657 NPR1YNL183C 2373 nt2.27□□□□□ -2.05
SHS1Q07657 TIF35YDR429C 825 nt2.27□□□□□ -2.05
SHS1Q07657 YDR461C-AYDR461C-A 243 nt2.27□□□□□ -2.05
SHS1Q07657 CAJ1YER048C 1176 nt2.27□□□□□ -2.05
SHS1Q07657 YHR054CYHR054C 1065 nt2.27□□□□□ -2.05
SHS1Q07657 YJL052C-AYJL052C-A 120 nt2.27□□□□□ -2.05
SHS1Q07657 PET191YJR034W 327 nt2.27□□□□□ -2.05
SHS1Q07657 YKL123WYKL123W 381 nt2.27□□□□□ -2.05
SHS1Q07657 YAL059C-AYAL059C-A 423 nt2.27□□□□□ -2.05
SHS1Q07657 YMR194C-AYMR194C-A 225 nt2.27□□□□□ -2.05
SHS1Q07657 YNR021WYNR021W 1215 nt2.27□□□□□ -2.05
SHS1Q07657 MPP6YNR024W 561 nt2.27□□□□□ -2.05
SHS1Q07657 TAZ1YPR140W 1146 nt2.27□□□□□ -2.05
SHS1Q07657 VPS13YLL040C 9435 nt2.27□□□□□ -2.05
SHS1Q07657 TPS2YDR074W 2691 nt2.26□□□□□ -2.05
SHS1Q07657 YNL018CYNL018C 1839 nt2.26□□□□□ -2.05
SHS1Q07657 YEL050W-AYEL050W-A 192 nt2.26□□□□□ -2.05
SHS1Q07657 YGR226CYGR226C 210 nt2.26□□□□□ -2.05
SHS1Q07657 YMR254CYMR254C 309 nt2.26□□□□□ -2.05
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