Protein–RNA interactions for Protein: Q96BQ3

TRIM43, Tripartite motif-containing protein 43, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM43Q96BQ3 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRIM43Q96BQ3 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRIM43Q96BQ3 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRIM43Q96BQ3 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRIM43Q96BQ3 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRIM43Q96BQ3 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRIM43Q96BQ3 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRIM43Q96BQ3 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRIM43Q96BQ3 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRIM43Q96BQ3 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRIM43Q96BQ3 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRIM43Q96BQ3 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRIM43Q96BQ3 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRIM43Q96BQ3 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRIM43Q96BQ3 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRIM43Q96BQ3 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRIM43Q96BQ3 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRIM43Q96BQ3 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRIM43Q96BQ3 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRIM43Q96BQ3 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRIM43Q96BQ3 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRIM43Q96BQ3 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRIM43Q96BQ3 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
TRIM43Q96BQ3 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRIM43Q96BQ3 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRIM43Q96BQ3 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
TRIM43Q96BQ3 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRIM43Q96BQ3 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRIM43Q96BQ3 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRIM43Q96BQ3 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRIM43Q96BQ3 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRIM43Q96BQ3 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRIM43Q96BQ3 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRIM43Q96BQ3 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRIM43Q96BQ3 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRIM43Q96BQ3 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRIM43Q96BQ3 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRIM43Q96BQ3 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRIM43Q96BQ3 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
TRIM43Q96BQ3 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRIM43Q96BQ3 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
TRIM43Q96BQ3 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRIM43Q96BQ3 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRIM43Q96BQ3 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRIM43Q96BQ3 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRIM43Q96BQ3 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRIM43Q96BQ3 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRIM43Q96BQ3 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRIM43Q96BQ3 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRIM43Q96BQ3 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRIM43Q96BQ3 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRIM43Q96BQ3 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRIM43Q96BQ3 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRIM43Q96BQ3 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRIM43Q96BQ3 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
TRIM43Q96BQ3 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRIM43Q96BQ3 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRIM43Q96BQ3 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRIM43Q96BQ3 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRIM43Q96BQ3 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRIM43Q96BQ3 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRIM43Q96BQ3 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRIM43Q96BQ3 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRIM43Q96BQ3 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRIM43Q96BQ3 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRIM43Q96BQ3 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRIM43Q96BQ3 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
TRIM43Q96BQ3 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRIM43Q96BQ3 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRIM43Q96BQ3 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRIM43Q96BQ3 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRIM43Q96BQ3 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRIM43Q96BQ3 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRIM43Q96BQ3 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
TRIM43Q96BQ3 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRIM43Q96BQ3 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
TRIM43Q96BQ3 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
TRIM43Q96BQ3 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TRIM43Q96BQ3 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRIM43Q96BQ3 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRIM43Q96BQ3 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRIM43Q96BQ3 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRIM43Q96BQ3 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRIM43Q96BQ3 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRIM43Q96BQ3 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRIM43Q96BQ3 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRIM43Q96BQ3 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRIM43Q96BQ3 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRIM43Q96BQ3 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRIM43Q96BQ3 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRIM43Q96BQ3 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
TRIM43Q96BQ3 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRIM43Q96BQ3 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRIM43Q96BQ3 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRIM43Q96BQ3 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRIM43Q96BQ3 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRIM43Q96BQ3 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRIM43Q96BQ3 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRIM43Q96BQ3 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRIM43Q96BQ3 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.3 ms