Protein–RNA interactions for Protein: P25441

RPC53, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC4, yeast

Predictions only

Length 422 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RPC53	P25441	PAU14	YIL176C	363 nt		2.62	□□□□□ -1.99
RPC53	P25441	PAU1	YJL223C	363 nt		2.62	□□□□□ -1.99
RPC53	P25441	YLR154W-E	YLR154W-E	204 nt		2.62	□□□□□ -1.99
RPC53	P25441	YBR063C	YBR063C	1215 nt		2.62	□□□□□ -1.99
RPC53	P25441	NCS2	YNL119W	1482 nt		2.62	□□□□□ -1.99
RPC53	P25441	SCP160	YJL080C	3669 nt		2.62	□□□□□ -1.99
RPC53	P25441	YPR089W	YPR089W	2667 nt		2.61	□□□□□ -1.99
RPC53	P25441	YNL046W	YNL046W	519 nt		2.61	□□□□□ -1.99
RPC53	P25441	YNL050C	YNL050C	813 nt		2.61	□□□□□ -1.99
RPC53	P25441	YPR145C-A	YPR145C-A	237 nt		2.61	□□□□□ -1.99
RPC53	P25441	KSP1	YHR082C	3090 nt		2.61	□□□□□ -1.99
RPC53	P25441	GDI1	YER136W	1356 nt		2.61	□□□□□ -1.99
RPC53	P25441	ROY1	YMR258C	1662 nt		2.6	□□□□□ -1.99
RPC53	P25441	LEU3	YLR451W	2661 nt		2.6	□□□□□ -1.99
RPC53	P25441	SIR3	YLR442C	2937 nt		2.6	□□□□□ -1.99
RPC53	P25441	SNF12	YNR023W	1701 nt		2.6	□□□□□ -1.99
RPC53	P25441	MND1	YGL183C	660 nt		2.6	□□□□□ -1.99
RPC53	P25441	YGR293C	YGR293C	462 nt		2.6	□□□□□ -1.99
RPC53	P25441	SRP21	YKL122C	504 nt		2.6	□□□□□ -1.99
RPC53	P25441	BET3	YKR068C	582 nt		2.6	□□□□□ -1.99
RPC53	P25441	TMA10	YLR327C	261 nt		2.6	□□□□□ -1.99
RPC53	P25441	GIM3	YNL153C	390 nt		2.6	□□□□□ -1.99
RPC53	P25441	NSL1	YPL233W	651 nt		2.6	□□□□□ -1.99
RPC53	P25441	ALG14	YBR070C	714 nt		2.6	□□□□□ -1.99
RPC53	P25441	MSB1	YOR188W	3414 nt		2.6	□□□□□ -1.99
RPC53	P25441	INP51	YIL002C	2841 nt		2.6	□□□□□ -1.99
RPC53	P25441	SHE4	YOR035C	2370 nt		2.59	□□□□□ -1.99
RPC53	P25441	RGA2	YDR379W	3030 nt		2.59	□□□□□ -1.99
RPC53	P25441	SVL3	YPL032C	2478 nt		2.59	□□□□□ -1.99
RPC53	P25441	snR59	snR59	78 nt		2.59	□□□□□ -1.99
RPC53	P25441	YCR064C	YCR064C	411 nt		2.59	□□□□□ -1.99
RPC53	P25441	YDR115W	YDR115W	318 nt		2.59	□□□□□ -1.99
RPC53	P25441	FAR7	YFR008W	666 nt		2.59	□□□□□ -1.99
RPC53	P25441	YGR226C	YGR226C	210 nt		2.59	□□□□□ -1.99
RPC53	P25441	RCN1	YKL159C	636 nt		2.59	□□□□□ -1.99
RPC53	P25441	YLR224W	YLR224W	1110 nt		2.59	□□□□□ -1.99
RPC53	P25441	YMR194C-A	YMR194C-A	225 nt		2.59	□□□□□ -1.99
RPC53	P25441	YBR197C	YBR197C	654 nt		2.59	□□□□□ -1.99
RPC53	P25441	YCL007C	YCL007C	393 nt		2.59	□□□□□ -1.99
RPC53	P25441	PRP6	YBR055C	2700 nt		2.59	□□□□□ -2
RPC53	P25441	HSC82	YMR186W	2118 nt		2.59	□□□□□ -2
RPC53	P25441	INP53	YOR109W	3324 nt		2.58	□□□□□ -2
RPC53	P25441	OSW7	YFR039C	1533 nt		2.58	□□□□□ -2
RPC53	P25441	VPS13	YLL040C	9435 nt		2.58	□□□□□ -2
RPC53	P25441	YER119C-A	YER119C-A	372 nt		2.58	□□□□□ -2
RPC53	P25441	YGR283C	YGR283C	1026 nt		2.58	□□□□□ -2
RPC53	P25441	ECM9	YKR004C	1134 nt		2.58	□□□□□ -2
