Protein–RNA interactions for Protein: P32340

NDI1, Rotenone-insensitive NADH-ubiquinone oxidoreductase, mitochondrial, yeastyeast

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
NDI1P32340 DAL5YJR152W 1632 nt2.64□□□□□ -1.99
NDI1P32340 UTP14YML093W 2700 nt2.64□□□□□ -1.99
NDI1P32340 SKT5YBL061C 2091 nt2.64□□□□□ -1.99
NDI1P32340 YCR001WYCR001W 315 nt2.64□□□□□ -1.99
NDI1P32340 YDR209CYDR209C 414 nt2.64□□□□□ -1.99
NDI1P32340 YGR242WYGR242W 309 nt2.64□□□□□ -1.99
NDI1P32340 YOL085W-AYOL085W-A 213 nt2.64□□□□□ -1.99
NDI1P32340 AYT1YLL063C 1425 nt2.64□□□□□ -1.99
NDI1P32340 SNU56YDR240C 1479 nt2.64□□□□□ -1.99
NDI1P32340 RRI2YOL117W 1938 nt2.64□□□□□ -1.99
NDI1P32340 PBS2YJL128C 2007 nt2.63□□□□□ -1.99
NDI1P32340 APC11YDL008W 498 nt2.63□□□□□ -1.99
NDI1P32340 YDR199WYDR199W 366 nt2.63□□□□□ -1.99
NDI1P32340 ERV1YGR029W 570 nt2.63□□□□□ -1.99
NDI1P32340 tW(CCA)G1tW(CCA)G1 72 nt2.63□□□□□ -1.99
NDI1P32340 tW(CCA)G2tW(CCA)G2 72 nt2.63□□□□□ -1.99
NDI1P32340 tW(CCA)JtW(CCA)J 72 nt2.63□□□□□ -1.99
NDI1P32340 tW(CCA)KtW(CCA)K 72 nt2.63□□□□□ -1.99
NDI1P32340 tW(CCA)MtW(CCA)M 72 nt2.63□□□□□ -1.99
NDI1P32340 tW(CCA)PtW(CCA)P 72 nt2.63□□□□□ -1.99
NDI1P32340 YKL066WYKL066W 444 nt2.63□□□□□ -1.99
NDI1P32340 YMR304C-AYMR304C-A 351 nt2.63□□□□□ -1.99
NDI1P32340 TOA1YOR194C 861 nt2.63□□□□□ -1.99
NDI1P32340 YPR014CYPR014C 330 nt2.63□□□□□ -1.99
NDI1P32340 YEL1YBL060W 2064 nt2.62□□□□□ -1.99
NDI1P32340 RGL1YPL066W 1440 nt2.62□□□□□ -1.99
NDI1P32340 YDL032WYDL032W 312 nt2.62□□□□□ -1.99
NDI1P32340 ERG28YER044C 447 nt2.62□□□□□ -1.99
NDI1P32340 TIM10YHR005C-A 282 nt2.62□□□□□ -1.99
NDI1P32340 YJR157WYJR157W 363 nt2.62□□□□□ -1.99
NDI1P32340 VPS51YKR020W 495 nt2.62□□□□□ -1.99
NDI1P32340 YMR013C-AYMR013C-A 150 nt2.62□□□□□ -1.99
NDI1P32340 RRT16YNL105W 429 nt2.62□□□□□ -1.99
NDI1P32340 YPR096CYPR096C 303 nt2.62□□□□□ -1.99
NDI1P32340 YPR177CYPR177C 372 nt2.62□□□□□ -1.99
NDI1P32340 VID24YBR105C 1089 nt2.62□□□□□ -1.99
NDI1P32340 FIR1YER032W 2631 nt2.62□□□□□ -1.99
NDI1P32340 VAC8YEL013W 1737 nt2.62□□□□□ -1.99
NDI1P32340 YDL009CYDL009C 324 nt2.61□□□□□ -1.99
NDI1P32340 YBT1YLL048C 4986 nt2.61□□□□□ -1.99
NDI1P32340 AHC2YCR082W 387 nt2.6□□□□□ -1.99
NDI1P32340 YFL019CYFL019C 354 nt2.6□□□□□ -1.99
NDI1P32340 AFB1YLR040C 675 nt2.6□□□□□ -1.99
NDI1P32340 YMR144WYMR144W 1029 nt2.6□□□□□ -1.99
NDI1P32340 MRPL33YMR286W 261 nt2.6□□□□□ -1.99
NDI1P32340 SPC29YPL124W 762 nt2.6□□□□□ -1.99
NDI1P32340 snR191snR191 274 nt2.6□□□□□ -1.99
