Protein–RNA interactions for Protein: P29056

BRF1, Transcription factor IIIB 70 kDa subunit, yeastyeast

Predictions only

Length 596 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
BRF1P29056 PUF4YGL014W 2667 nt2.62□□□□□ -1.99
BRF1P29056 KAR9YPL269W 1935 nt2.62□□□□□ -1.99
BRF1P29056 HSC82YMR186W 2118 nt2.62□□□□□ -1.99
BRF1P29056 TRZ1YKR079C 2517 nt2.62□□□□□ -1.99
BRF1P29056 YPR097WYPR097W 3222 nt2.61□□□□□ -1.99
BRF1P29056 RLF2YPR018W 1821 nt2.61□□□□□ -1.99
BRF1P29056 snR59snR59 78 nt2.61□□□□□ -1.99
BRF1P29056 VPS41YDR080W 2979 nt2.61□□□□□ -1.99
BRF1P29056 YDR115WYDR115W 318 nt2.61□□□□□ -1.99
BRF1P29056 TMA20YER007C-A 546 nt2.61□□□□□ -1.99
BRF1P29056 TWF1YGR080W 999 nt2.61□□□□□ -1.99
BRF1P29056 VPH2YKL119C 648 nt2.61□□□□□ -1.99
BRF1P29056 UTP30YKR060W 825 nt2.61□□□□□ -1.99
BRF1P29056 JID1YPR061C 906 nt2.61□□□□□ -1.99
BRF1P29056 RTT10YPL183C 3042 nt2.61□□□□□ -1.99
BRF1P29056 PDR3YBL005W 2931 nt2.61□□□□□ -1.99
BRF1P29056 snR5snR5 204 nt2.6□□□□□ -1.99
BRF1P29056 RPS26BYER131W 360 nt2.6□□□□□ -1.99
BRF1P29056 YIP5YGL161C 933 nt2.6□□□□□ -1.99
BRF1P29056 YHR054CYHR054C 1065 nt2.6□□□□□ -1.99
BRF1P29056 ACF4YJR083C 930 nt2.6□□□□□ -1.99
BRF1P29056 YNR025CYNR025C 360 nt2.6□□□□□ -1.99
BRF1P29056 YOR169CYOR169C 465 nt2.6□□□□□ -1.99
BRF1P29056 YPR147CYPR147C 915 nt2.6□□□□□ -1.99
BRF1P29056 MUD1YBR119W 897 nt2.6□□□□□ -1.99
BRF1P29056 TPS2YDR074W 2691 nt2.6□□□□□ -1.99
BRF1P29056 SHE4YOR035C 2370 nt2.59□□□□□ -1.99
BRF1P29056 NEW1YPL226W 3591 nt2.59□□□□□ -1.99
BRF1P29056 YRR1YOR162C 2433 nt2.59□□□□□ -1.99
BRF1P29056 RTS3YGR161C 792 nt2.59□□□□□ -1.99
BRF1P29056 YGR242WYGR242W 309 nt2.59□□□□□ -1.99
BRF1P29056 YJL119CYJL119C 324 nt2.59□□□□□ -1.99
BRF1P29056 LCL2YLR104W 396 nt2.59□□□□□ -1.99
BRF1P29056 RGM1YMR182C 636 nt2.59□□□□□ -1.99
BRF1P29056 YMR320WYMR320W 306 nt2.59□□□□□ -1.99
BRF1P29056 YAP7YOL028C 738 nt2.59□□□□□ -1.99
BRF1P29056 TAZ1YPR140W 1146 nt2.59□□□□□ -1.99
BRF1P29056 ESL2YKR096W 3588 nt2.59□□□□□ -1.99
BRF1P29056 SPF1YEL031W 3648 nt2.59□□□□□ -2
BRF1P29056 YFL012W-AYFL012W-A 375 nt2.58□□□□□ -2
BRF1P29056 PEX18YHR160C 852 nt2.58□□□□□ -2
BRF1P29056 YJR087WYJR087W 351 nt2.58□□□□□ -2
BRF1P29056 YLR224WYLR224W 1110 nt2.58□□□□□ -2
BRF1P29056 CSM4YPL200W 471 nt2.58□□□□□ -2
BRF1P29056 TRA1YHR099W 11235 nt2.58□□□□□ -2
BRF1P29056 COG3YER157W 2406 nt2.58□□□□□ -2
BRF1P29056 DAL5YJR152W 1632 nt2.57□□□□□ -2
BRF1P29056 NAB3YPL190C 2409 nt2.57□□□□□ -2
