Protein–RNA interactions for Protein: P40087

DDI1, DNA damage-inducible protein 1, yeastyeast

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
DDI1P40087 tW(CCA)PtW(CCA)P 72 nt2.07□□□□□ -2.08
DDI1P40087 CMC1YKL137W 336 nt2.07□□□□□ -2.08
DDI1P40087 EMC6YLL014W 327 nt2.07□□□□□ -2.08
DDI1P40087 RMP1YLR145W 606 nt2.07□□□□□ -2.08
DDI1P40087 MRPS8YMR158W 468 nt2.07□□□□□ -2.08
DDI1P40087 YBL062WYBL062W 381 nt2.07□□□□□ -2.08
DDI1P40087 PEP12YOR036W 867 nt2.07□□□□□ -2.08
DDI1P40087 VAM3YOR106W 852 nt2.07□□□□□ -2.08
DDI1P40087 CUR1YPR158W 759 nt2.07□□□□□ -2.08
DDI1P40087 MBA1YBR185C 837 nt2.07□□□□□ -2.08
DDI1P40087 CBF2YGR140W 2871 nt2.06□□□□□ -2.08
DDI1P40087 RRF1YHR038W 693 nt2.06□□□□□ -2.08
DDI1P40087 PCL5YHR071W 690 nt2.06□□□□□ -2.08
DDI1P40087 RPS30AYLR287C-A 192 nt2.06□□□□□ -2.08
DDI1P40087 YPL276WYPL276W 438 nt2.06□□□□□ -2.08
DDI1P40087 KAR1YNL188W 1302 nt2.06□□□□□ -2.08
DDI1P40087 UBR1YGR184C 5853 nt2.06□□□□□ -2.08
DDI1P40087 STI1YOR027W 1770 nt2.05□□□□□ -2.08
DDI1P40087 NUP100YKL068W 2880 nt2.05□□□□□ -2.08
DDI1P40087 PSK2YOL045W 3306 nt2.05□□□□□ -2.08
DDI1P40087 NPR1YNL183C 2373 nt2.05□□□□□ -2.08
DDI1P40087 MIC19YFR011C 513 nt2.05□□□□□ -2.08
DDI1P40087 ACB1YGR037C 264 nt2.05□□□□□ -2.08
DDI1P40087 DGR1YNL130C-A 147 nt2.05□□□□□ -2.08
DDI1P40087 RPL36BYPL249C-A 303 nt2.05□□□□□ -2.08
DDI1P40087 APA1YCL050C 966 nt2.05□□□□□ -2.08
DDI1P40087 MFB1YDR219C 1398 nt2.05□□□□□ -2.08
DDI1P40087 BRE1YDL074C 2103 nt2.05□□□□□ -2.08
DDI1P40087 RGA1YOR127W 3024 nt2.04□□□□□ -2.08
DDI1P40087 SLU7YDR088C 1149 nt2.04□□□□□ -2.08
DDI1P40087 YGR053CYGR053C 852 nt2.04□□□□□ -2.08
DDI1P40087 FYV4YHR059W 393 nt2.04□□□□□ -2.08
DDI1P40087 KSP1YHR082C 3090 nt2.04□□□□□ -2.08
DDI1P40087 YIL166CYIL166C 1629 nt2.04□□□□□ -2.08
DDI1P40087 DAL5YJR152W 1632 nt2.04□□□□□ -2.08
DDI1P40087 RPS17AYML024W 411 nt2.04□□□□□ -2.08
DDI1P40087 MGM1YOR211C 2646 nt2.04□□□□□ -2.08
DDI1P40087 YPR145C-AYPR145C-A 237 nt2.04□□□□□ -2.08
DDI1P40087 FKS1YLR342W 5631 nt2.04□□□□□ -2.08
DDI1P40087 YRR1YOR162C 2433 nt2.03□□□□□ -2.08
DDI1P40087 PCK1YKR097W 1650 nt2.03□□□□□ -2.08
DDI1P40087 AFI1YOR129C 2682 nt2.03□□□□□ -2.08
DDI1P40087 YCR108CYCR108C 192 nt2.03□□□□□ -2.08
DDI1P40087 RAV2YDR202C 1056 nt2.03□□□□□ -2.08
DDI1P40087 BTN2YGR142W 1233 nt2.03□□□□□ -2.08
DDI1P40087 YHR071C-AYHR071C-A 321 nt2.03□□□□□ -2.08
DDI1P40087 TPK3YKL166C 1197 nt2.03□□□□□ -2.08
DDI1P40087 SMD2YLR275W 333 nt2.03□□□□□ -2.08
DDI1P40087 SCH9YHR205W 2475 nt2.03□□□□□ -2.08
