Protein–RNA interactions for Protein: P28715

ERCC5, DNA repair protein complementing XP-G cells, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC5P28715 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ERCC5P28715 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ERCC5P28715 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ERCC5P28715 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ERCC5P28715 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ERCC5P28715 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ERCC5P28715 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ERCC5P28715 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ERCC5P28715 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ERCC5P28715 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ERCC5P28715 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
ERCC5P28715 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ERCC5P28715 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
ERCC5P28715 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
ERCC5P28715 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ERCC5P28715 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ERCC5P28715 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ERCC5P28715 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ERCC5P28715 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ERCC5P28715 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ERCC5P28715 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ERCC5P28715 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
ERCC5P28715 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ERCC5P28715 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ERCC5P28715 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ERCC5P28715 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ERCC5P28715 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
ERCC5P28715 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ERCC5P28715 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ERCC5P28715 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ERCC5P28715 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ERCC5P28715 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ERCC5P28715 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ERCC5P28715 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ERCC5P28715 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ERCC5P28715 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ERCC5P28715 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ERCC5P28715 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ERCC5P28715 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ERCC5P28715 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ERCC5P28715 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ERCC5P28715 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ERCC5P28715 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ERCC5P28715 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ERCC5P28715 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ERCC5P28715 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ERCC5P28715 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ERCC5P28715 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ERCC5P28715 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ERCC5P28715 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ERCC5P28715 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ERCC5P28715 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ERCC5P28715 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ERCC5P28715 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ERCC5P28715 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ERCC5P28715 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ERCC5P28715 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ERCC5P28715 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ERCC5P28715 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ERCC5P28715 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ERCC5P28715 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ERCC5P28715 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ERCC5P28715 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
ERCC5P28715 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ERCC5P28715 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ERCC5P28715 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ERCC5P28715 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ERCC5P28715 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ERCC5P28715 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ERCC5P28715 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ERCC5P28715 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ERCC5P28715 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ERCC5P28715 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ERCC5P28715 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
ERCC5P28715 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ERCC5P28715 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ERCC5P28715 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
ERCC5P28715 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
ERCC5P28715 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ERCC5P28715 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ERCC5P28715 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ERCC5P28715 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
ERCC5P28715 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ERCC5P28715 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ERCC5P28715 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ERCC5P28715 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ERCC5P28715 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ERCC5P28715 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ERCC5P28715 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
ERCC5P28715 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ERCC5P28715 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ERCC5P28715 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ERCC5P28715 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ERCC5P28715 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ERCC5P28715 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
ERCC5P28715 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ERCC5P28715 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ERCC5P28715 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ERCC5P28715 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ERCC5P28715 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 118.5 ms