Protein–RNA interactions for Protein: Q96EB6

SIRT1, NAD-dependent protein deacetylase sirtuin-1, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIRT1Q96EB6 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SIRT1Q96EB6 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
SIRT1Q96EB6 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SIRT1Q96EB6 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
SIRT1Q96EB6 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SIRT1Q96EB6 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
SIRT1Q96EB6 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC28.79■■■□□ 2.2
SIRT1Q96EB6 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
SIRT1Q96EB6 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC28.79■■■□□ 2.2
SIRT1Q96EB6 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SIRT1Q96EB6 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SIRT1Q96EB6 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
SIRT1Q96EB6 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SIRT1Q96EB6 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SIRT1Q96EB6 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SIRT1Q96EB6 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SIRT1Q96EB6 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SIRT1Q96EB6 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
SIRT1Q96EB6 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SIRT1Q96EB6 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SIRT1Q96EB6 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
SIRT1Q96EB6 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
SIRT1Q96EB6 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
SIRT1Q96EB6 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
SIRT1Q96EB6 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SIRT1Q96EB6 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SIRT1Q96EB6 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SIRT1Q96EB6 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SIRT1Q96EB6 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SIRT1Q96EB6 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SIRT1Q96EB6 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SIRT1Q96EB6 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SIRT1Q96EB6 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
SIRT1Q96EB6 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
SIRT1Q96EB6 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
SIRT1Q96EB6 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SIRT1Q96EB6 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
SIRT1Q96EB6 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SIRT1Q96EB6 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
SIRT1Q96EB6 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
SIRT1Q96EB6 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
SIRT1Q96EB6 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
SIRT1Q96EB6 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
SIRT1Q96EB6 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
SIRT1Q96EB6 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
SIRT1Q96EB6 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
SIRT1Q96EB6 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
SIRT1Q96EB6 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
SIRT1Q96EB6 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
SIRT1Q96EB6 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
SIRT1Q96EB6 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
SIRT1Q96EB6 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
SIRT1Q96EB6 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
SIRT1Q96EB6 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC28.75■■■□□ 2.19
SIRT1Q96EB6 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
SIRT1Q96EB6 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
SIRT1Q96EB6 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
SIRT1Q96EB6 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
SIRT1Q96EB6 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC28.75■■■□□ 2.19
SIRT1Q96EB6 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
SIRT1Q96EB6 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
SIRT1Q96EB6 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
SIRT1Q96EB6 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
SIRT1Q96EB6 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
SIRT1Q96EB6 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
SIRT1Q96EB6 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
SIRT1Q96EB6 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
SIRT1Q96EB6 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
SIRT1Q96EB6 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
SIRT1Q96EB6 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
SIRT1Q96EB6 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
SIRT1Q96EB6 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
SIRT1Q96EB6 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
SIRT1Q96EB6 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
SIRT1Q96EB6 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
SIRT1Q96EB6 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
SIRT1Q96EB6 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
SIRT1Q96EB6 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
SIRT1Q96EB6 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
SIRT1Q96EB6 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
SIRT1Q96EB6 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
SIRT1Q96EB6 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
SIRT1Q96EB6 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
SIRT1Q96EB6 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
SIRT1Q96EB6 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
SIRT1Q96EB6 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
SIRT1Q96EB6 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
SIRT1Q96EB6 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
SIRT1Q96EB6 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
SIRT1Q96EB6 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
SIRT1Q96EB6 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
SIRT1Q96EB6 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
SIRT1Q96EB6 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
SIRT1Q96EB6 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
SIRT1Q96EB6 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
SIRT1Q96EB6 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
SIRT1Q96EB6 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
SIRT1Q96EB6 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
SIRT1Q96EB6 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
SIRT1Q96EB6 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms