Protein–RNA interactions for Protein: Q96BQ3

TRIM43, Tripartite motif-containing protein 43, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM43Q96BQ3 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRIM43Q96BQ3 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRIM43Q96BQ3 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRIM43Q96BQ3 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRIM43Q96BQ3 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
TRIM43Q96BQ3 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRIM43Q96BQ3 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRIM43Q96BQ3 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRIM43Q96BQ3 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRIM43Q96BQ3 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRIM43Q96BQ3 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRIM43Q96BQ3 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRIM43Q96BQ3 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRIM43Q96BQ3 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRIM43Q96BQ3 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRIM43Q96BQ3 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRIM43Q96BQ3 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRIM43Q96BQ3 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRIM43Q96BQ3 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRIM43Q96BQ3 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRIM43Q96BQ3 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRIM43Q96BQ3 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRIM43Q96BQ3 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRIM43Q96BQ3 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRIM43Q96BQ3 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRIM43Q96BQ3 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRIM43Q96BQ3 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRIM43Q96BQ3 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
TRIM43Q96BQ3 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRIM43Q96BQ3 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRIM43Q96BQ3 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRIM43Q96BQ3 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRIM43Q96BQ3 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRIM43Q96BQ3 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRIM43Q96BQ3 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRIM43Q96BQ3 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRIM43Q96BQ3 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRIM43Q96BQ3 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRIM43Q96BQ3 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRIM43Q96BQ3 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRIM43Q96BQ3 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRIM43Q96BQ3 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRIM43Q96BQ3 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRIM43Q96BQ3 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRIM43Q96BQ3 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRIM43Q96BQ3 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRIM43Q96BQ3 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRIM43Q96BQ3 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRIM43Q96BQ3 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRIM43Q96BQ3 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRIM43Q96BQ3 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRIM43Q96BQ3 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRIM43Q96BQ3 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRIM43Q96BQ3 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRIM43Q96BQ3 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRIM43Q96BQ3 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRIM43Q96BQ3 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TRIM43Q96BQ3 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TRIM43Q96BQ3 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TRIM43Q96BQ3 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TRIM43Q96BQ3 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
TRIM43Q96BQ3 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TRIM43Q96BQ3 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TRIM43Q96BQ3 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TRIM43Q96BQ3 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TRIM43Q96BQ3 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
TRIM43Q96BQ3 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRIM43Q96BQ3 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRIM43Q96BQ3 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRIM43Q96BQ3 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRIM43Q96BQ3 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRIM43Q96BQ3 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRIM43Q96BQ3 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
TRIM43Q96BQ3 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRIM43Q96BQ3 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRIM43Q96BQ3 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRIM43Q96BQ3 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRIM43Q96BQ3 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRIM43Q96BQ3 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRIM43Q96BQ3 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRIM43Q96BQ3 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRIM43Q96BQ3 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRIM43Q96BQ3 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRIM43Q96BQ3 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRIM43Q96BQ3 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRIM43Q96BQ3 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
TRIM43Q96BQ3 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRIM43Q96BQ3 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRIM43Q96BQ3 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRIM43Q96BQ3 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRIM43Q96BQ3 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRIM43Q96BQ3 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRIM43Q96BQ3 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRIM43Q96BQ3 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRIM43Q96BQ3 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRIM43Q96BQ3 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRIM43Q96BQ3 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
TRIM43Q96BQ3 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRIM43Q96BQ3 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRIM43Q96BQ3 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.2 ms