Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKI3

VPREB3, Pre-B lymphocyte protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB3Q9UKI3 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
VPREB3Q9UKI3 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
VPREB3Q9UKI3 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
VPREB3Q9UKI3 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
VPREB3Q9UKI3 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
VPREB3Q9UKI3 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
VPREB3Q9UKI3 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
VPREB3Q9UKI3 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VPREB3Q9UKI3 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
VPREB3Q9UKI3 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
VPREB3Q9UKI3 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VPREB3Q9UKI3 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VPREB3Q9UKI3 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VPREB3Q9UKI3 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
VPREB3Q9UKI3 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
VPREB3Q9UKI3 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VPREB3Q9UKI3 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VPREB3Q9UKI3 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VPREB3Q9UKI3 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
VPREB3Q9UKI3 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
VPREB3Q9UKI3 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
VPREB3Q9UKI3 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
VPREB3Q9UKI3 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
VPREB3Q9UKI3 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
VPREB3Q9UKI3 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
VPREB3Q9UKI3 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
VPREB3Q9UKI3 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
VPREB3Q9UKI3 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
VPREB3Q9UKI3 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
VPREB3Q9UKI3 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
VPREB3Q9UKI3 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
VPREB3Q9UKI3 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
VPREB3Q9UKI3 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
VPREB3Q9UKI3 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
VPREB3Q9UKI3 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
VPREB3Q9UKI3 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
VPREB3Q9UKI3 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
VPREB3Q9UKI3 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
VPREB3Q9UKI3 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
VPREB3Q9UKI3 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
VPREB3Q9UKI3 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
VPREB3Q9UKI3 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
VPREB3Q9UKI3 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
VPREB3Q9UKI3 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
VPREB3Q9UKI3 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
VPREB3Q9UKI3 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
VPREB3Q9UKI3 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
VPREB3Q9UKI3 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
VPREB3Q9UKI3 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
VPREB3Q9UKI3 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
VPREB3Q9UKI3 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
VPREB3Q9UKI3 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
VPREB3Q9UKI3 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
VPREB3Q9UKI3 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
VPREB3Q9UKI3 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
VPREB3Q9UKI3 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
VPREB3Q9UKI3 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
VPREB3Q9UKI3 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
VPREB3Q9UKI3 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
VPREB3Q9UKI3 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
VPREB3Q9UKI3 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
VPREB3Q9UKI3 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
VPREB3Q9UKI3 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
VPREB3Q9UKI3 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
VPREB3Q9UKI3 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
VPREB3Q9UKI3 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
VPREB3Q9UKI3 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
VPREB3Q9UKI3 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
VPREB3Q9UKI3 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
VPREB3Q9UKI3 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
VPREB3Q9UKI3 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
VPREB3Q9UKI3 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
VPREB3Q9UKI3 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
VPREB3Q9UKI3 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
VPREB3Q9UKI3 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
VPREB3Q9UKI3 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
VPREB3Q9UKI3 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
VPREB3Q9UKI3 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
VPREB3Q9UKI3 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
VPREB3Q9UKI3 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
VPREB3Q9UKI3 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
VPREB3Q9UKI3 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
VPREB3Q9UKI3 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
VPREB3Q9UKI3 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
VPREB3Q9UKI3 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
VPREB3Q9UKI3 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
VPREB3Q9UKI3 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
VPREB3Q9UKI3 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
VPREB3Q9UKI3 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
VPREB3Q9UKI3 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
VPREB3Q9UKI3 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
VPREB3Q9UKI3 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
VPREB3Q9UKI3 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
VPREB3Q9UKI3 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
VPREB3Q9UKI3 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
VPREB3Q9UKI3 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
VPREB3Q9UKI3 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
VPREB3Q9UKI3 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
VPREB3Q9UKI3 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
VPREB3Q9UKI3 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.9 ms