RPC53	P25441	YNL150W	YNL150W	408 nt		2.58	□□□□□ -2
RPC53	P25441	YNL235C	YNL235C	432 nt		2.58	□□□□□ -2
RPC53	P25441	YPR170C	YPR170C	336 nt		2.58	□□□□□ -2
RPC53	P25441	SNU114	YKL173W	3027 nt		2.58	□□□□□ -2
RPC53	P25441	YKR078W	YKR078W	1758 nt		2.58	□□□□□ -2
RPC53	P25441	SCD5	YOR329C	2619 nt		2.57	□□□□□ -2
RPC53	P25441	snR5	snR5	204 nt		2.57	□□□□□ -2
RPC53	P25441	VPS74	YDR372C	1038 nt		2.57	□□□□□ -2
RPC53	P25441	YHR054C	YHR054C	1065 nt		2.57	□□□□□ -2
RPC53	P25441	YJL147C	YJL147C	1149 nt		2.57	□□□□□ -2
RPC53	P25441	PDP3	YLR455W	915 nt		2.57	□□□□□ -2
RPC53	P25441	YMR144W	YMR144W	1029 nt		2.57	□□□□□ -2
RPC53	P25441	ARR2	YPR200C	393 nt		2.57	□□□□□ -2
RPC53	P25441	TRS130	YMR218C	3309 nt		2.57	□□□□□ -2
RPC53	P25441	SMC6	YLR383W	3345 nt		2.57	□□□□□ -2
RPC53	P25441	APL5	YPL195W	2799 nt		2.56	□□□□□ -2
RPC53	P25441	TWF1	YGR080W	999 nt		2.56	□□□□□ -2
RPC53	P25441	ACF4	YJR083C	930 nt		2.56	□□□□□ -2
RPC53	P25441	PSY1	YKL076C	384 nt		2.56	□□□□□ -2
RPC53	P25441	SAS2	YMR127C	1017 nt		2.56	□□□□□ -2
RPC53	P25441	YOL029C	YOL029C	606 nt		2.56	□□□□□ -2
RPC53	P25441	TRA1	YHR099W	11235 nt		2.56	□□□□□ -2
RPC53	P25441	YEL043W	YEL043W	2871 nt		2.56	□□□□□ -2
RPC53	P25441	PSO2	YMR137C	1986 nt		2.56	□□□□□ -2
RPC53	P25441	YCR108C	YCR108C	192 nt		2.55	□□□□□ -2
RPC53	P25441	YDL163W	YDL163W	303 nt		2.55	□□□□□ -2
RPC53	P25441	YDR461C-A	YDR461C-A	243 nt		2.55	□□□□□ -2
RPC53	P25441	SDC1	YDR469W	528 nt		2.55	□□□□□ -2
RPC53	P25441	PES4	YFR023W	1836 nt		2.55	□□□□□ -2
RPC53	P25441	ACB1	YGR037C	264 nt		2.55	□□□□□ -2
RPC53	P25441	AIM32	YML050W	936 nt		2.55	□□□□□ -2
RPC53	P25441	ATP3	YBR039W	936 nt		2.55	□□□□□ -2
RPC53	P25441	RGL1	YPL066W	1440 nt		2.55	□□□□□ -2
RPC53	P25441	ECM5	YMR176W	4236 nt		2.55	□□□□□ -2
RPC53	P25441	MLH1	YMR167W	2310 nt		2.54	□□□□□ -2
RPC53	P25441	SAK1	YER129W	3429 nt		2.54	□□□□□ -2
RPC53	P25441	APM3	YBR288C	1452 nt		2.54	□□□□□ -2
RPC53	P25441	NUP100	YKL068W	2880 nt		2.54	□□□□□ -2
RPC53	P25441	YDR537C	YDR537C	606 nt		2.54	□□□□□ -2
RPC53	P25441	YER079C-A	YER079C-A	339 nt		2.54	□□□□□ -2
RPC53	P25441	YFR009W-A	YFR009W-A	258 nt		2.54	□□□□□ -2
RPC53	P25441	TAP42	YMR028W	1101 nt		2.54	□□□□□ -2
RPC53	P25441	IGO1	YNL157W	507 nt		2.54	□□□□□ -2
RPC53	P25441	TRM7	YBR061C	933 nt		2.54	□□□□□ -2
RPC53	P25441	PHO2	YDL106C	1680 nt		2.53	□□□□□ -2
RPC53	P25441	VPS16	YPL045W	2397 nt		2.53	□□□□□ -2
RPC53	P25441	UBP15	YMR304W	3693 nt		2.53	□□□□□ -2
RPC53	P25441	SPF1	YEL031W	3648 nt		2.53	□□□□□ -2
RPC53	P25441	snR9	snR9	187 nt		2.53	□□□□□ -2
RPC53	P25441	VTC1	YER072W	390 nt		2.53	□□□□□ -2
RPC53	P25441	AIM19	YIL087C	474 nt		2.53	□□□□□ -2
RPC53	P25441	AYR1	YIL124W	894 nt		2.53	□□□□□ -2
RPC53	P25441	YMR320W	YMR320W	306 nt		2.53	□□□□□ -2

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