Protein–RNA interactions for Protein: Q05580

HEL2, E3 ubiquitin-protein ligase HEL2, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 639 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
HEL2Q05580 ARK1YNL020C 1917 nt2.83□□□□□ -1.96
HEL2Q05580 TFC4YGR047C 3078 nt2.83□□□□□ -1.96
HEL2Q05580 POM152YMR129W 4014 nt2.83□□□□□ -1.96
HEL2Q05580 YCR013CYCR013C 648 nt2.83□□□□□ -1.96
HEL2Q05580 RRT13YER066W 558 nt2.83□□□□□ -1.96
HEL2Q05580 PEA2YER149C 1263 nt2.83□□□□□ -1.96
HEL2Q05580 SAE2YGL175C 1038 nt2.83□□□□□ -1.96
HEL2Q05580 YGR045CYGR045C 363 nt2.83□□□□□ -1.96
HEL2Q05580 MIX23YBL107C 591 nt2.83□□□□□ -1.96
HEL2Q05580 GRE2YOL151W 1029 nt2.83□□□□□ -1.96
HEL2Q05580 CSM4YPL200W 471 nt2.83□□□□□ -1.96
HEL2Q05580 YPL276WYPL276W 438 nt2.83□□□□□ -1.96
HEL2Q05580 ESL1YIL151C 3357 nt2.83□□□□□ -1.96
HEL2Q05580 SIN3YOL004W 4611 nt2.83□□□□□ -1.96
HEL2Q05580 PHO2YDL106C 1680 nt2.82□□□□□ -1.96
HEL2Q05580 RTT10YPL183C 3042 nt2.82□□□□□ -1.96
HEL2Q05580 snR70snR70 164 nt2.82□□□□□ -1.96
HEL2Q05580 THG1YGR024C 714 nt2.82□□□□□ -1.96
HEL2Q05580 ERV1YGR029W 570 nt2.82□□□□□ -1.96
HEL2Q05580 ILM1YJR118C 612 nt2.82□□□□□ -1.96
HEL2Q05580 YPR145C-AYPR145C-A 237 nt2.82□□□□□ -1.96
HEL2Q05580 PHR1YOR386W 1698 nt2.82□□□□□ -1.96
HEL2Q05580 PFF1YBR074W 2931 nt2.82□□□□□ -1.96
HEL2Q05580 VPS64YDR200C 1815 nt2.82□□□□□ -1.96
HEL2Q05580 PBP4YDL053C 558 nt2.81□□□□□ -1.96
HEL2Q05580 RPL11BYGR085C 525 nt2.81□□□□□ -1.96
HEL2Q05580 YKL023C-AYKL023C-A 228 nt2.81□□□□□ -1.96
HEL2Q05580 AIM36YMR157C 768 nt2.81□□□□□ -1.96
HEL2Q05580 YNL122CYNL122C 348 nt2.81□□□□□ -1.96
HEL2Q05580 RPL11AYPR102C 525 nt2.81□□□□□ -1.96
HEL2Q05580 SUS1YBR111W-A 291 nt2.81□□□□□ -1.96
HEL2Q05580 NTC20YBR188C 423 nt2.81□□□□□ -1.96
HEL2Q05580 RGL1YPL066W 1440 nt2.81□□□□□ -1.96
HEL2Q05580 MAL33YBR297W 1407 nt2.81□□□□□ -1.96
HEL2Q05580 ANR2YKL047W 1551 nt2.81□□□□□ -1.96
HEL2Q05580 SLP1YOR154W 1764 nt2.8□□□□□ -1.96
HEL2Q05580 YDL187CYDL187C 330 nt2.8□□□□□ -1.96
HEL2Q05580 SLX9YGR081C 633 nt2.8□□□□□ -1.96
HEL2Q05580 tR(ACG)Q2tR(ACG)Q2 74 nt2.8□□□□□ -1.96
HEL2Q05580 YKR033CYKR033C 426 nt2.8□□□□□ -1.96
HEL2Q05580 PAU23YLR037C 375 nt2.8□□□□□ -1.96
HEL2Q05580 YOR385WYOR385W 873 nt2.8□□□□□ -1.96
HEL2Q05580 RPL36BYPL249C-A 303 nt2.8□□□□□ -1.96
HEL2Q05580 TMA64YDR117C 1698 nt2.79□□□□□ -1.96
HEL2Q05580 BCK1YJL095W 4437 nt2.79□□□□□ -1.96
HEL2Q05580 YDR115WYDR115W 318 nt2.79□□□□□ -1.96
HEL2Q05580 YDR118W-AYDR118W-A 117 nt2.79□□□□□ -1.96
HEL2Q05580 YDR262WYDR262W 819 nt2.79□□□□□ -1.96
HEL2Q05580 SRP21YKL122C 504 nt2.79□□□□□ -1.96
