Protein–RNA interactions for Protein: Q15572

TAF1C, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 869 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1CQ15572 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TAF1CQ15572 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
TAF1CQ15572 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TAF1CQ15572 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TAF1CQ15572 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TAF1CQ15572 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TAF1CQ15572 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TAF1CQ15572 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TAF1CQ15572 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TAF1CQ15572 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TAF1CQ15572 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TAF1CQ15572 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TAF1CQ15572 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TAF1CQ15572 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TAF1CQ15572 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TAF1CQ15572 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TAF1CQ15572 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TAF1CQ15572 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TAF1CQ15572 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TAF1CQ15572 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TAF1CQ15572 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TAF1CQ15572 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TAF1CQ15572 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TAF1CQ15572 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TAF1CQ15572 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
TAF1CQ15572 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TAF1CQ15572 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TAF1CQ15572 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TAF1CQ15572 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TAF1CQ15572 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TAF1CQ15572 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TAF1CQ15572 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TAF1CQ15572 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TAF1CQ15572 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TAF1CQ15572 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TAF1CQ15572 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TAF1CQ15572 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TAF1CQ15572 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
TAF1CQ15572 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TAF1CQ15572 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
TAF1CQ15572 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TAF1CQ15572 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TAF1CQ15572 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TAF1CQ15572 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TAF1CQ15572 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TAF1CQ15572 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TAF1CQ15572 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TAF1CQ15572 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TAF1CQ15572 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TAF1CQ15572 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TAF1CQ15572 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TAF1CQ15572 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TAF1CQ15572 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TAF1CQ15572 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TAF1CQ15572 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TAF1CQ15572 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TAF1CQ15572 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TAF1CQ15572 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
TAF1CQ15572 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TAF1CQ15572 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TAF1CQ15572 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TAF1CQ15572 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TAF1CQ15572 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TAF1CQ15572 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TAF1CQ15572 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TAF1CQ15572 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
TAF1CQ15572 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TAF1CQ15572 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TAF1CQ15572 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TAF1CQ15572 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TAF1CQ15572 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TAF1CQ15572 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TAF1CQ15572 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TAF1CQ15572 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TAF1CQ15572 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
TAF1CQ15572 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TAF1CQ15572 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TAF1CQ15572 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TAF1CQ15572 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TAF1CQ15572 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TAF1CQ15572 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TAF1CQ15572 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TAF1CQ15572 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TAF1CQ15572 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TAF1CQ15572 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TAF1CQ15572 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TAF1CQ15572 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TAF1CQ15572 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TAF1CQ15572 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TAF1CQ15572 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TAF1CQ15572 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TAF1CQ15572 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TAF1CQ15572 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TAF1CQ15572 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TAF1CQ15572 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TAF1CQ15572 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TAF1CQ15572 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TAF1CQ15572 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TAF1CQ15572 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TAF1CQ15572 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
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