Protein–RNA interactions for Protein: P39543

SOP4, Protein SOP4, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SOP4P39543 MSN1YOL116W 1149 nt2.2□□□□□ -2.06
SOP4P39543 SME1YOR159C 285 nt2.2□□□□□ -2.06
SOP4P39543 YBR051WYBR051W 351 nt2.2□□□□□ -2.06
SOP4P39543 YPL119C-AYPL119C-A 264 nt2.2□□□□□ -2.06
SOP4P39543 SUS1YBR111W-A 291 nt2.2□□□□□ -2.06
SOP4P39543 TAE2YPL009C 3117 nt2.2□□□□□ -2.06
SOP4P39543 Q0255Q0255 1419 nt2.19□□□□□ -2.06
SOP4P39543 DNA2YHR164C 4569 nt2.19□□□□□ -2.06
SOP4P39543 URK1YNR012W 1506 nt2.19□□□□□ -2.06
SOP4P39543 YCR013CYCR013C 648 nt2.19□□□□□ -2.06
SOP4P39543 YGR115CYGR115C 780 nt2.19□□□□□ -2.06
SOP4P39543 LIN1YHR156C 1023 nt2.19□□□□□ -2.06
SOP4P39543 YPT52YKR014C 705 nt2.19□□□□□ -2.06
SOP4P39543 YNR034W-AYNR034W-A 297 nt2.19□□□□□ -2.06
SOP4P39543 SGT1YOR057W 1188 nt2.19□□□□□ -2.06
SOP4P39543 YRO2YBR054W 1035 nt2.19□□□□□ -2.06
SOP4P39543 DAD3YBR233W-A 285 nt2.19□□□□□ -2.06
SOP4P39543 YBR287WYBR287W 1284 nt2.19□□□□□ -2.06
SOP4P39543 PUF4YGL014W 2667 nt2.19□□□□□ -2.06
SOP4P39543 AFI1YOR129C 2682 nt2.19□□□□□ -2.06
SOP4P39543 YFR016CYFR016C 3702 nt2.19□□□□□ -2.06
SOP4P39543 BNI1YNL271C 5862 nt2.18□□□□□ -2.06
SOP4P39543 YAL042C-AYAL042C-A 378 nt2.18□□□□□ -2.06
SOP4P39543 RPS16AYMR143W 432 nt2.18□□□□□ -2.06
SOP4P39543 BRX1YOL077C 876 nt2.18□□□□□ -2.06
SOP4P39543 GRX5YPL059W 453 nt2.18□□□□□ -2.06
SOP4P39543 FKS3YMR306W 5358 nt2.18□□□□□ -2.06
SOP4P39543 RLF2YPR018W 1821 nt2.18□□□□□ -2.06
SOP4P39543 SHS1YDL225W 1656 nt2.18□□□□□ -2.06
SOP4P39543 ROY1YMR258C 1662 nt2.18□□□□□ -2.06
SOP4P39543 KSP1YHR082C 3090 nt2.17□□□□□ -2.06
SOP4P39543 TRZ1YKR079C 2517 nt2.17□□□□□ -2.06
SOP4P39543 RPL27BYDR471W 411 nt2.17□□□□□ -2.06
SOP4P39543 COX3Q0275 810 nt2.17□□□□□ -2.06
SOP4P39543 YJL133C-AYJL133C-A 225 nt2.17□□□□□ -2.06
SOP4P39543 ASG7YJL170C 630 nt2.17□□□□□ -2.06
SOP4P39543 COX8YLR395C 237 nt2.17□□□□□ -2.06
SOP4P39543 MFB1YDR219C 1398 nt2.17□□□□□ -2.06
SOP4P39543 YKL075CYKL075C 1353 nt2.17□□□□□ -2.06
SOP4P39543 YPR097WYPR097W 3222 nt2.17□□□□□ -2.06
SOP4P39543 YNL018CYNL018C 1839 nt2.17□□□□□ -2.06
SOP4P39543 UFD4YKL010C 4452 nt2.17□□□□□ -2.06
SOP4P39543 SSD1YDR293C 3753 nt2.16□□□□□ -2.06
SOP4P39543 RGA1YOR127W 3024 nt2.16□□□□□ -2.06
SOP4P39543 YCT1YLL055W 1596 nt2.16□□□□□ -2.06
SOP4P39543 snR76snR76 109 nt2.16□□□□□ -2.06
SOP4P39543 MPO1YGL010W 525 nt2.16□□□□□ -2.06
SOP4P39543 YPL276WYPL276W 438 nt2.16□□□□□ -2.06
SOP4P39543 TPS2YDR074W 2691 nt2.16□□□□□ -2.06
SOP4P39543 NPR3YHL023C 3441 nt2.16□□□□□ -2.06