HEL2Q05580 ATG3YNR007C 933 nt2.79□□□□□ -1.96
HEL2Q05580 CSI2YOL007C 1026 nt2.79□□□□□ -1.96
HEL2Q05580 ESC1YMR219W 4977 nt2.79□□□□□ -1.96
HEL2Q05580 MOT1YPL082C 5604 nt2.78□□□□□ -1.96
HEL2Q05580 LST4YKL176C 2487 nt2.78□□□□□ -1.96
HEL2Q05580 TOM1YDR457W 9807 nt2.78□□□□□ -1.96
HEL2Q05580 CEP3YMR168C 1827 nt2.78□□□□□ -1.96
HEL2Q05580 ERP6YGL002W 651 nt2.78□□□□□ -1.96
HEL2Q05580 PRM8YGL053W 714 nt2.78□□□□□ -1.96
HEL2Q05580 YGR042WYGR042W 816 nt2.78□□□□□ -1.96
HEL2Q05580 CIC1YHR052W 1131 nt2.78□□□□□ -1.96
HEL2Q05580 PCL5YHR071W 690 nt2.78□□□□□ -1.96
HEL2Q05580 YIL068W-AYIL068W-A 384 nt2.78□□□□□ -1.96
HEL2Q05580 ASG7YJL170C 630 nt2.78□□□□□ -1.96
HEL2Q05580 SEN15YMR059W 387 nt2.78□□□□□ -1.96
HEL2Q05580 PAI3YMR174C 207 nt2.78□□□□□ -1.96
HEL2Q05580 STI1YOR027W 1770 nt2.78□□□□□ -1.96
HEL2Q05580 DBF20YPR111W 1695 nt2.78□□□□□ -1.96
HEL2Q05580 SNU56YDR240C 1479 nt2.77□□□□□ -1.97
HEL2Q05580 ERG28YER044C 447 nt2.77□□□□□ -1.97
HEL2Q05580 AST2YER101C 1293 nt2.77□□□□□ -1.97
HEL2Q05580 YIL012WYIL012W 342 nt2.77□□□□□ -1.97
HEL2Q05580 tW(CCA)G1tW(CCA)G1 72 nt2.77□□□□□ -1.97
HEL2Q05580 tW(CCA)G2tW(CCA)G2 72 nt2.77□□□□□ -1.97
HEL2Q05580 tW(CCA)JtW(CCA)J 72 nt2.77□□□□□ -1.97
HEL2Q05580 tW(CCA)KtW(CCA)K 72 nt2.77□□□□□ -1.97
HEL2Q05580 tW(CCA)MtW(CCA)M 72 nt2.77□□□□□ -1.97
HEL2Q05580 tW(CCA)PtW(CCA)P 72 nt2.77□□□□□ -1.97
HEL2Q05580 COQ10YOL008W 624 nt2.77□□□□□ -1.97
HEL2Q05580 YPL205CYPL205C 345 nt2.77□□□□□ -1.97
HEL2Q05580 RPB5YBR154C 648 nt2.77□□□□□ -1.97
HEL2Q05580 SEC66YBR171W 621 nt2.77□□□□□ -1.97
HEL2Q05580 SPR3YGR059W 1539 nt2.77□□□□□ -1.97
HEL2Q05580 YDR338CYDR338C 2088 nt2.77□□□□□ -1.97
HEL2Q05580 SWA2YDR320C 2007 nt2.76□□□□□ -1.97
HEL2Q05580 NEL1YHR035W 1893 nt2.76□□□□□ -1.97
HEL2Q05580 MRP10YDL045W-A 288 nt2.76□□□□□ -1.97
HEL2Q05580 MIC19YFR011C 513 nt2.76□□□□□ -1.97
HEL2Q05580 OTU2YHL013C 924 nt2.76□□□□□ -1.97
HEL2Q05580 YIL029CYIL029C 429 nt2.76□□□□□ -1.97
HEL2Q05580 YLR406C-AYLR406C-A 150 nt2.76□□□□□ -1.97
HEL2Q05580 YEF3YLR249W 3135 nt2.75□□□□□ -1.97
HEL2Q05580 ECM29YHL030W 5607 nt2.75□□□□□ -1.97
HEL2Q05580 AHC2YCR082W 387 nt2.75□□□□□ -1.97
HEL2Q05580 TIM11YDR322C-A 291 nt2.75□□□□□ -1.97
HEL2Q05580 YHR175W-AYHR175W-A 150 nt2.75□□□□□ -1.97
HEL2Q05580 YLR264C-AYLR264C-A 117 nt2.75□□□□□ -1.97
HEL2Q05580 YML037CYML037C 1023 nt2.75□□□□□ -1.97
HEL2Q05580 TOM22YNL131W 459 nt2.75□□□□□ -1.97
HEL2Q05580 YOL134CYOL134C 390 nt2.75□□□□□ -1.97
HEL2Q05580 YLR001CYLR001C 2589 nt2.75□□□□□ -1.97
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 44 ms