Protein–RNA interactions for Protein: Q07468

VAM6, Vacuolar morphogenesis protein 6, yeastyeast

Predictions only

Length 1,049 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
VAM6Q07468 YGR107WYGR107W 450 nt2.93□□□□□ -1.94
VAM6Q07468 TCD1YHR003C 1290 nt2.93□□□□□ -1.94
VAM6Q07468 BIG1YHR101C 1008 nt2.93□□□□□ -1.94
VAM6Q07468 RPL8BYLL045C 771 nt2.93□□□□□ -1.94
VAM6Q07468 YPR203WYPR203W 309 nt2.93□□□□□ -1.94
VAM6Q07468 YOR296WYOR296W 3870 nt2.92□□□□□ -1.94
VAM6Q07468 MRH1YDR033W 963 nt2.92□□□□□ -1.94
VAM6Q07468 BMH2YDR099W 822 nt2.92□□□□□ -1.94
VAM6Q07468 ECL1YGR146C 636 nt2.92□□□□□ -1.94
VAM6Q07468 BAT1YHR208W 1182 nt2.92□□□□□ -1.94
VAM6Q07468 YKL068W-AYKL068W-A 237 nt2.92□□□□□ -1.94
VAM6Q07468 YMR316C-AYMR316C-A 312 nt2.92□□□□□ -1.94
VAM6Q07468 YNR021WYNR021W 1215 nt2.92□□□□□ -1.94
VAM6Q07468 VAC8YEL013W 1737 nt2.92□□□□□ -1.94
VAM6Q07468 COG3YER157W 2406 nt2.92□□□□□ -1.94
VAM6Q07468 FUS1YCL027W 1539 nt2.92□□□□□ -1.94
VAM6Q07468 PDC2YDR081C 2778 nt2.92□□□□□ -1.94
VAM6Q07468 SEN54YPL083C 1404 nt2.92□□□□□ -1.94
VAM6Q07468 VAS1YGR094W 3315 nt2.91□□□□□ -1.94
VAM6Q07468 PPH3YDR075W 927 nt2.91□□□□□ -1.94
VAM6Q07468 TIF35YDR429C 825 nt2.91□□□□□ -1.94
VAM6Q07468 RPL29YFR032C-A 180 nt2.91□□□□□ -1.94
VAM6Q07468 YHL005CYHL005C 393 nt2.91□□□□□ -1.94
VAM6Q07468 SDH3YKL141W 597 nt2.91□□□□□ -1.94
VAM6Q07468 PEP12YOR036W 867 nt2.91□□□□□ -1.94
VAM6Q07468 YPL039WYPL039W 951 nt2.91□□□□□ -1.94
VAM6Q07468 LCL1YPL056C 306 nt2.91□□□□□ -1.94
VAM6Q07468 YPL080CYPL080C 327 nt2.91□□□□□ -1.94
VAM6Q07468 PRM3YPL192C 402 nt2.91□□□□□ -1.94
VAM6Q07468 POL3YDL102W 3294 nt2.9□□□□□ -1.94
VAM6Q07468 SPB1YCL054W 2526 nt2.9□□□□□ -1.94
VAM6Q07468 PAM1YDR251W 2493 nt2.9□□□□□ -1.95
VAM6Q07468 UTP13YLR222C 2454 nt2.9□□□□□ -1.95
VAM6Q07468 YDR209CYDR209C 414 nt2.9□□□□□ -1.95
VAM6Q07468 RMT2YDR465C 1239 nt2.9□□□□□ -1.95
VAM6Q07468 YMR31YFR049W 372 nt2.9□□□□□ -1.95
VAM6Q07468 YKL063CYKL063C 504 nt2.9□□□□□ -1.95
VAM6Q07468 YLR297WYLR297W 390 nt2.9□□□□□ -1.95
VAM6Q07468 PKR1YMR123W 369 nt2.9□□□□□ -1.95
VAM6Q07468 YNL046WYNL046W 519 nt2.9□□□□□ -1.95
VAM6Q07468 IRC16YPR038W 360 nt2.9□□□□□ -1.95
VAM6Q07468 YBR076C-AYBR076C-A 267 nt2.9□□□□□ -1.95
VAM6Q07468 YOL057WYOL057W 2136 nt2.9□□□□□ -1.95
VAM6Q07468 PMR1YGL167C 2853 nt2.9□□□□□ -1.95
VAM6Q07468 DYN1YKR054C 12279 nt2.9□□□□□ -1.95
VAM6Q07468 BTT1YDR252W 450 nt2.89□□□□□ -1.95
VAM6Q07468 SMB1YER029C 591 nt2.89□□□□□ -1.95
VAM6Q07468 RTS3YGR161C 792 nt2.89□□□□□ -1.95
VAM6Q07468 YIL054WYIL054W 318 nt2.89□□□□□ -1.95