NDI1P32340 HAA1YPR008W 2085 nt2.6□□□□□ -1.99
NDI1P32340 GIN4YDR507C 3429 nt2.6□□□□□ -1.99
NDI1P32340 ALY1YKR021W 2748 nt2.6□□□□□ -1.99
NDI1P32340 NFT1YKR103W 3657 nt2.6□□□□□ -1.99
NDI1P32340 SUL1YBR294W 2580 nt2.59□□□□□ -1.99
NDI1P32340 RTT10YPL183C 3042 nt2.59□□□□□ -1.99
NDI1P32340 ICR1ICR1 3199 nt2.59□□□□□ -1.99
NDI1P32340 snR70snR70 164 nt2.59□□□□□ -1.99
NDI1P32340 YGL042CYGL042C 306 nt2.59□□□□□ -1.99
NDI1P32340 HEM4YOR278W 828 nt2.59□□□□□ -1.99
NDI1P32340 LCL1YPL056C 306 nt2.59□□□□□ -1.99
NDI1P32340 YBR085C-AYBR085C-A 258 nt2.59□□□□□ -1.99
NDI1P32340 TRM2YKR056W 1920 nt2.59□□□□□ -1.99
NDI1P32340 KEL2YGR238C 2649 nt2.59□□□□□ -1.99
NDI1P32340 GDI1YER136W 1356 nt2.59□□□□□ -2
NDI1P32340 PFF1YBR074W 2931 nt2.58□□□□□ -2
NDI1P32340 RPL9AYGL147C 576 nt2.58□□□□□ -2
NDI1P32340 SPO13YHR014W 876 nt2.58□□□□□ -2
NDI1P32340 YKL044WYKL044W 321 nt2.58□□□□□ -2
NDI1P32340 ATX2YOR079C 942 nt2.58□□□□□ -2
NDI1P32340 SSF1YHR066W 1362 nt2.58□□□□□ -2
NDI1P32340 DNA2YHR164C 4569 nt2.58□□□□□ -2
NDI1P32340 SSN2YDR443C 4263 nt2.57□□□□□ -2
NDI1P32340 YGL015CYGL015C 393 nt2.57□□□□□ -2
NDI1P32340 DFG10YIL049W 762 nt2.57□□□□□ -2
NDI1P32340 YJL007CYJL007C 315 nt2.57□□□□□ -2
NDI1P32340 YAL037WYAL037W 804 nt2.57□□□□□ -2
NDI1P32340 SWR1YDR334W 4545 nt2.57□□□□□ -2
NDI1P32340 IKI3YLR384C 4050 nt2.57□□□□□ -2
NDI1P32340 PTP3YER075C 2787 nt2.57□□□□□ -2
NDI1P32340 APC2YLR127C 2562 nt2.56□□□□□ -2
NDI1P32340 GCV2YMR189W 3105 nt2.56□□□□□ -2
NDI1P32340 HNT1YDL125C 477 nt2.56□□□□□ -2
NDI1P32340 RPS26BYER131W 360 nt2.56□□□□□ -2
NDI1P32340 YHR032W-AYHR032W-A 180 nt2.56□□□□□ -2
NDI1P32340 RPL16AYIL133C 600 nt2.56□□□□□ -2
NDI1P32340 YKL202WYKL202W 582 nt2.56□□□□□ -2
NDI1P32340 RPS1AYLR441C 768 nt2.56□□□□□ -2
NDI1P32340 YNL179CYNL179C 438 nt2.56□□□□□ -2
NDI1P32340 RIO2YNL207W 1278 nt2.56□□□□□ -2
NDI1P32340 SVS1YPL163C 783 nt2.56□□□□□ -2
NDI1P32340 YPL205CYPL205C 345 nt2.56□□□□□ -2
NDI1P32340 UBP16YPL072W 1500 nt2.56□□□□□ -2
NDI1P32340 CAF120YNL278W 3183 nt2.56□□□□□ -2
NDI1P32340 BI4Q0120 1917 nt2.56□□□□□ -2
NDI1P32340 PDR1YGL013C 3207 nt2.55□□□□□ -2
NDI1P32340 YIL080WYIL080W 4722 nt2.55□□□□□ -2
NDI1P32340 ASM4YDL088C 1587 nt2.55□□□□□ -2
NDI1P32340 NOP19YGR251W 591 nt2.55□□□□□ -2
NDI1P32340 SYM1YLR251W 594 nt2.55□□□□□ -2
NDI1P32340 SRO77YBL106C 3033 nt2.55□□□□□ -2
NDI1P32340 TOR1YJR066W 7413 nt2.54□□□□□ -2
NDI1P32340 PDR11YIL013C 4236 nt2.54□□□□□ -2
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 20.2 ms