Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVX2

TMEM106C, Transmembrane protein 106C, humanhuman

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM106CQ9BVX2 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TMEM106CQ9BVX2 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TMEM106CQ9BVX2 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TMEM106CQ9BVX2 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TMEM106CQ9BVX2 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TMEM106CQ9BVX2 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TMEM106CQ9BVX2 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TMEM106CQ9BVX2 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
TMEM106CQ9BVX2 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TMEM106CQ9BVX2 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TMEM106CQ9BVX2 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TMEM106CQ9BVX2 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TMEM106CQ9BVX2 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TMEM106CQ9BVX2 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TMEM106CQ9BVX2 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TMEM106CQ9BVX2 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TMEM106CQ9BVX2 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TMEM106CQ9BVX2 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TMEM106CQ9BVX2 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TMEM106CQ9BVX2 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
TMEM106CQ9BVX2 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TMEM106CQ9BVX2 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TMEM106CQ9BVX2 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
TMEM106CQ9BVX2 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TMEM106CQ9BVX2 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
TMEM106CQ9BVX2 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
TMEM106CQ9BVX2 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TMEM106CQ9BVX2 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TMEM106CQ9BVX2 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TMEM106CQ9BVX2 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TMEM106CQ9BVX2 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TMEM106CQ9BVX2 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TMEM106CQ9BVX2 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TMEM106CQ9BVX2 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TMEM106CQ9BVX2 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TMEM106CQ9BVX2 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TMEM106CQ9BVX2 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
TMEM106CQ9BVX2 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TMEM106CQ9BVX2 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
TMEM106CQ9BVX2 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TMEM106CQ9BVX2 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TMEM106CQ9BVX2 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TMEM106CQ9BVX2 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TMEM106CQ9BVX2 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TMEM106CQ9BVX2 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TMEM106CQ9BVX2 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TMEM106CQ9BVX2 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
TMEM106CQ9BVX2 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TMEM106CQ9BVX2 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TMEM106CQ9BVX2 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TMEM106CQ9BVX2 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TMEM106CQ9BVX2 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TMEM106CQ9BVX2 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TMEM106CQ9BVX2 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
TMEM106CQ9BVX2 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
TMEM106CQ9BVX2 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TMEM106CQ9BVX2 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TMEM106CQ9BVX2 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TMEM106CQ9BVX2 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
TMEM106CQ9BVX2 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TMEM106CQ9BVX2 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TMEM106CQ9BVX2 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
TMEM106CQ9BVX2 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TMEM106CQ9BVX2 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TMEM106CQ9BVX2 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TMEM106CQ9BVX2 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TMEM106CQ9BVX2 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TMEM106CQ9BVX2 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TMEM106CQ9BVX2 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TMEM106CQ9BVX2 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TMEM106CQ9BVX2 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TMEM106CQ9BVX2 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TMEM106CQ9BVX2 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TMEM106CQ9BVX2 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TMEM106CQ9BVX2 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TMEM106CQ9BVX2 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
TMEM106CQ9BVX2 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TMEM106CQ9BVX2 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TMEM106CQ9BVX2 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
TMEM106CQ9BVX2 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TMEM106CQ9BVX2 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TMEM106CQ9BVX2 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TMEM106CQ9BVX2 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TMEM106CQ9BVX2 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TMEM106CQ9BVX2 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TMEM106CQ9BVX2 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
TMEM106CQ9BVX2 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TMEM106CQ9BVX2 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TMEM106CQ9BVX2 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TMEM106CQ9BVX2 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TMEM106CQ9BVX2 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TMEM106CQ9BVX2 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TMEM106CQ9BVX2 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
TMEM106CQ9BVX2 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TMEM106CQ9BVX2 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TMEM106CQ9BVX2 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TMEM106CQ9BVX2 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TMEM106CQ9BVX2 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TMEM106CQ9BVX2 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TMEM106CQ9BVX2 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms