Protein–RNA interactions for Protein: Q01196

RUNX1, Runt-related transcription factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX1Q01196 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RUNX1Q01196 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RUNX1Q01196 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RUNX1Q01196 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RUNX1Q01196 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RUNX1Q01196 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RUNX1Q01196 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RUNX1Q01196 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RUNX1Q01196 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RUNX1Q01196 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
RUNX1Q01196 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RUNX1Q01196 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RUNX1Q01196 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
RUNX1Q01196 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RUNX1Q01196 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RUNX1Q01196 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RUNX1Q01196 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RUNX1Q01196 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RUNX1Q01196 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RUNX1Q01196 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RUNX1Q01196 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RUNX1Q01196 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RUNX1Q01196 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RUNX1Q01196 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RUNX1Q01196 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RUNX1Q01196 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RUNX1Q01196 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RUNX1Q01196 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RUNX1Q01196 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RUNX1Q01196 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RUNX1Q01196 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RUNX1Q01196 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RUNX1Q01196 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RUNX1Q01196 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RUNX1Q01196 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RUNX1Q01196 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RUNX1Q01196 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RUNX1Q01196 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RUNX1Q01196 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RUNX1Q01196 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RUNX1Q01196 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RUNX1Q01196 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RUNX1Q01196 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RUNX1Q01196 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RUNX1Q01196 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RUNX1Q01196 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RUNX1Q01196 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RUNX1Q01196 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RUNX1Q01196 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RUNX1Q01196 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RUNX1Q01196 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RUNX1Q01196 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RUNX1Q01196 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RUNX1Q01196 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RUNX1Q01196 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RUNX1Q01196 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RUNX1Q01196 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RUNX1Q01196 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RUNX1Q01196 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RUNX1Q01196 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RUNX1Q01196 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RUNX1Q01196 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RUNX1Q01196 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RUNX1Q01196 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RUNX1Q01196 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RUNX1Q01196 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RUNX1Q01196 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
RUNX1Q01196 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RUNX1Q01196 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RUNX1Q01196 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RUNX1Q01196 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RUNX1Q01196 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RUNX1Q01196 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RUNX1Q01196 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RUNX1Q01196 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.29
RUNX1Q01196 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.29
RUNX1Q01196 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
RUNX1Q01196 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
RUNX1Q01196 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
RUNX1Q01196 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
RUNX1Q01196 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
RUNX1Q01196 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
RUNX1Q01196 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
RUNX1Q01196 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
RUNX1Q01196 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
RUNX1Q01196 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
RUNX1Q01196 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
RUNX1Q01196 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
RUNX1Q01196 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
RUNX1Q01196 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
RUNX1Q01196 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
RUNX1Q01196 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
RUNX1Q01196 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
RUNX1Q01196 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
RUNX1Q01196 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
RUNX1Q01196 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RUNX1Q01196 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RUNX1Q01196 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RUNX1Q01196 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
RUNX1Q01196 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.1 ms