DDI1P40087 INP53YOR109W 3324 nt2.03□□□□□ -2.08
DDI1P40087 USO1YDL058W 5373 nt2.03□□□□□ -2.08
DDI1P40087 SAP190YKR028W 3102 nt2.02□□□□□ -2.09
DDI1P40087 RRP12YPL012W 3687 nt2.02□□□□□ -2.09
DDI1P40087 NUP170YBL079W 4509 nt2.02□□□□□ -2.09
DDI1P40087 SDC1YDR469W 528 nt2.02□□□□□ -2.09
DDI1P40087 UTP30YKR060W 825 nt2.02□□□□□ -2.09
DDI1P40087 YBR062CYBR062C 543 nt2.02□□□□□ -2.09
DDI1P40087 PRP6YBR055C 2700 nt2.02□□□□□ -2.09
DDI1P40087 RAD18YCR066W 1464 nt2.01□□□□□ -2.09
DDI1P40087 BAS1YKR099W 2436 nt2.01□□□□□ -2.09
DDI1P40087 HSE1YHL002W 1359 nt2.01□□□□□ -2.09
DDI1P40087 YPR089WYPR089W 2667 nt2.01□□□□□ -2.09
DDI1P40087 MRPL32YCR003W 552 nt2.01□□□□□ -2.09
DDI1P40087 YDR203WYDR203W 318 nt2.01□□□□□ -2.09
DDI1P40087 HTB1YDR224C 396 nt2.01□□□□□ -2.09
DDI1P40087 YIR021W-AYIR021W-A 213 nt2.01□□□□□ -2.09
DDI1P40087 YJL156W-AYJL156W-A 222 nt2.01□□□□□ -2.09
DDI1P40087 POL32YJR043C 1053 nt2.01□□□□□ -2.09
DDI1P40087 GPN3YLR243W 819 nt2.01□□□□□ -2.09
DDI1P40087 MGE1YOR232W 687 nt2.01□□□□□ -2.09
DDI1P40087 GIP3YPL137C 3831 nt2.01□□□□□ -2.09
DDI1P40087 RSA1YPL193W 1146 nt2.01□□□□□ -2.09
DDI1P40087 YEL043WYEL043W 2871 nt2□□□□□ -2.09
DDI1P40087 CTF13YMR094W 1437 nt2□□□□□ -2.09
DDI1P40087 LST4YKL176C 2487 nt2□□□□□ -2.09
DDI1P40087 CLN3YAL040C 1743 nt2□□□□□ -2.09
DDI1P40087 SLS1YLR139C 1932 nt2□□□□□ -2.09
DDI1P40087 RPS17BYDR447C 411 nt2□□□□□ -2.09
DDI1P40087 RMD6YEL072W 696 nt2□□□□□ -2.09
DDI1P40087 SUI2YJR007W 915 nt2□□□□□ -2.09
DDI1P40087 YOL038C-AYOL038C-A 96 nt2□□□□□ -2.09
DDI1P40087 YBR051WYBR051W 351 nt2□□□□□ -2.09
DDI1P40087 VPS16YPL045W 2397 nt2□□□□□ -2.09
DDI1P40087 YDR179W-AYDR179W-A 1392 nt1.99□□□□□ -2.09
DDI1P40087 ATP16YDL004W 483 nt1.99□□□□□ -2.09
DDI1P40087 NSE4YDL105W 1209 nt1.99□□□□□ -2.09
DDI1P40087 YDL118WYDL118W 381 nt1.99□□□□□ -2.09
DDI1P40087 PIB1YDR313C 861 nt1.99□□□□□ -2.09
DDI1P40087 IKI1YHR187W 930 nt1.99□□□□□ -2.09
DDI1P40087 RPF2YKR081C 1035 nt1.99□□□□□ -2.09
DDI1P40087 YLR154W-AYLR154W-A 186 nt1.99□□□□□ -2.09
DDI1P40087 CIN2YPL241C 807 nt1.99□□□□□ -2.09
DDI1P40087 TOR2YKL203C 7425 nt1.99□□□□□ -2.09
DDI1P40087 SNU114YKL173W 3027 nt1.98□□□□□ -2.09
DDI1P40087 UTP5YDR398W 1932 nt1.98□□□□□ -2.09
DDI1P40087 PRE1YER012W 597 nt1.98□□□□□ -2.09
DDI1P40087 GEP7YGL057C 864 nt1.98□□□□□ -2.09
DDI1P40087 EST3YIL009C-A 546 nt1.98□□□□□ -2.09
DDI1P40087 PAU14YIL176C 363 nt1.98□□□□□ -2.09
DDI1P40087 YIR018C-AYIR018C-A 138 nt1.98□□□□□ -2.09
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 58 ms