VAM6Q07468 MUD2YKL074C 1584 nt2.89□□□□□ -1.95
VAM6Q07468 AIM29YKR074W 468 nt2.89□□□□□ -1.95
VAM6Q07468 YML108WYML108W 318 nt2.89□□□□□ -1.95
VAM6Q07468 CAT5YOR125C 702 nt2.89□□□□□ -1.95
VAM6Q07468 FYV12YOR183W 390 nt2.89□□□□□ -1.95
VAM6Q07468 PFF1YBR074W 2931 nt2.89□□□□□ -1.95
VAM6Q07468 TLC1TLC1 1301 nt2.89□□□□□ -1.95
VAM6Q07468 SEC7YDR170C 6030 nt2.89□□□□□ -1.95
VAM6Q07468 MOT1YPL082C 5604 nt2.89□□□□□ -1.95
VAM6Q07468 DSE4YNR067C 3354 nt2.88□□□□□ -1.95
VAM6Q07468 ROG1YGL144C 2058 nt2.88□□□□□ -1.95
VAM6Q07468 TRM2YKR056W 1920 nt2.88□□□□□ -1.95
VAM6Q07468 YLR012CYLR012C 300 nt2.88□□□□□ -1.95
VAM6Q07468 YMR153C-AYMR153C-A 336 nt2.88□□□□□ -1.95
VAM6Q07468 ISU1YPL135W 498 nt2.88□□□□□ -1.95
VAM6Q07468 NSL1YPL233W 651 nt2.88□□□□□ -1.95
VAM6Q07468 PSK1YAL017W 4071 nt2.88□□□□□ -1.95
VAM6Q07468 YKR078WYKR078W 1758 nt2.87□□□□□ -1.95
VAM6Q07468 RPA190YOR341W 4995 nt2.87□□□□□ -1.95
VAM6Q07468 APC2YLR127C 2562 nt2.87□□□□□ -1.95
VAM6Q07468 PPN1YDR452W 2025 nt2.87□□□□□ -1.95
VAM6Q07468 TIM11YDR322C-A 291 nt2.87□□□□□ -1.95
VAM6Q07468 RMP1YLR145W 606 nt2.87□□□□□ -1.95
VAM6Q07468 IGO1YNL157W 507 nt2.87□□□□□ -1.95
VAM6Q07468 ESF2YNR054C 951 nt2.87□□□□□ -1.95
VAM6Q07468 snR54snR54 86 nt2.87□□□□□ -1.95
VAM6Q07468 POM152YMR129W 4014 nt2.87□□□□□ -1.95
VAM6Q07468 YME2YMR302C 2553 nt2.87□□□□□ -1.95
VAM6Q07468 JIP5YPR169W 1479 nt2.86□□□□□ -1.95
VAM6Q07468 TSA2YDR453C 591 nt2.86□□□□□ -1.95
VAM6Q07468 YHL006W-AYHL006W-A 354 nt2.86□□□□□ -1.95
VAM6Q07468 COA4YLR218C 453 nt2.86□□□□□ -1.95
VAM6Q07468 RPL6AYML073C 531 nt2.86□□□□□ -1.95
VAM6Q07468 RLF2YPR018W 1821 nt2.86□□□□□ -1.95
VAM6Q07468 YIL169CYIL169C 2988 nt2.85□□□□□ -1.95
VAM6Q07468 RGR1YLR071C 3249 nt2.85□□□□□ -1.95
VAM6Q07468 LEU3YLR451W 2661 nt2.85□□□□□ -1.95
VAM6Q07468 YDR114CYDR114C 303 nt2.85□□□□□ -1.95
VAM6Q07468 RPS17BYDR447C 411 nt2.85□□□□□ -1.95
VAM6Q07468 YPS5YGL259W 498 nt2.85□□□□□ -1.95
VAM6Q07468 ERV1YGR029W 570 nt2.85□□□□□ -1.95
VAM6Q07468 SAS2YMR127C 1017 nt2.85□□□□□ -1.95
VAM6Q07468 ILS1YBL076C 3219 nt2.84□□□□□ -1.95
VAM6Q07468 snR56snR56 88 nt2.84□□□□□ -1.95
VAM6Q07468 IRC4YDR540C 540 nt2.84□□□□□ -1.95
VAM6Q07468 GET1YGL020C 708 nt2.84□□□□□ -1.95
VAM6Q07468 YIL030W-AYIL030W-A 339 nt2.84□□□□□ -1.95
VAM6Q07468 RPL37AYLR185W 267 nt2.84□□□□□ -1.95
VAM6Q07468 ITC1YGL133W 3795 nt2.84□□□□□ -1.96
VAM6Q07468 PSK2YOL045W 3306 nt2.83□□□□□ -1.96
VAM6Q07468 PSY2YNL201C 2577 nt2.83□□□□□ -1.96
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 46.8 ms