Protein–RNA interactions for Protein: A6NKF2

ARID3C, AT-rich interactive domain-containing protein 3C, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID3CA6NKF2 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC32.36■■■□□ 2.77
ARID3CA6NKF2 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.36■■■□□ 2.77
ARID3CA6NKF2 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC32.36■■■□□ 2.77
ARID3CA6NKF2 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
ARID3CA6NKF2 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC32.36■■■□□ 2.77
ARID3CA6NKF2 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
ARID3CA6NKF2 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
ARID3CA6NKF2 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
ARID3CA6NKF2 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
ARID3CA6NKF2 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
ARID3CA6NKF2 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
ARID3CA6NKF2 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.35■■■□□ 2.77
ARID3CA6NKF2 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC32.35■■■□□ 2.77
ARID3CA6NKF2 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.35■■■□□ 2.77
ARID3CA6NKF2 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
ARID3CA6NKF2 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC32.35■■■□□ 2.77
ARID3CA6NKF2 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC32.35■■■□□ 2.77
ARID3CA6NKF2 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.35■■■□□ 2.77
ARID3CA6NKF2 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
ARID3CA6NKF2 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
ARID3CA6NKF2 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
ARID3CA6NKF2 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
ARID3CA6NKF2 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
ARID3CA6NKF2 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
ARID3CA6NKF2 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
ARID3CA6NKF2 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
ARID3CA6NKF2 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC32.34■■■□□ 2.77
ARID3CA6NKF2 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC32.34■■■□□ 2.77
ARID3CA6NKF2 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.34■■■□□ 2.77
ARID3CA6NKF2 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
ARID3CA6NKF2 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
ARID3CA6NKF2 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC32.34■■■□□ 2.77
ARID3CA6NKF2 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
ARID3CA6NKF2 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
ARID3CA6NKF2 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
ARID3CA6NKF2 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.33■■■□□ 2.77
ARID3CA6NKF2 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC32.33■■■□□ 2.77
ARID3CA6NKF2 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC32.33■■■□□ 2.77
ARID3CA6NKF2 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.33■■■□□ 2.77
ARID3CA6NKF2 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC32.33■■■□□ 2.77
ARID3CA6NKF2 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
ARID3CA6NKF2 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
ARID3CA6NKF2 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC32.33■■■□□ 2.77
ARID3CA6NKF2 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
ARID3CA6NKF2 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
ARID3CA6NKF2 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
ARID3CA6NKF2 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC32.33■■■□□ 2.77
ARID3CA6NKF2 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC32.33■■■□□ 2.77
ARID3CA6NKF2 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
ARID3CA6NKF2 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.32■■■□□ 2.77
ARID3CA6NKF2 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
ARID3CA6NKF2 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC32.32■■■□□ 2.76
ARID3CA6NKF2 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
ARID3CA6NKF2 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
ARID3CA6NKF2 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
ARID3CA6NKF2 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
ARID3CA6NKF2 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC32.32■■■□□ 2.76
ARID3CA6NKF2 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC32.32■■■□□ 2.76
ARID3CA6NKF2 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
ARID3CA6NKF2 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
ARID3CA6NKF2 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
ARID3CA6NKF2 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
ARID3CA6NKF2 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC32.31■■■□□ 2.76
ARID3CA6NKF2 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC32.31■■■□□ 2.76
ARID3CA6NKF2 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC32.31■■■□□ 2.76
ARID3CA6NKF2 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC32.31■■■□□ 2.76
ARID3CA6NKF2 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
ARID3CA6NKF2 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC32.31■■■□□ 2.76
ARID3CA6NKF2 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
ARID3CA6NKF2 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC32.3■■■□□ 2.76
ARID3CA6NKF2 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC32.3■■■□□ 2.76
ARID3CA6NKF2 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC32.3■■■□□ 2.76
ARID3CA6NKF2 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
ARID3CA6NKF2 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.3■■■□□ 2.76
ARID3CA6NKF2 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
ARID3CA6NKF2 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC32.3■■■□□ 2.76
ARID3CA6NKF2 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC32.3■■■□□ 2.76
ARID3CA6NKF2 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC32.3■■■□□ 2.76
ARID3CA6NKF2 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.3■■■□□ 2.76
ARID3CA6NKF2 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC32.3■■■□□ 2.76
ARID3CA6NKF2 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
ARID3CA6NKF2 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC32.3■■■□□ 2.76
ARID3CA6NKF2 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
ARID3CA6NKF2 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
ARID3CA6NKF2 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
ARID3CA6NKF2 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC32.29■■■□□ 2.76
ARID3CA6NKF2 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
ARID3CA6NKF2 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC32.29■■■□□ 2.76
ARID3CA6NKF2 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC32.29■■■□□ 2.76
ARID3CA6NKF2 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC32.29■■■□□ 2.76
ARID3CA6NKF2 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC32.29■■■□□ 2.76
ARID3CA6NKF2 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC32.29■■■□□ 2.76
ARID3CA6NKF2 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
ARID3CA6NKF2 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
ARID3CA6NKF2 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.29■■■□□ 2.76
ARID3CA6NKF2 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
ARID3CA6NKF2 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC32.28■■■□□ 2.76
ARID3CA6NKF2 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
ARID3CA6NKF2 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC32.28■■■□□ 2.76
ARID3CA6NKF2 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC32.28■■■□□ 2.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.8 ms