BRF1P29056 snR9snR9 187 nt2.57□□□□□ -2
BRF1P29056 GPI19YDR437W 423 nt2.57□□□□□ -2
BRF1P29056 YHR032W-AYHR032W-A 180 nt2.57□□□□□ -2
BRF1P29056 YNL150WYNL150W 408 nt2.57□□□□□ -2
BRF1P29056 YNL303WYNL303W 348 nt2.57□□□□□ -2
BRF1P29056 MIX23YBL107C 591 nt2.57□□□□□ -2
BRF1P29056 DAD3YBR233W-A 285 nt2.57□□□□□ -2
BRF1P29056 AFI1YOR129C 2682 nt2.57□□□□□ -2
BRF1P29056 TOR1YJR066W 7413 nt2.57□□□□□ -2
BRF1P29056 YDR179W-AYDR179W-A 1392 nt2.57□□□□□ -2
BRF1P29056 SLN1YIL147C 3663 nt2.57□□□□□ -2
BRF1P29056 TOF1YNL273W 3717 nt2.57□□□□□ -2
BRF1P29056 RPO41YFL036W 4056 nt2.57□□□□□ -2
BRF1P29056 PTP3YER075C 2787 nt2.56□□□□□ -2
BRF1P29056 SEC26YDR238C 2922 nt2.56□□□□□ -2
BRF1P29056 INP53YOR109W 3324 nt2.56□□□□□ -2
BRF1P29056 MES1YGR264C 2256 nt2.56□□□□□ -2
BRF1P29056 YER189WYER189W 369 nt2.56□□□□□ -2
BRF1P29056 PRP38YGR075C 729 nt2.56□□□□□ -2
BRF1P29056 PDP3YLR455W 915 nt2.56□□□□□ -2
BRF1P29056 ATP18YML081C-A 180 nt2.56□□□□□ -2
BRF1P29056 YMR254CYMR254C 309 nt2.56□□□□□ -2
BRF1P29056 PEX17YNL214W 600 nt2.56□□□□□ -2
BRF1P29056 YNR034W-AYNR034W-A 297 nt2.56□□□□□ -2
BRF1P29056 ESF2YNR054C 951 nt2.56□□□□□ -2
BRF1P29056 VID24YBR105C 1089 nt2.56□□□□□ -2
BRF1P29056 UBP16YPL072W 1500 nt2.56□□□□□ -2
BRF1P29056 STE11YLR362W 2154 nt2.56□□□□□ -2
BRF1P29056 SIP3YNL257C 3690 nt2.55□□□□□ -2
BRF1P29056 SDC1YDR469W 528 nt2.55□□□□□ -2
BRF1P29056 MPO1YGL010W 525 nt2.55□□□□□ -2
BRF1P29056 FYV4YHR059W 393 nt2.55□□□□□ -2
BRF1P29056 KSP1YHR082C 3090 nt2.55□□□□□ -2
BRF1P29056 PAU8YAL068C 363 nt2.55□□□□□ -2
BRF1P29056 ATG38YLR211C 681 nt2.55□□□□□ -2
BRF1P29056 PAU20YOL161C 363 nt2.55□□□□□ -2
BRF1P29056 YEL043WYEL043W 2871 nt2.55□□□□□ -2
BRF1P29056 OCA6YDR067C 675 nt2.54□□□□□ -2
BRF1P29056 IRC2YDR112W 309 nt2.54□□□□□ -2
BRF1P29056 NCB2YDR397C 441 nt2.54□□□□□ -2
BRF1P29056 YER119C-AYER119C-A 372 nt2.54□□□□□ -2
BRF1P29056 VMA21YGR105W 234 nt2.54□□□□□ -2
BRF1P29056 SDL1YIL167W 633 nt2.54□□□□□ -2
BRF1P29056 YAL026C-AYAL026C-A 438 nt2.54□□□□□ -2
BRF1P29056 YKL165C-AYKL165C-A 234 nt2.54□□□□□ -2
BRF1P29056 PEP12YOR036W 867 nt2.54□□□□□ -2
BRF1P29056 CBF2YGR140W 2871 nt2.53□□□□□ -2
BRF1P29056 GAL80YML051W 1308 nt2.53□□□□□ -2
BRF1P29056 STD1YOR047C 1335 nt2.53□□□□□ -2
BRF1P29056 YDR018CYDR018C 1191 nt2.53□□□□□ -2
BRF1P29056 ADK1YDR226W 669 nt2.53□□□□□ -2
BRF1P29056 YDR537CYDR537C 606 nt2.53□□□□□ -2
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