SOP4P39543 NPR1YNL183C 2373 nt2.15□□□□□ -2.06
SOP4P39543 YDL032WYDL032W 312 nt2.15□□□□□ -2.07
SOP4P39543 YGR050CYGR050C 357 nt2.15□□□□□ -2.07
SOP4P39543 CAP1YKL007W 807 nt2.15□□□□□ -2.07
SOP4P39543 VPS63YLR261C 327 nt2.15□□□□□ -2.07
SOP4P39543 PEP12YOR036W 867 nt2.15□□□□□ -2.07
SOP4P39543 POP7YBR167C 423 nt2.15□□□□□ -2.07
SOP4P39543 MED8YBR193C 672 nt2.15□□□□□ -2.07
SOP4P39543 ADF1YCL058W-A 342 nt2.15□□□□□ -2.07
SOP4P39543 SAP185YJL098W 3177 nt2.15□□□□□ -2.07
SOP4P39543 CTF13YMR094W 1437 nt2.15□□□□□ -2.07
SOP4P39543 MES1YGR264C 2256 nt2.15□□□□□ -2.07
SOP4P39543 VAC8YEL013W 1737 nt2.14□□□□□ -2.07
SOP4P39543 UBP2YOR124C 3819 nt2.14□□□□□ -2.07
SOP4P39543 TFC3YAL001C 3483 nt2.14□□□□□ -2.07
SOP4P39543 TMN3YER113C 2121 nt2.14□□□□□ -2.07
SOP4P39543 snR83snR83 306 nt2.14□□□□□ -2.07
SOP4P39543 GET1YGL020C 708 nt2.14□□□□□ -2.07
SOP4P39543 YGL109WYGL109W 324 nt2.14□□□□□ -2.07
SOP4P39543 TAD1YGL243W 1203 nt2.14□□□□□ -2.07
SOP4P39543 YHR050W-AYHR050W-A 171 nt2.14□□□□□ -2.07
SOP4P39543 tW(CCA)G1tW(CCA)G1 72 nt2.14□□□□□ -2.07
SOP4P39543 tW(CCA)G2tW(CCA)G2 72 nt2.14□□□□□ -2.07
SOP4P39543 tW(CCA)JtW(CCA)J 72 nt2.14□□□□□ -2.07
SOP4P39543 tW(CCA)KtW(CCA)K 72 nt2.14□□□□□ -2.07
SOP4P39543 tW(CCA)MtW(CCA)M 72 nt2.14□□□□□ -2.07
SOP4P39543 tW(CCA)PtW(CCA)P 72 nt2.14□□□□□ -2.07
SOP4P39543 YET1YKL065C 621 nt2.14□□□□□ -2.07
SOP4P39543 PRE8YML092C 753 nt2.14□□□□□ -2.07
SOP4P39543 RPL36AYMR194W 303 nt2.14□□□□□ -2.07
SOP4P39543 YOL085W-AYOL085W-A 213 nt2.14□□□□□ -2.07
SOP4P39543 SLM4YBR077C 489 nt2.14□□□□□ -2.07
SOP4P39543 PSK2YOL045W 3306 nt2.14□□□□□ -2.07
SOP4P39543 DAL5YJR152W 1632 nt2.13□□□□□ -2.07
SOP4P39543 UBX3YDL091C 1368 nt2.13□□□□□ -2.07
SOP4P39543 UBP16YPL072W 1500 nt2.13□□□□□ -2.07
SOP4P39543 ADK1YDR226W 669 nt2.13□□□□□ -2.07
SOP4P39543 GPI19YDR437W 423 nt2.13□□□□□ -2.07
SOP4P39543 YER189WYER189W 369 nt2.13□□□□□ -2.07
SOP4P39543 RGM1YMR182C 636 nt2.13□□□□□ -2.07
SOP4P39543 VMA9YCL005W-A 222 nt2.13□□□□□ -2.07
SOP4P39543 SDC25YLL016W 3147 nt2.13□□□□□ -2.07
SOP4P39543 SWR1YDR334W 4545 nt2.12□□□□□ -2.07
SOP4P39543 YDR203WYDR203W 318 nt2.12□□□□□ -2.07
SOP4P39543 TIF35YDR429C 825 nt2.12□□□□□ -2.07
SOP4P39543 YEA4YEL004W 1029 nt2.12□□□□□ -2.07
SOP4P39543 CKA1YIL035C 1119 nt2.12□□□□□ -2.07
SOP4P39543 UTP30YKR060W 825 nt2.12□□□□□ -2.07
SOP4P39543 YMR173W-AYMR173W-A 1185 nt2.12□□□□□ -2.07
SOP4P39543 CRS5YOR031W 210 nt2.12□□□□□ -2.07
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 22.3 ms