Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4S0

CCDC82, Coiled-coil domain-containing protein 82, humanhuman

Predictions only

Length 544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC82Q8N4S0 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC82Q8N4S0 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC82Q8N4S0 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC82Q8N4S0 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC82Q8N4S0 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC82Q8N4S0 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC82Q8N4S0 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC82Q8N4S0 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC82Q8N4S0 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC82Q8N4S0 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC82Q8N4S0 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC82Q8N4S0 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC82Q8N4S0 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC82Q8N4S0 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC82Q8N4S0 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC82Q8N4S0 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC82Q8N4S0 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC82Q8N4S0 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC82Q8N4S0 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC82Q8N4S0 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC82Q8N4S0 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC82Q8N4S0 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC82Q8N4S0 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC82Q8N4S0 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC82Q8N4S0 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC82Q8N4S0 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC82Q8N4S0 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC82Q8N4S0 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC82Q8N4S0 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC82Q8N4S0 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC82Q8N4S0 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC82Q8N4S0 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC82Q8N4S0 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC82Q8N4S0 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC82Q8N4S0 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC82Q8N4S0 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
CCDC82Q8N4S0 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC82Q8N4S0 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC82Q8N4S0 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC82Q8N4S0 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC82Q8N4S0 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC82Q8N4S0 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC82Q8N4S0 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC82Q8N4S0 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC82Q8N4S0 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC82Q8N4S0 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC82Q8N4S0 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC82Q8N4S0 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC82Q8N4S0 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC82Q8N4S0 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC82Q8N4S0 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC82Q8N4S0 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC82Q8N4S0 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC82Q8N4S0 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC82Q8N4S0 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC82Q8N4S0 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC82Q8N4S0 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC82Q8N4S0 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC82Q8N4S0 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC82Q8N4S0 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC82Q8N4S0 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC82Q8N4S0 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC82Q8N4S0 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC82Q8N4S0 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC24■■□□□ 1.43
CCDC82Q8N4S0 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC82Q8N4S0 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC82Q8N4S0 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC82Q8N4S0 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC82Q8N4S0 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC82Q8N4S0 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC82Q8N4S0 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC82Q8N4S0 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC82Q8N4S0 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC82Q8N4S0 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC82Q8N4S0 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC82Q8N4S0 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC82Q8N4S0 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC82Q8N4S0 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC82Q8N4S0 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC82Q8N4S0 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC82Q8N4S0 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC82Q8N4S0 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC82Q8N4S0 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC82Q8N4S0 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC82Q8N4S0 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC82Q8N4S0 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC82Q8N4S0 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC82Q8N4S0 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC82Q8N4S0 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC82Q8N4S0 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC82Q8N4S0 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC82Q8N4S0 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC82Q8N4S0 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC82Q8N4S0 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC82Q8N4S0 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC82Q8N4S0 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC82Q8N4S0 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC82Q8N4S0 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC82Q8N4S0 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC82Q8N4S0 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms